建议与腐熟的有机肥或质量的含腐植酸水溶肥料如宜冲旺等产品配合施用。因为这类肥料为微生物的增殖提供了充足的质量营养。需要注意的是，千万不要与未腐熟有机肥一起混用，因为未腐熟有机肥在土壤中继续腐熟会产生极高的温度造成微生物的死亡。一般情况下土壤pH值在6.5-7.5之间时较适合微生物的繁殖，农户可根据自己土壤的情况加以改造，若土壤偏酸，则建议施用石灰、白云石或牡蛎壳粉、贝壳粉类、硅肥等调酸土壤调理剂，其中以质量的牡蛎壳粉产品如富泰威特贝钙更佳，因其调酸不板结，且富含多种养分及生理活性物质，亦可促进微生物菌群的增殖。若土壤偏碱，则建议施用富泰威颗粒硫或农新禾丰硫，可迅速降低土壤pH。科学研究发现，没有有机质，就没有肥沃的土壤。有机质对农作物是极其重要的，是农作物的重要营养来源。北京口碑好微生物菌剂售后保障
调控环境促进微生物菌剂的增殖——温、光、水、肥、pH；在适宜的温度下施用：一般微生物菌剂在地温为18-25℃时使用较好，此时菌剂中的活菌生命活动较为活跃，低于5℃或高于40℃施用效果较差，因此建议在早上或傍晚施用。尽量不在强光下施用，因为紫外线会对微生物有伤害；一般微生物菌肥较适的土壤相对含水量是60%-70%左右，水分过多或过少都不利于生物菌的生存。这种含水量的土壤，一般手捏成团，扔在地上约有一半散开，手上有湿印和凉感。注意避免在土壤干旱的条件下施用。中国台湾低价微生物菌剂技术指导微生物在土壤中物质和能量的输入输出中扮演着非常重要的角色.
微生物菌剂的使用时机取决于具体的应用场景。一般来说，可以在植物生长的不同阶段使用微生物菌剂。例如，在播种前或移栽后施用微生物菌剂可以促进种子发芽和植物生根；在植物生长期间定期施用微生物菌剂可以增加养分供应和促进植物生长；在植物受到逆境胁迫时使用微生物菌剂可以增强植物的抗逆性。总之，微生物菌剂是一种重要的土壤修复和植物生长促进剂。通过选择合适的微生物菌种、培养和繁殖微生物，并将其制成微生物菌剂，可以改善土壤环境、促进植物生根和提高植物生长。在实际应用中，需要根据具体情况选择使用时机和方法，以达到好的效果。
选择质量合格，过期不能用。菌肥必须保存在低温（较适温度4～10℃）、阴凉、通风、避光处，以免失效。有的菌种需要特定的温度范围，如哈茨木霉菌需要保存在2-8℃的恒温箱内，有效期为一年，而一些芽孢杆菌要根据生产质量高低，主要是看芽孢化水平，芽孢化高的能保存一年半甚至更久，芽孢化不好的达不到半年就失效，所以菜农应谨慎选择菌肥产品。根据菌种特性，选择使用方法。建议大家在使用生物菌肥的时候，基施可用方法有：撒施、沟施、穴施，也可以撒施一部分，剩余部分可以穴施效果更佳。不建议冲施生物菌肥，这样效果不佳，但是可以灌根，主要针对液体生物菌肥。尽量减少微生物死亡。施用过程中应避免阳光直射；蘸根时加水要适量，使根系完全吸附。蘸根后要及时定植、覆土，且不可与农药、化肥混合施用，特别是现在很多菜农为防治根茎部病害，使用农药灌根，如多菌灵、恶霉灵、硫酸铜等药剂，***、细菌都能防治，但对菌肥中的有益菌也有杀灭作用，所以建议使用菌肥后不要再用农药灌根。微生物菌剂恰当使用可提高农产品产量、改善农产品品质、减少化肥用量、降低成本、改良土壤、保护生态环境。
定植穴施或沟施穴施为佳，均匀混拌麦麸、碎磨稻糠、豆粕等有机质，若少量添加玉米粉、黄豆粉尤佳（为避免豆粕等有机质烧苗，尽量使用腐熟过的，并添加晒干的泥土）。施入后及时覆土。微生物菌剂为什么穴施效果比较好？作物的生长离不开营养，而作物叶片光合作用供给的营养只占很少一部分，大部分的营养供给都是来自于作物的根系吸收。所以保证根系的生长及根系周围土壤环境健康是十分有必要的。只有保证了根系周围土壤环境营养丰富，有机质充足，就能保证根系很好地生长，为作物提供全生长周期的营养需求。混拌底肥、有机质旋耕进土下若靠前次使用微生物菌剂，建议加倍用量，旋耕下底肥时使用。这是为什么呢？因为长期使用化肥的土壤，比如连作三年以上的土壤，土壤营养平衡一般就会被打破，常年使用的就会发生一系列土壤问题，严重危害了作物的质量和产量。健康的土壤中包括45%左右的矿物质、25%左右的空气、25%左右的水、5%左右的有机质和1%左右的微生物。吉林经济型微生物菌剂制造商
作物在定植后易出现烧苗、闪苗、沤根现象，引发枯萎病、疫霉根腐病、腐霉根腐病、茎基腐病、青枯病等病害。北京口碑好微生物菌剂售后保障
习惯与化学农药混用降低活性微生物菌剂中含有活菌成分，将微生物菌剂与杀细菌药剂混合使用且长时间放置，极易影响菌的活性，造成部分菌死亡。轻视使用量，用量不足，效果打折扣使用微生物菌剂能取得好的效果，前提是要用足量。土壤中的微生物种类繁多，数量巨大，接种的外来有益菌要形成优势菌群，需要经历来自环境的考验和土壤原有微生物的竞争，为了促进有益菌的繁殖需要人为创造有利于有益菌生长的条件，如改良酸化土壤，调整土壤酸碱度，增施有机肥，提高土壤物理肥力，增加微生物菌的数量等。使用方法和时间掌握不当微生物菌剂使用方式灵活多样，液体菌剂可以用来拌种、浸种、喷施、蘸根、灌根；固体菌剂可以用来拌种、蘸根、混播、混施。北京口碑好微生物菌剂售后保障
