2020年9月发布的《细胞zhiliao产品申请临床试验药学研究和申报资料的考虑要点》“生产工艺开发的技术要求”及“质量研究和质量控制中的安全性研究”部分要求提供目的基因在染色体中的整合情况及提供细胞恶性转化(成瘤性和致瘤性)进行安全性研究和评估内容。2020年2月发布的《免疫细胞zhiliao产品临床试验技术指导原则(试行)》中规定:探索性临床试验的安全性和耐受性要考虑"外源基因随机整合到细胞基因组形成插入突变,导致成瘤性和恶性转化等"。MAPS:基因整合位点高通量测序分析的新方法。浙江ISA整合位点安评
当载体或基因zhiliao产品原有的风险特征增加时,例如经过修饰以携带基因组编辑成分的质粒或改变给yaofang式以提高整合能力等,需要提高对长期随访观察的要求;反之,也可以对目前认为存在迟发风险的基因zhiliao载体进行修饰,以降低这些风险。长期表达,与其他产品相比,部分基因zhiliao产品的明显特征是可以在患者靶细胞或基因修饰细胞中持续存在并编码表达作用因子(功能性蛋白或基因表达调节元件),并通过长久或长期改变靶细胞或组织的功能来达到zhiliao效果。同时,由于基因zhiliao编码的作用因子在体内的长期暴露或表达异常,可能产生与其功能相关的长期安全性风险,如细胞生长失控和恶性liu形成、自身免疫反应或其他无法预测的迟发性不良反应。台州AAV整合位点CAR-T整合位点,推荐唯可生物,实验实力强,专业性高,检测效率高,结果准确率高。
相较于LM-PCR方法,重组细胞全基因组重测序需要较大数据量,比较适合用于经过表型筛选的单克隆细胞的测序,比如用于抗体药物生产重组CHO细胞的位点检测,但全基因组测序可对宿主基因组自身的变异进行检测。应用场景:CAR-T细胞安全性检测(药物申报);基因zhiliao研究中使用的病毒性载体的安全性检测等;1.LM-PCR不适合评估每个整合位点插入序列发生的变异,不适用于插入序列的拷贝数检测,拷贝数检测可以采用qPCR方法进行。2.INZR-WGS(WGS法)
对确证性临床试验的疗效和安全性要求:“继续监测安全性风险,分析重要的已知和潜在的风险信息,包括迟发性不良事件(如致瘤性)的发生率、 严重性和危险因素等,并有必要采取措施使风险较小化。" 2021年2月发布的《基因修饰细胞zhiliao 产品非临床研究与评价技术指导原则(试行)》则明确将"插入突变风险评估"作为非临床安全性研究的内容,并详细规定关键风险因素的评估要点。可见慢病毒载体整合位点检测已经成为细胞zhiliao 产品IND评审及临床试验安全性评估的必检内容。通过分选CAR-T 细胞,对T细胞受体(TCR)β链库进行深度测序(TCR-seq)以及慢病毒载体整合位点(LVIS)分析。
应注意以下几点:在接受基因zhiliao产品的较初5年内,两次检测间的采样间隔建议不超过6个月。此后每年至少检测一次,直至检测数据表明不再存在任何安全性风险。检测方法的敏感度、特异性和可重复性应经过验证,并设计适当的阳性和阴性对照;当体内靶细胞或替代细胞中载体序列阳性的比例超出预期范围时,应开展克隆性生长的评估。如果存在优势克隆或单克隆生长,应在不超过3个月的时间内再次检测确认,并尽快开展整合位点的分析。当载体的整合位点确定后,应与人类基因组数据库及基因组的其他数据库等进行比较,确定整合位点的基因功能,评估是否与包括zheng在内的任何疾病有关。慢病毒载体在CAR-T细胞中的整合位点分析方法及引物。浙江crispr/cas9整合位点安全性评价
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慢病毒整合事件要素及检测方法要求:对于食药监局指导性文件和既往研究内容,我们不难发现对于慢病毒整合检测所谓整合事件至少包含三个要素:整合位置;整合方向;特定整合位置和整合方向的juedui克隆数目;因此检测在定性和定量性能方面都有要求,检测方法需要结合临床样本进行分析性能进行系统验证。慢病毒整合位点检测方法,目前检测慢病毒整合位点的主要平台为高深度测序(NGS)。而目前较为成熟已经应用于工业产品检测及临床研究的整合位点富集建库方法为机械片段化及依赖于接头的扩增子建库(LM-PCR,如INSPIIRED),已经应用于多个CART19临床项目的安全性评估及与CAR-T细胞增值相关的回顾yao效学分析。浙江ISA整合位点安评