病原体-宏基因组测序:1.开发了一种经过验证的临床mNGS检测方法,用于在许可的微生物实验室中诊断脑脊髓液(CSF)引起的脑膜炎和脑炎的传染原因。2.开发了定制的生物信息学管道SURPI+,以快速分析...
近年来,随着测序技术的发展,对微生物群(微生物组)的研究逐渐加深,研究热点越来越多集中于环境和生物体相互作用的微生物群。加之测序成本降低,分析技术不断提升,都使得宏基因组测序技术得到普遍应用。为什么要...
在未知传染病的病原体检测方面,传统的体液培养等检测方式整体效率、阳性率低下,PCR检测也局限于已知的病原微生物基因序列,能够准确分析病原体并能够高通量测序的mNGS具有强大的优势。mNGS的这两大优势...
微生物鉴定可以用微生物对噬菌体的敏感性作为指标来鉴定微生物的种属。因为各种噬菌体都有其严格的宿主范围,不同的细菌作为噬菌体的宿主对应有特定的已知特性的噬菌体,其和噬菌体的作用方式也有接合,转化,转接,...
病毒研究的发展常常与病毒培养和检测方法的进步有密切的关系,特别在脊椎动物病毒方面,小鼠和鸡胚接种、组织培养、超速离心、凝胶电泳、电子显微镜和免疫测定等技术,对病毒学的发展具有深刻的影响。 噬菌体的培养...
传统病原微生物检测方法-核酸杂交法。起初应用于微生物检测的分子生物学技术是基因探针方法,它是用带有同位素标记或非同位素标记的DNA或RN段来检测样本中某一特定微生物核苷酸的方法。核酸杂交有原位杂交、打...
目前对我国首例输入性裂谷热病例病毒进行全基因组测定,分析其进化来源及潜在变异.方法 提取样本核酸,非特异性反转录扩增病毒基因组RNA,使用Ion Torrent二代测序仪进行病毒全基因组测定.对获得的...
测序深度,测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小(Genome)的比值,它是评价测序量的指标之一。测序深度(Sequencing Depth):测序得到的碱基总量(bp)与基因组大小(Genome)的...
在探普生物长时间运行过程中,我们接触到的对病毒的全基因组进行测序项目有比较丰富的应用场景。先,从事基因进化/疫苗/药品/抗体研制方向的研究的研究者一定会用到测序。这种场景一般是用密集的sanger测序...
深度测序技术对社会的影响:深度测序技术促进了基因检测的普及,对社会的影响第1个方面反映在商业模式的变化,即医学检验和健康管理方面的平民化、个性化趋势的形成。社会生活受到深度测序技术影响的第二个方面是基...
未培养病毒基因组的信息标准:①关于未培养病毒基因组标准的信息是在基因组标准框架内制定的,包括病毒起源、基因组质量、基因组注释、分类信息、生物地理分布和宿主预测;②UViGs有助于提高我们对病毒进化历史...
宏基因组有广义和狭义两种概念。广义的概念是指所有可能与人的生活密切相关的微生物的基因组,包括长期共生在体内的微生物,也包括可以进入体内,对人类的生活造成不同形式的影响的微生物。而狭义的宏基因组是*指长...