除了获得载体的滴度及产量，生产慢病毒更关心的指标主要是各种污染物的去除。总DNA污染的去除百分比在99.1-99.84%，总蛋白污染物的去除百分比在99.85-99.9%。针对宿主细胞的DNA（HCD）及蛋白（HCP），有报道其去除百分比分别为99.8%和99.4%。因为不仅残存的DNA可能是个问题，而且DNA的大小以及由此引起的可能转移整个有功能的开放阅读框也是问题，因此监管机构对残存DNA污染的分子量上限的要求越来越高。例如，FDA的指南‘生产用于传染病适应症的病毒疫苗的细胞基质和其他生物材料的特性和鉴定’中说明，残留的细胞宿主的DNA片段不能超过一个功能基因的长度，估计在200bp左右。M-SAN HQ ELISA kit检测产品操作简单，1.5–2hr即可完成检测。陕西生理盐条件中盐核酸酶70950
大规模生产阶段，AAV/LV载体生产流程跟抗体、疫苗类药物的生产类似，主要包含上游培养、下游纯化及制剂部分。上游培养分为质粒开发、细胞扩增、三质粒共转染及病毒载体生产等步骤。下游纯化分为细胞裂解释放AAV病毒颗粒（可以通过去污剂、机械作用、高渗或冻融操作等）or收获细胞上清液得到含LV病毒原液、加入核酸酶以减少宿主细胞核酸污染、澄清是通过离心或过滤等方法去除细胞碎片和杂质等、超滤浓缩以减少后续色谱纯化体系、亲合及离子交换等纯化得到高纯度病毒载体。制剂部分主要是超滤更换缓冲液、过滤除菌及制剂灌装等。青海M-SAN HQ中盐核酸酶生理盐浓度下，M-SAN HQ中盐核酸酶性能优于常用核酸酶，对HCD的去除有些本质区别。
宿主细胞DNA残留的担忧是基于致ai风险理论，特别是生产细胞系所包含的致ai序列，比如较常见腺病毒基因E1A和E1B（HEK293, PerC.6 和CAP 细胞系），人乳tou瘤病毒E6和E7基因（HeLa细胞系)等。当使用致ai细胞系生产AAV时，下游纯化须尽可能减少残留DNA。工业上一般使用核酸酶分解残留DNA，普遍认为小于200 bp的DNA片段可有效降低致ai风险。宿主细胞蛋白残留与免疫原性、炎症或过敏性休克有关。尽管与非人类的生产原料相比（非人类细胞系如BHK21或昆虫细胞，以及辅助病毒如HSV、腺病毒、杆状病毒），人类细胞免疫原性比较弱。
逆转录病毒载体可以将7.5Kb左右外源基因整合入靶细胞基因组，并稳定持久地表达，已经在批准的CAR-T产品和许多临床产品中得到应用。Shou个成功的基因药物临床试验是利用小鼠白血病病毒(Murin Leukemia Virus,MLV，gamma逆转录病毒)作为基因转移载体医治儿童的X性染色体连锁严重联合免疫缺陷（SCID-X1）。目前上市的6个细胞药物产品全部采用逆转录病毒（3个为gamma逆转录病毒载体，3个慢病毒载体）作为基因转移载体。逆转录病毒载体目前常用的主要有两个：gamma逆转录病毒载体(Retroviral vector,RV)和慢病毒载体(Lentivirus vector,LV)。两种病毒均属于逆转录病毒科，在自身携带的逆转录酶催化下将其正链RNA均逆转录为cDNA。病毒颗粒比较大，约为100nm（70-100nm，有的至200nm）,外层为表面突起的脂蛋白套膜，套膜内为20面体的衣壳（capsid）,核衣壳内由一螺旋结构的核酸。M-SAN HQ中盐核酸酶不需调整培养基任何组分，使用简单方便；
市售的M-SAN HQ中盐核酸酶有三个规格，分别是25kU、500kU及5MU，分别满足研发初期及大规模生产各阶段的要求。通过SDS-PAGE检测蛋白纯度在99%以上。基于ArcticZymes Technologies的30年的酶学开发及大规模生产经验，M-SAN HQ的生产体系稳定，产品纯度高，批次一致性好，无蛋白酶活性。厂家开发出特异的缓冲液体系，使M-SAN HQ保存起来更加稳定，-15℃ - -30℃条件下保存4年没有活性下降。研究数据表明，经过5-6次的反复冻融，M-SAN HQ中盐核酸酶活性没有明显变化。M-SAN HQ中盐核酸酶是用Pichia pastoris表达的重组非特异内切核酸酶。青海M-SAN中盐核酸酶
在150mM NaCl条件下，M-SAN HQ中盐核酸酶的酶切活性达到常规核酸酶的5倍左右。陕西生理盐条件中盐核酸酶70950
慢病毒大规模纯化的捕获步骤包括：膜过滤澄清，随后切向流过滤/超滤或者体积排阻色谱浓缩。此外，需用核酸酶（benzonase或M-SAN HQ中盐核酸酶）来去除细胞残留的、质粒来源的DNA污染。这两个步骤顺序可以调整，依据项目工艺而定。两种工艺路线各有优缺点：先用核酸酶消化的优点是可去除大的DNA片段，且后续步骤可以去除残留核酸酶；但所用的核酸酶的量也非常大。与此相反，将核酸酶步骤后置的优点是大幅降低核酸酶的量(成本降低)；但后面的步骤必须有将核酸酶去除的能力。此外，后期用核酸酶的缺点是核酸污染可能会结合慢病毒颗粒形成沉淀，进而导致慢病毒在纯化中流失，从而影响得率。陕西生理盐条件中盐核酸酶70950
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