秸秆是一种主要的稻田有机原料。依靠秸秆碳生长的微生物尚未得到很好的研究。有学者利用13C标记的秸秆应用于淹没的水稻进行土壤微宇宙，并分析土壤和渗滤水中的磷脂脂肪酸（PLFA），以追踪秸秆碳如何被微生物的同化。在培养的第3天，土壤和水中的PLFA明显富含13C，这表明秸秆来源的碳立即结合到微生物生物量中。渗滤水中也富集13C标记的PLFA，这一结果表明，除了定居在秸秆上的微生物群落外，可能还有其他的微生物也吸收了秸秆来源的碳。根据PLFA的碳13同位素数据，微生物种群可分为两个群落：依靠秸秆碳的微生物群落和依靠土壤有机质的微生物群落。两个群落的PLFA组成不同，这表明稻草来源的碳被一部分微生物种群同化。渗透水中秸秆来源的PLFA的组成也与依靠土壤有机质的PLFA有所不同。稳定同位素标记秸秆制备成生物质炭，并研究其稳定性。河北小麦C13同位素标记秸秆购买
除了C13标记的同位素秸秆，15N标记秸秆在科研中也有广泛应用。每年农田产生大量秸秆，其中含有大量氮、磷等营养元素。合理利用秸秆对减少氮肥施用和降低环境污染意义重大。试验采用15N同位素标记秸秆，在下位砂姜土和红壤上进行了试验。试验结果表明秸秆在下位砂姜土（高肥力）上的当季利用率为33.53%，留在土壤中残留率为60.49%；在红壤（低肥力）中当季利用率为23.35%，残留率为42.42%。研究结果表明秸秆还在高肥力土壤上有更高的利用率和残留率。北京同位素标记秸秆功能是什么同位素与普通元素及其化合物之间的化学性质和生物学性质是相同的，只是具有不同的核物理性质。
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秸秆还田是我国的一项基本农业措施，我们可以利用利用同位素标记法来确定秸秆养分释放规律，从而确定秸秆还田的条件下氮肥和钾肥的施用量。利用同位素标记法研究秸秆养分释放规律发现，经过三年的试验研究得出，在连续的秸秆还田条件下，每公顷土地施用的纯氮量可以减少10公斤，土壤有机质增加0.8%，土壤容重降低0.9%，经过连续的秸秆还田后，土壤的肥力增加了，通透性也更好了。结合耕地质量平均提高0.5个等级，土壤有机质含量平均提高0.05个百分点以上。利用稳定同位素秸秆研究秸秆激发效应。
15N同位素标记生物炭研究生物炭中氮元素的生物有效性。生物炭是秸秆在无氧或缺氧条件下高温裂解形成的高含碳物质。生物炭也称为生物质炭（biochar），黑碳（blackcarbon）。生物炭中含有大量氮，其有效性深受关注。试验采用15N标记秸秆制成15N标记生物炭，生物炭中15N丰度为7.88%。研究结果表明生物炭中的氮在红壤中的有效性为0.67%，在下位砂姜土中为1.50%.生物炭处理中氮肥在红壤中的利用率为18.75%，在下位砂姜土中为33.77%，分别低于不施生物炭的24.32%和41.74%。13C标记的秸秆可以用于研究降解秸秆的微生物群落。黑龙江水稻同位素标记秸秆技术的应用
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本秸秆采用连续同位素标记技术生产。目前秸秆同位素标记技术主要有连续标记技术和脉冲标记技术。在连续标记技术发明前，一般都采用脉冲标记技术。目前世界上只有3家左右公司掌握连续标记技术。在国内智融联科技掌握连续标记技术前，国内用的材料大多进口，每克达数万元，严重影响国内科学研究。从2004年开始，国内开始连续同位素标记技术研发，直到2009年初步研发成功。到2018年开始生产。当国外公司国内代理告诉国外公司后，同位素标记秸秆价格大幅降低，促进了国内科研进展。脉冲标记的秸秆，由于在标记过程中是不连续的，植物体内同位素的分配是不均匀的，这样研究结果可能会出现偏差。连续标记秸秆是从幼苗开始就采用设定的丰度来标记秸秆，而且没有其他干扰，这样标记出来的秸秆，其体内各部分的分配是均匀的，做试验时产生偏差的几率几乎为零，确保试验取得预期结果。河北小麦C13同位素标记秸秆购买
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