温州病毒载体整合位点安全性评价

免疫细胞zhiliao产品的风险水平与多种因素有关，如细胞来源和类型、体内活性和存活时间、是否有外源基因表达、基因表达使用的载体类型以及是否存在基因组整合等。针对不同风险水平的免疫细胞zhiliao产品，随访持续时间的建议如下：对于没有外源基因表达、且体外操作不改变细胞存活时间及分化潜能的免疫细胞zhiliao产品，长期随访的持续时间不应短于细胞在体内的自然存活时间，建议对受试者进行1年或以上的随访。对于有外源基因表达、但不存在基因整合或基因重组风险，或载体的基因整合或重组风险较低的免疫细胞zhiliao产品，建议对受试者进行不少于5年的随访。对于有外源基因表达、而且表达载体存在基因整合或有基因重组风险的免疫细胞zhiliao产品，建议对受试者观察不少于15年。转基因植物外源基因的检测方法及整合位点分析。温州病毒载体整合位点安全性评价

全基因组测序是对重组细胞的基因组DNA进行深度测序，技术成熟简单这里不做介绍了，我们分享一下LM-PCR结合二代测序的检测方法。LM-PCR全称连接介导的PCR。将含有慢病毒插入的基因组进行随机打断并连接接头，然后通过两轮PCR富集含有慢病毒LTR-宿主区域的嵌合序列。此扩增产物进行二代测序即可以分析确定载体在宿主基因组上的整合位点。LM-PCR与高通量测序技术相结合后，有了更为丰富的应用场景。比如，识别整合载体（慢病毒载体，转座子）的整合位点。该技术广泛应用于基因zhiliao研究基因修饰细胞的克隆组成，或者通过研究整合事件评估新载体系统的生物安全性。深圳载体整合位点CRO非病毒定点整合CAR-T技术的开发和应用。

应用场景：单克隆抗体药物辅助筛选；致xingbing毒整合位点检测与整合偏好性分析等；WGS不适用于转染之后未经过传代培养和表型筛选的细胞系。丰富的项目经验目前，唯可已与国内外多家免疫zhiliao研究前沿企业开展合作，采用该方法对高度异质性的CAR-T细胞进行整合位点检测与细胞安全性评估，具有较为丰富的项目经验。一般HBV插入到基因组中形成下图结构。使用三代测序，靶向插入区域的测序reads可分为Readsgroup1（HBV插入区域测通）和Readsgroup2（reads部分比对染色体，部分比对HBV插入区域）。基于三代数据比对后bam文件的IGV图，判断变异类型，推断断点类型和插入序列。

2020年9月发布的《细胞zhiliao产品申请临床试验药学研究和申报资料的考虑要点》“生产工艺开发的技术要求”及“质量研究和质量控制中的安全性研究”部分要求提供目的基因在染色体中的整合情况及提供细胞恶性转化（成瘤性和致瘤性）进行安全性研究和评估内容。2020年2月发布的《免疫细胞zhiliao产品临床试验技术指导原则（试行）》中规定：探索性临床试验的安全性和耐受性要考虑"外源基因随机整合到细胞基因组形成插入突变，导致成瘤性和恶性转化等"。基因编辑整合位点，推荐唯可生物，实验实力强，专业性高，检测效率高，结果准确率高。

靶细胞群的转化可能性，这可能与细胞的分化状态、增殖潜力、体外培养条件和体内植入环境等有关。基于已有科学经验和既往非临床/临床研究结果，如果认为基因修饰细胞所采用的载体系统可将外源基因整合到细胞基因组中并可在体内长期存续，需综合分析以上风险因素，评估潜在的插入突变、致瘤/致性风险。非临床研究，应采用具有代表性的基因转导细胞进行基因整合位点分析，分析细胞的克隆组成以及在关注基因（如liu相关调控基因）附近有无优先整合迹象，含有关注整合位点的细胞有无优先异常增殖。慢病毒整合位点，推荐唯可生物，实验实力强，专业性高，检测效率高，结果准确率高。连云港ISA整合位点安全性评价

慢病毒载体在CAR-T细胞中的整合位点分析方法及引物。温州病毒载体整合位点安全性评价

插入突变风险评估一些整合性载体（如逆转录病毒、慢病毒、转座子）可将外源基因插入整合到细胞基因组中，这可能会导致关键基因突变或jihuo原基因，从而导致恶性liu风险增加。影响插入突变的关键风险因素包括：（1）载体的整合特征，如插入位点的偏好性；（2）载体的设计，如增强子、启动子等构建元件的活性，影响邻近基因的潜力；产生剪接突变体的潜在剪接位点或多聚腺苷酸信号等；（3）细胞载体拷贝数；4）转基因表达产物的功能活性（如与细胞生长调控相关）和表达水平；5）靶细胞群的转化可能性，这可能与细胞的分化状态、增殖潜力、体外培养条件和体内植入环境等有关。温州病毒载体整合位点安全性评价