AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一项新研究,对类风湿关节炎(RA)患者及健康人的肠道菌群进行了宏基因组关联分析,鉴定出了一些与RA相关的菌种及菌群功能,并发现了一些具有人种特异性的RA相关的宏基因组-宿主基因组关联,提示宿主基因组、肠道菌群及RA的发病机制之间存在密切联系。①纳入82名类风湿关节炎(RA)患者及42名健康对照,对肠道菌群进行全基因组深度测序;②RA患者的肠道菌群宏基因组中,普氏菌属中多个菌种的丰度高于健康人;③RA患者的肠道菌群宏基因组中,R6FCZ7(与氧化还原反应相关的基因)的丰度明显低于健康人,而代谢相关通路(脂肪酸生物合成、粘多糖降解等)明显富集;④通过对比宏基因组关联分析(MWAS)与全基因组关联分析(GWAS),鉴定出一些RA相关的宏基因组-宿主基因组之间相关的通路。肠道菌群都干些什么?菌群检测来告诉你。上海亚健康人群菌群检测预测疾病
肠道菌群,作为寄居在人体肠道内微生物群落的总称,是近年来微生物学、医学、基因学等领域引人关注的研究焦点之一。近年来的研究逐渐揭示了肠道菌群的构成、数量、如何进入人体、如何辅助消化、如何影响肠道发育,以及肠道菌群失衡如何影响整体健康。但肠道菌群如此庞大,与人体的交互关系如此复杂,关于肠道菌群仍有诸多悬而未解的难题。无外乎很多科学家将其称为人体的另一个重要组成,甚至“另一个你”。不仅如此,组成“另一个你”的细菌的数量,比组成“你”的细胞数量,还要多!我们都知道,细胞是构成人的基本单位。一个成年人的细胞数量大约是数十万亿的量级,也就是1后面13个零。肠道菌群有多少细胞呢?1后面14个零。陕西肿瘤术后菌群检测报告内容上海沃本,肠道菌群检测更专业。
自从引入了细菌的基因组学分析以来,针对微生物的研究已经产生**性变化。16SrDNA测序和宏基因组测序两种测序方法,常用于评估微生物组成机器相对丰度。16S测序可以以可变区域周围的稳定区域为八项来检测细菌基因组中高变异度区域的差异。这一技术的主要缺陷在于无法分辨种群之间的差异,因为这种差异通常很小。相反地,宏基因组测序能够实时检测所有生物的全基因组,这也造成针对意志和位置的微生物检测的精度增加。本章阐述了与心血管疾病相关的肠道微生物组成的变化!
某些肠道细菌被认为是AS疾病进展的新因素。研究发现,中国AS患者的类杆菌属(Bacteroides)和普雷沃氏菌属(Prevotella)相对减少,而链球菌属(Streptococcus)和大肠埃希菌属(Escherichia)富集。然而,在波兰东部,总胆固醇水平和低密度脂蛋白胆固醇值高的中年男性肠道中富含普雷沃氏菌属(Prevotella),但是梭菌属(Clostridium)和粪杆菌属(Faecalibacterium)含量较低。例如,一些AS患者的条件致病菌柯林斯氏菌属(Collinsella)增多。同时,有些微生物也可以降低AS斑块的形成。比如,在患者和小鼠模型中均发现,产丁酸盐的细菌罗斯伯里氏菌属(Roseburia)和真杆菌属(Eubacterium)的相对减少与AS病变的发展呈负相关关系。据推测,这些微生物可能会影响宿主的炎症水平。沃本生物值得信赖的肠道菌群检测商。
人体内有两个基因组,一个是人基因组,编码大约2.5万个基因;另一个则是出生以后才进入人体、特别是肠道内的多达1000多种的共生微生物,其遗传信息的总和叫“微生物组”,也可称为“宏基因组”或“元基因组”,它们所编码的基因有100万个以上。两个基因组相互协调、和谐一致,保证了人体的健康。人类基因组计划在2003年完成以后,许多科学家已经认识到人类基因组基因并不能完全掌握人类疾病与健康的关键问题,因为人类对自身体内数量巨大的,与人体共生的微生物菌群,几乎一无所知。人体内微生物细胞的数量是人体内细胞数量的10倍,初步的研究显示,其所含基因数目的总和是人类基因组所含基因数目总和的100倍。但是,由于传统微生物学研究方法的局限,对生活在自己体内的95%以上的微生物没有任何研究数据。菌群检测还可以用于评估解决效果。上海肿瘤术后菌群检测科研助力
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GenomeMedicine近期发表的文章,通过对RA病人的粪便菌群进行宏基因组测序分析,发现RA患者中存在与疾病活动指数——MCII相关的肠道菌群的分类和功能特征,且利用肠道菌群特征进行AI训练预测哪些患者MCII状态会发生改变,效果明显。提示我们改变肠道菌群以提高临床疗效可能是RA未来的希望。①对1988年-2014年间诊断为RA的患者进行回顾性、观察性队列研究,收集64份粪便样本进行宏基因组测序;②年龄是导致肠道菌群组成差异的比较大决定因素,其次是疾病活动指数——MCII状态,且MCII+和MCII-患者的基线肠道菌群特征、功能性生化途径都存在明显差异;③基线检查和随访中,取得临床改善的患者肠道菌群的α多样性较高;④神经网络利用肠道菌群预测哪些患者MCII状态会发生改变,被证明是非常有效的,证明了肠道菌群的潜在临床实用性。上海亚健康人群菌群检测预测疾病