二代测序——蛋白质甲基化 概念及位置:蛋白质甲基化是指在蛋白质的氨基酸残基上添加甲基基团。常见的甲基化修饰位点包括精氨酸(Arg)和赖氨酸(Lys)残基。 作用 1、调节蛋白质 - 蛋白质相互作用:例如,组蛋白(染色体的组成成分)的甲基化可以改变染色质的结构和功能,影响基因的可及性。当组蛋白 H3 的赖氨酸残基(如 ...
查看详细 >>二代测序的建库步骤① 一、样本准备 样本采集:根据研究目的采**适的样本,如血液、组织、细胞等。例如,在**研究中,可能会采集**组织和对应的正常组织。对于血液样本,一般采用静脉穿刺采集外周血,收集在含有抗凝剂(如EDTA)的**管中,以防止血液凝固。组织样本则需要在合适的条件下尽快处理,以保持核酸的完整性。如果是新鲜组织...
查看详细 >>二代测序技术的一些***研究进展② 植物基因组学研究领域 : 花生四倍体野生种基因组测序:河南农业大学殷冬梅教授团队和上海交通大学韦朝春教授团队联合发布了花生四倍体野生种近乎完整基因组 amon2.0 版本。该研究结合 ONT 超长读段、二代测序和 Hi-C 等多种测序技术,使基因组的连续性、完整性和准确性都得到了显著提高...
查看详细 >>二代测序——转录组测序的实验流程(下) 测序 根据研究需求和预算选择合适的测序平台,如 Illumina 测序平台。它的测序原理主要是边合成边测序(SBS)。在测序过程中,dNTP(脱氧核糖核苷三磷酸)带有不同颜色的荧光标记,当新的 dNTP 加入到正在合成的 DNA 链时,通过检测荧光信号来确定碱基类型,从而读取 cDN...
查看详细 >>④二代测序一般多久出结果? 4、数据分析的复杂程度 数据分析是二代测序的重要环节。简单的分析,如检测已知的单核苷酸多态性(SNP),可以通过与参考基因组比对后利用一些成熟的软件快速完成。但如果是进行复杂的分析,如寻找新的基因融合事件、复杂结构变异的检测或者进行从头组装(denovoassembly),则需要更复杂的算法和更...
查看详细 >>二代测序技术在不同人群中的准确性有何差异① **患者 优势:对于**患者,二代测序技术准确性相对较高,在**的诊断、***及监测等方面应用***。比如肺*患者,通过检测**组织或血液中的基因突变,可准确找到如EGFR、ALK等驱动基因突变,为靶向***提供依据,其准确率通常在90%以上。在软组织**中,二代测序能检测到**...
查看详细 >>二代测序——转录组测序的实验流程(上) 样本采集和 RNA 提取 样本采集需要考虑研究目的和样本类型。例如,研究**组织的转录组,就要准确获取**组织样本,同时比较好有对应的正常组织作为对照。RNA 提取方法有多种,常用的如 Trizol 法,它可以有效地从细胞或组织中提取总 RNA,包括 mRNA、rRNA 和 tRNA...
查看详细 >>二代测序技术在不同人群中的准确性有何差异① **患者 优势:对于**患者,二代测序技术准确性相对较高,在**的诊断、***及监测等方面应用***。比如肺*患者,通过检测**组织或血液中的基因突变,可准确找到如EGFR、ALK等驱动基因突变,为靶向***提供依据,其准确率通常在90%以上。在软组织**中,二代测序能检测到**...
查看详细 >>二代测序——甲基化的作用和检测方法有哪些? 作用 基因表达调控:DNA 甲基化通常与基因沉默有关。例如,在**发生过程中,某些抑*基因的启动子区域(调控基因转录起始的 DNA 序列)可能会发生高甲基化,导致这些基因无法正常表达,从而失去对肿瘤细胞生长的抑制作用。 发育调控:在胚胎发育过程中,DNA 甲基化模式的动态变...
查看详细 >>二代测序的建库步骤⑤ 五、文库富集(可选步骤) PCR富集:对于一些起始样本量较少或者连接效率较低的情况,可能需要进行PCR富集。利用与接头序列互补的引物进行PCR扩增,增加文库中目标DNA片段的数量。在PCR反应中,需要注意引物的设计要与接头序列准确匹配,并且要优化PCR循环数,避免过度扩增导致文库多样性降低或引入PCR...
查看详细 >>二代测序—全外显子测序的应用领域 医学领域:1、疾病诊断:用于诊断各种遗传性疾病,包括单基因遗传病(如囊性纤维化、杜氏肌营养不良等)和复杂疾病(如**、心血管疾病等)。在**研究中,通过对**组织和正常组织进行全外显子测序,可以发现肿瘤细胞中的体细胞突变,这些突变可能是导致**发生、发展的关键因素,有助于医生制定个性化的治疗方案...
查看详细 >>二代测序——基因组测序该测几个G?② 人类全外显子组测序 人类全外显子组*占基因组的1%-2%,大小约为30M-60M左右,但通常需要较高的测序深度来确保外显子区域的变异检测准确性,一般测序深度在100X-200X之间,数据量大约在3G-12G左右。全外显子组测序主要关注编码蛋白质的外显子区域,能够高效地检测出与疾病相关的...
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