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秸秆是一种主要的稻田有机原料。依靠秸秆碳生长的微生物尚未得到很好的研究。有学者利用13C标记的秸秆应用于淹没的水稻进行土壤微宇宙，并分析土壤和渗滤水中的磷脂脂肪酸（PLFA），以追踪秸秆碳如何被微生物的同化。在培养的第3天，土壤和水中的PLFA明显富含13C，这表明秸秆来源的碳立即结合到微生物生物量中。渗滤水中也富集13C标记的PLFA，这一结果表明，除了定居在秸秆上的微生物群落外，可能还有其他的微生物也吸收了秸秆来源的碳。根据PLFA的碳13同位素数据，微生物种群可分为两个群落：依靠秸秆碳的微生物群落和依靠土壤有机质的微生物群落。两个群落的PLFA组成不同，这表明稻草来源的碳被一部分微生物种群同化。渗透水中秸秆来源的PLFA的组成也与依靠土壤有机质的PLFA有所不同。上海同位素标记秸秆稳定性同位素（如13C和15N）标记的植物秸秆在环境科学、农业、生态学和土壤科学等领域均有应用。
秸秆还田是我国的一项基本农业措施，我们可以利用利用同位素标记法来确定秸秆养分释放规律，从而确定秸秆还田的条件下氮肥和钾肥的施用量。利用同位素标记法研究秸秆养分释放规律发现，经过三年的试验研究得出，在连续的秸秆还田条件下，每公顷土地施用的纯氮量可以减少10公斤，土壤有机质增加0.8%，土壤容重降低0.9%，经过连续的秸秆还田后，土壤的肥力增加了，通透性也更好了。结合耕地质量平均提高0.5个等级，土壤有机质含量平均提高0.05个百分点以上。
目前市场上流行的大部分同位素标记方法以土壤为培养基质，由于土壤本身含有大量的普通碳原子(12c)，通过微生物呼吸作用，这些碳原子会以12c-co2形态大量释放到空气中被植物吸收利用，导致被标记的植物样品的13c丰度降低。在研究作物秸秆分解过程中，低丰度的同位素植物样品无法实现在分子水平上(如dna水平)对碳原子进行示踪；此外，以土壤为培养基质进行15n标记时，土壤中大量的普通氮原子(14n)也会被植物吸收，造成植物体15n丰度过低。因此，选择适当的培养方式是获得高丰度同位素碳、氮双标记植物样品的前提条件。本产品的C13标记秸秆是在水培条件下生产的，可以保障标记的准确性。此外秸秆在标记过程中利用控制系统与外界环境保持一致，具有更好的代表性。监测秸秆分解过程，同位素标记助力理解土壤碳储存。
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追踪秸秆在土壤中的空间分布，标记秸秆助力精细农业。安徽同位素标记秸秆培养方法
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