目前对我国首例输入性裂谷热病例病毒进行全基因组测定,分析其进化来源及潜在变异.方法提取样本核酸,非特异性反转录扩增病毒基因组RNA,使用IonTorrent二代测序仪进行病毒全基因组测定.对获得的基因组数据进行序列拼接、比对、进化树构建和关键位点分析.结果通过测定获得了病毒全基因组11979nt,该测定病毒属E基因分支,序列与先前南非分离株Kakamas相似度较高(>98%).病毒Gn蛋白C端信号肽区存在1个氨基酸突变.结论本研究分析测定的裂谷热病毒全基因组与目前非洲流行株高度相似,病毒基因特征未出现明显变异。全基因组测序覆盖面广。病毒二代测序分析技术
病毒全基因组测序,高通量测序技术的发展在生物信息学分析方面,通过新的分析软件的研发和原有分析软件的升级,对测序所得数据的分析也变得更加可靠;除此之外,伴随着BasSpace等服务的出现,进行数据分析工作所需的设备成本也在逐步降低。将来,伴随着高通量测序技术与数据分析技术的不断进步,测序精度与可靠性的上升,测序与数据分析成本的下降,高通量测序技术会在各个领域得到应用。在病原微生物检测和鉴定应用中,高通量测序技术势必会成为不可或缺的技术并发挥越来越重要的作用。高通量测序实验足够灵敏和完善,方能获得准确、可信任的结果。国内病毒全基因组测序突变分析方法病毒株都需要获得尽量完整的基因组序列来指导下一步的研究。
对病毒的全基因组进行测序费用合理,上海探普生物科技有限公司致力于医药、保养,以科技创新实现管理的追求。探普生物拥有一支经验丰富、技术创新的专业研发团队,以高度的专注和执着为客户提供病毒测序,病毒全基因组测序,病毒宏基因组测序,未知病原鉴定。探普生物继续坚定不移地走高质量发展道路,既要实现基本面稳定增长,又要聚焦关键领域,实现转型再突破。探普生物始终关注医药、保养市场,以敏锐的市场洞察力,实现与客户的成长共赢。
深度测序技术对经济市场的影响:未来社会的创新驱动将由信息技术向心理社会健康方面转移。可以预见,全球老年化社会到来后的经济主战场将是健康行业,而以基因测序预测健康和临床准确分型的市场将会越来越大。深度测序相关的经济市场有两个方面。一是测序仪器和技术相关的市场,二是测序应用市场的竞争。一个显见的例子是,近年来深度测序技术促进了对肺病的进一步认识和分型,更多的位点突变如ALK、ERCC1、MET、PI3K、RRM1等被陆续发现,多基因检测肺病致病驱动基因对医生准确选择靶向药物十分重要。以肺病中常见的EGFR突变型为例,对于敏感性基因突变(19Del+L858R),第1代靶向药物(如易瑞沙等)可以进行良好的调整和控制;但是对于耐药性基因突变(T790M),则需要第三代靶向药物(AZD9291)才有较好的临床效果。不久的将来,病症患者将获得更具个性化的药物,从而达到准确医疗。高通量测序能否定向检测细菌病毒等微生物?
哪些应用场景需要对病毒的全基因组进行测序?在探普生物长时间运行过程中,我们接触到的对病毒的全基因组进行测序项目有比较丰富的应用场景。先,从事基因进化/疫苗/药品/抗体研制方向的研究的研究者一定会用到测序。这种场景一般是用密集的sanger测序监测某几个关键基因,搭载一定频率的全基因组测序。这样的组合省时省力省经费,同时能达到研究目的。此外,有的单位需要对传染病的病原进行流行病学监测和研究,如疾控/疫控中心、医院的传染病科室以及一些高校和研究所的相应课题组,可能需要对病毒的全基因组进行测序以后,结合其他上下游的研究数据,达到研究或者监测疫病的目的。全基因组测序能检测个体基因组中的全部遗传信息,准确性高。广东全基因组病毒二代测序分析方法
病毒全基因组测序具有的特点:采用高通量测序仪,全流程质控。病毒二代测序分析技术
病毒全基因组测序定在探普生物长时间运行过程中,我们接触到的对病毒的全基因组进行测序项目有比较丰富的应用场景。先,从事基因进化/疫苗/药品/抗体研制方向的研究的研究者一定会用到测序。这种场景一般是用密集的sanger测序监测某几个关键基因,搭载一定频率的全基因组测序。这样的组合省时省力省经费,同时能达到研究目的。此外,有的单位需要对传染病的病原进行流行病学监测和研究,如疾控/疫控中心、医院的传染病科室以及一些高校和研究所的相应课题组,可能需要对病毒的全基因组进行测序以后,结合其他上下游的研究数据,达到研究或者监测疫病的目的。病毒二代测序分析技术
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