花青类荧光染料属于共振染料，其特征在于具有离域电荷的氮原子（两个氮原子）之间的聚甲炔染料。由于与生物分子的低非特异性结合以及明亮的荧光，花青类荧光染料已成为一些当下流行的用于标记核酸的荧光染料。花青类染料分为两大类：非磺化花青类染料-该组中的一些染料包括cy3、cy3.3、cy5、cy5.5、cy7和cy7.5。在大多数情况下，这些染料的特点是水溶性低，但胺的盐酸盐和酰肼除外。它们首先溶解在有机溶剂（共溶剂）中，然后在生物分子标记期间添加到含有生物分子的溶液中。而“Cy”**花青，***个数字**存在于亚油啉基团之间的碳原子数。另一方面，添加0.5后缀以表示苯并稠合花青。这些荧光染料通常用于有机介质。磺化类花青染料-该组由磺基-Cy3、磺基-Cy5和磺基-Cy7组成。顾名思义，这些花青的特征是一个磺基，它有助于染料分子在水相中的溶解。与非磺化花青相比，这些花青更易溶于水，因此不需要溶解在有机溶剂中进行标记。磺化花青通常用于标记疏水性蛋白质、水溶液中的纳米颗粒以及可能被DMSO或DMF变性的敏感蛋白质。两组染料均可用于标记以下生物分子：肽、寡核苷酸和DNA、抗体、可溶性蛋白质。D-荧光素（D-Luciferin）是萤火荧光素酶底物，其量子效率为0.88，是Luminol的20倍。中国澳门国产荧光染料
SUPERGreenI（10,000×DMSO溶液，电泳级）储存条件及注意事项4℃避光可保存12个月。本品用DMSO溶解，因DMSO的熔点是18.5℃，使用前请放置到室温充分溶解。SUPERGreenI核酸染料特点●无毒性：属花菁类染料，容易生物降解，无致*毒性。●灵敏度高：至少可检出20pgDNA，高于EB染色法25～100倍。●信噪比高：样品荧光信号强，背景信号低。●操作简单：无须脱色或冲洗，即可直接用紫外凝胶透射仪或可见光透射仪观察。●适用范围广：可适用于多种凝胶电泳方法：琼脂糖凝胶、聚丙烯酰胺凝胶电泳、脉冲电场凝胶电泳和毛细管电泳等。●使用方便：对分子生物学中常用的酶（如：Taq酶、反转录酶、内切酶、T4连接酶等）没有抑制作用。●经济：价格比银染便宜。ivis荧光染料Cy7.5Cy7 DiC18（DiR）是一个亲脂性、近红外荧光花青染料，这个染料常用于标记细胞质膜。
与花青和罗丹明染料一样，荧光素也是一种有机染料。荧光素的比较大吸收波长为494nm，比较大发射波长为521nm（通常吸收蓝色范围内的光并发射绿色范围内的光），荧光素是一种高荧光物质。即使在非常少量的情况下也可以检测到它，并且在与抗体结合时用于显微镜检查。荧光素的衍生物包括异硫氰酸荧光素、俄勒冈绿和羧基萘并荧光素等。与许多其他荧光染料一样，荧光素价格低廉且易于使用，使其成为生物学研究中很受欢迎的染料之一。与大多数其他染料不同，荧光素在水溶液中是无毒的。因此，它是极少数用作地下水示踪剂的染料之一。
异硫氰酸荧光素(FITC)是一种有机荧光染料，目前，这种荧光染料仍用于免疫荧光和流式细胞术中。在495/517nm处，该染料会产生激发/发射峰值，并可借助异硫氰酸盐反应基团与不同抗体结合，该基团可以和蛋白质上的氨基、巯基、咪唑、酪氨酰、羰基等基团相结合。而它的基本成分——荧光素，其摩尔质量为332g/mol，常被用作荧光示踪剂。FITC(389g/mol)是用于荧光显微镜技术的首批染料，且其被当成AlexaFluor®488等后续荧光染料的发端。该染料的荧光活性取决于它的大共轭芳香电子系统，而该系统受蓝色光谱中的光所激发。经常与FITC同时使用的另一种染料是与其相似的TRITC[四甲基罗丹明-5(6)-异硫氰酸]。与FITC相反，TRITC并非荧光素，而是罗丹明家族的衍生物。罗丹明也具有一个大的共轭芳香电子系统，正是该系统引发了它们的荧光行为。还有一点与FITC相反，TRITC(479g/mol)由比较**长为550nm的绿色光谱中的光所激发，它的比较大发射波长为573nm。与蛋白质（例如，抗体）结合也基于异硫氰酸盐反应基团。荧光素的衍生物包括异硫氰酸荧光素、俄勒冈绿和羧基萘并荧光素等。
为什么要使用荧光染料？虽然不同的染色技术（即考马斯染色、银染色、荧光染色）可用于可视化凝胶电泳分离的蛋白质，但使用荧光染料具有其独特的优势。他们提供：高灵敏度：对于大多数分析物，荧光测量的灵敏度比吸光度测量高1000倍，即使在使用小样本时也可以令人满意地达到ppt（万亿分之一）的检测限。宽线性动态范围。输出与样品浓度成正比。低干扰：由于吸收光的材料数量众多，分光光度测量通常会遇到干扰问题。在进行荧光测量时不会遇到这个问题，因为只有少数材料具有荧光能力。高通量：荧光测量具有简单而强大的协议，并且可以自动化用于高通量应用。DiR的红外荧光可以穿透细胞和组织，在小动物成像中用来示踪。郑州荧光染料脂质
小动物成像荧光染料能够选择性地与目标细胞或组织结合。中国澳门国产荧光染料
Hoechst33258是一种可以穿透细胞膜的蓝色荧光染料，对细胞的毒性较低。用于细胞核染色时，推荐的Hoechst33258工作浓度为0.5-10μg/ml。储存条件：-20℃干燥避光保存，有效期一年。注意事项：Hoechst33258对人体有害，请注意适当防护。荧光染料都存在淬灭的问题，建议染色后尽量当天完成检测。为减缓荧光淬灭可以使用抗荧光淬灭封片液。抗荧光淬灭封片液(P0126)可以向碧云天订购。为了您的安全和健康，请穿实验服并戴一次性手套操作注意事项：Hoechst33342对人体有一定刺激性，请注意适当防护。荧光染料都存在淬灭的问题，建议染色后尽量当天完成检测。为减缓荧光淬灭可以使用抗荧光淬灭封片液。为了您的安全和健康，请穿实验服并戴一次性手套操作。中国澳门国产荧光染料
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