电子病历系统与传统的HIS的不同，从电子病历的角度看病人信息，是完整的、集成的；而从传统的HIS的每个子系统来看病人信息，是局部的、离散的，相互之间信息有冗余、有遗漏，它们往往没有按照一个统一的原则进行设计和管理。在内容上，有不同的侧重和要求。比如：以统计和检索为目的的病案首页管理对病人的诊断只要录入保存ICD码即可，而从电子病历的角度则必须要完整地保留医生的诊断描述，诊断描述与ICD分类码不能相互取代。电子病历强调病人信息的原始性和完整性。电子病历需要借助计算机设备转变为可与人交互的信息形式。中小医院无纸化病案管理系统操作方法
电子病历系统是医院的关键应用，关联到病历重要数据、病人隐私等，一旦出现隐患将出现无法挽回的损失，因此电子病历的IT系统建设，必须考虑安全性、稳定性、可靠性。电子病历系统为结构化、模块化结构设计，多采用双机热备方案，并通过密码控制、文件存储传输加密等设置，确保数据安全。电子病历系统为数据库应用，包含上万乃至10万级别的电子病历在线建档；多用户在线数据搜索与调用，如同类疾病的病历查阅，帮助医生选择较佳医疗方案；智能知识库，辅助医生确立医疗方案；医疗违规警告，象药品相互作用配伍禁忌等，避免医疗错误；联机专业数据库，如药品数据库，供医生查询。中小医院无纸化病案管理系统操作方法电子病历主要功能包括结构化存储。
电子病历管理系统并不是具体的业务系统，应当定义为一个管理平台，主要负责病历信息（文字的、图像的、影像的、声音的等）匹配、合并、归档、借阅、交换等管理。主要是对于病历数据集的管理，这点有些像健康档案；电子病历在临床上使用的时候，如果是在院期间则需要将各种信息归档到病历中，统一展示，供医生查房时候使用，这个就像是查房时候的病历夹。病人出院后，一旦归档，这这些信息的查看需要申请、审批、归还，同时需要记录浏览信息和解决信息；电子病历的对外交互：例如和健康档案平台或者是区域电子病历平台，那么就会存在交换标准的问题，这个标准的组织都需要电子病历管理系统来完成。
病历是病人在医院诊断医疗全过程的原始记录，其包含有首页、病程记录、检查检验结果、医嘱、手术记录、护理记录等等。电子病历（EMR）不只指静态病历信息，还包括提供的相关服务。是以电子化方式管理的有关个人终生健康状态和医疗保健行为的信息，涉及病人信息的采集、存储、传输、处理和利用的所有过程信息。有关医学研究所将定义为：EMR是基于一个特定系统的电子化病人记录， 该系统提供用户访问完整准确的数据、警示、提示和临床决策支持系统的能力。有了以电子病历为中心的医疗信息系统，医疗工作过程将会发生很大的变化。
电子化病历系统的用途有哪些？节省时间：对于医生来说，每天都要接治多名患者，日常工作中70%的时间用于手工书写病历。通过电子病历系统提供的多种规范化的模板及辅助工具，不只可以将医务人员从繁琐重复的病历文书书写工作中解脱出来，集中精力关注病人的诊疗，而且通过模板书写的病历更加完整、规范，同时，还可使医生将更多的时间用于提高自身的业务水平，收治更多的患者，从而可以提高医院的经济效益和医疗水平。稳定病源：电子病历系统为患者提供了长期健康记录，并且支持健康记录快速检索，为医务人员决策提供更多的历史参考资料，提高患者对医院的认可度。医务人员使用电子病历系统能够更方便的检索。中小医院无纸化病案管理系统操作方法
电子病历有着存贮容量大的优点。中小医院无纸化病案管理系统操作方法
电子病历是医院中医疗信息系统的中心，医疗信息系统的主要功能是为医院的医疗提供信息服务，其各项功能都是建立在对病人的病历信息进行处理的基础上。它包括：①病人的姓名、性别等自然信息。②病人的入院、出院、转科、转院等流行情况。③病人在医院所接受的各种检查记录。④医师为病人所做的各种医疗记录。⑤对病人的护理记录等。引入电子病历概念后，正在使用的纸病案一般被称做传统病历，随着我国医改试点的成功，医改的成功经验正在不断地向其它地区传播，在医疗变革过程中医疗诊所和医院实行办公自动化、病历电子化的转变，对于电子病历进行医疗数据转换是一个非常重要的问题。中小医院无纸化病案管理系统操作方法
