不同作物种类、同一种类作物的不同品种对养分的需要量及其比例、养分的需要时期、对肥料的忍耐程度等均不同，因此在施肥时应充分考虑每一种作物需肥规律，制定合理的施肥方案。需肥期长、需肥量大的类型这种类型的蔬菜，初期生长缓慢，中后期生长迅速，从根或果实的肥大期至收获期，需要提供大量养分，能维持旺盛的长势。西瓜、南瓜、萝卜等生育期长的蔬菜，大都属于这种类型。这些蔬菜的前半期，只能看到微弱的生长，一旦进入成熟后期，活力增大，像秋天的水稻一样旺盛生长。从养分需求来看，前期养分需要量少，所以基肥选用有机肥特别要求氮含量不要太高，应重在作物生长后期多追肥，尤其是氮肥，但由于作物枝叶繁茂，后期不便施有机肥料。因此，有机肥比较好还是作为基肥，施在离根较远的地方，或是作为基肥进行深施。为了提髙其肥效，有机肥料应集中施用，减少土壤对效果好态磷的固定。宁夏通常有机肥技术指导
通过增施有机肥，就把这一问题解决好了，通过有机肥替代化肥，使农牧结合更紧密，把畜禽粪污利用起来，也使农产品质量提升了，是一举多得的好事儿。推广有机肥是落实科学发展观、建设社会主义新农村的重大战略举措，是促进农业增产、农民增收的重要措施，是提高农产品品质、增强市场竞争力的重要环节，是发展循环经济建设节约型社会的重大行动，是减少污染、培肥地力、提高农业综合生产能力的治本措施，是降低生产成本、促进农民节本增收的重要途径。山东功能性有机肥促进根系的生长，增强根系活力，提高作物耐涝能力。
有机肥具有吸热、增温功能，有利于果树根系萌芽和生长。有机肥在分解的过程中会释放出一定的热量，提高土壤的温度，同时，有机肥热容量较大，保温性能好，不易受外界冷热变化的影响，冬天防冻，夏天防暑，这对于果树根系萌芽、生长和越冬非常有利。土壤有机质是泛指土壤中来源于生命的物质。土壤有机质是土壤固相部分的重要组成成分，是植物营养的主要来源之一，能促进植物的生长发育，改善土壤的物理性质，促进微生物和土壤生物的活动，促进土壤中营养元素的分解，提高土壤的保肥性和缓冲性的作用。
有机肥料中的腐殖质含有脂、蜡和树脂，由于在具有较高肥力的土壤成土过程中，这些物质能浸润土壤团块，使其具有疏水性，减弱土壤浸湿过程和毛管水的移动速度，使土壤水分的蒸发量减少和土壤持水能力增强，因而改善了土壤水分状况。
研究腐殖质亲水性和疏水性的结果表明，它们是由胡敏酸分子边缘上侧链决定的，当胡敏酸分子的聚合度较小时，其侧链基团的量露程度较大，它们之间存在着反比关系，腐殖质物质与水分子的关系，在一定程度上决定着有机物质的水分性质。
团粒结构与土壤有机质含量和施用的有机肥料数量有关，水稳性团粒结构能保证土壤表层的疏松性，利于土壤透水。这种结构的特点是团聚体疏松，非毛管孔隙度大，因而能减低土壤中水分毛管运动的高度和速度，减少土壤表面水分蒸发。团粒性结构较好的土壤颗粒结构半径较其差的土壤颗粒结构半径为大，而毛管水上升运动速度与结构单位的半径成反比。
靠施大化肥保产量，靠施有机肥养地。
严格遵守配方比例施用。宣传有机肥对农作物生长有利的科技知识，合理的将生物菌肥与农家有机肥、矿物肥、化肥相配合，坚持按“四类一体”配方平衡施肥技术，并按作物生长期营养需求指导施肥，实践证明：以生物菌肥1-2%、有机质肥50-60％、中微量元素肥10-20％、氮磷钾大量元素肥30-40％的配合比例比较好，增产效果能明显提高20-30％。由此可见，合理应用生物有机菌肥是现代有机农业发展的必然趋势。
充分腐熟发酵后再施用。有机生物肥料，能活化土壤、改良土壤，增强农作物的抗病、抗虫、抗灾能力，能提高作物品质和增产量。但自然界中的禽畜栏、人畜粪肥及饼粕类等有机肥必须要充分腐熟发酵后再施用。经过发酵后，一是均衡了有机肥中的酸性，减少了硝酸盐含量，补充了水分，有利与自然界土壤中微生物菌的组合应用；二是发酵后能杀灭原粪肥中寄生虫卵、有害生物病菌等直接给作物和土壤带来的病菌与危害。
有机肥可就地取材、就地施用，来源广、成本低。重庆原产地有机肥市场报价
有机肥还可使土壤变得疏松，改善作物根系的生态环境。宁夏通常有机肥技术指导
秸秆还田已经是普遍推广的增加土壤有机质的农业措施，秸秆有机质含量很高，接近90%，但绝大部分有机质都是纤维素。秸秆还田一二年后，经过土壤微生物腐解，其实**终能留在土壤中的有机质不会超过15%，绝大部分以二氧化碳的形式散失到空气中了。
我国规定，商品生物有机肥料的有机质含量要大于40%。为什么是40%？而不是60%、80%？科学研究表明，一般有机原料经过腐熟后，有机质含量应该在35％-45％之间，过小，说明原料纯度不够，其中掺入了沙子、粘土等过多杂质，过大，说明腐熟不彻底。
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