相较于LM-PCR方法,重组细胞全基因组重测序需要较大数据量,比较适合用于经过表型筛选的单克隆细胞的测序,比如用于抗体药物生产重组CHO细胞的位点检测,但全基因组测序可对宿主基因组自身的变异进行检测。应用场景:CAR-T细胞安全性检测(药物申报);基因zhiliao研究中使用的病毒性载体的安全性检测等;1.LM-PCR不适合评估每个整合位点插入序列发生的变异,不适用于插入序列的拷贝数检测,拷贝数检测可以采用qPCR方法进行。2.INZR-WGS(WGS法)整合位点和复制位点。上海LV整合位点评估
长期随访的观察时间长期随访的持续时间应确保足以观察到受试者因产品特性、暴露情况(生物分布和给药途径)等导致的风险,应不短于迟发性不良反应的预期发生时间。一般而言,针对不同类型的基因zhiliao产品建议如下:具有基因组整合活性的载体(例如γ-逆转录病毒和慢病毒载体)和转座子元件建议观察不短于15年。可以产生持续ganran、或有潜伏再jihuo风险的细菌或病毒载体(如单纯疱疹病毒)建议观察15年或至数据表明不再存在任何风险(ganran或再jihuo)。武汉载体整合位点服务整合位点服务,推荐唯可生物,实验实力强,专业性高,检测效率高,结果准确率高。
不同基因zhiliao产品的特殊考虑1.关于整合性载体的特殊考虑如受试者接受整合性载体基因zhiliao产品,例如转座子元件、γ-逆转录病毒、慢病毒及其他逆转录病毒载体,或利用整合性载体或基于转座子的载体在体外修饰的细胞,长期随访中需格外关注基因zhiliao产品的基因组整合风险,建议申办方分析基因zhiliao载体在靶细胞或相关替代细胞的基因组中整合的影响(例如是否存在克隆性生长、是否存在优势克隆、克隆性生长是否导致恶性liu等)。如果基因组整合相关风险的分析可行。
慢病毒整合事件要素及检测方法要求:对于食药监局指导性文件和既往研究内容,我们不难发现对于慢病毒整合检测所谓整合事件至少包含三个要素:整合位置;整合方向;特定整合位置和整合方向的juedui克隆数目;因此检测在定性和定量性能方面都有要求,检测方法需要结合临床样本进行分析性能进行系统验证。慢病毒整合位点检测方法,目前检测慢病毒整合位点的主要平台为高深度测序(NGS)。而目前较为成熟已经应用于工业产品检测及临床研究的整合位点富集建库方法为机械片段化及依赖于接头的扩增子建库(LM-PCR,如INSPIIRED),已经应用于多个CART19临床项目的安全性评估及与CAR-T细胞增值相关的回顾yao效学分析。转基因植物外源基因的检测方法及整合位点分析。
对确证性临床试验的疗效和安全性要求:“继续监测安全性风险,分析重要的已知和潜在的风险信息,包括迟发性不良事件(如致瘤性)的发生率、 严重性和危险因素等,并有必要采取措施使风险较小化。" 2021年2月发布的《基因修饰细胞zhiliao 产品非临床研究与评价技术指导原则(试行)》则明确将"插入突变风险评估"作为非临床安全性研究的内容,并详细规定关键风险因素的评估要点。可见慢病毒载体整合位点检测已经成为细胞zhiliao 产品IND评审及临床试验安全性评估的必检内容。慢病毒整合位点如何进行分析,用什么产品进行分析呢?江苏病毒整合位点技术
整合位点相比γ-逆转录病毒更安全,成本更高。上海LV整合位点评估
耐受剂量(maximumtolerancedose,MTD)通常通过剂量递增设计实现。细胞zhiliao产品可接受的毒性或不良反应的严重程度,会基于疾病的严重性和获益风险预期进行判断,申请人应在研究方案中明确探索方法。对于免疫细胞zhiliao产品,可以通过剂量探索确定其生物学活性范围或比较好有效剂量,如果在较低剂量水平可以观察到稳定的生物学活性或临床获益,申请人可能不必要确定MTD。此外,很多免疫细胞zhiliao产品受制备及运输等实际情况的限制,只能达到特定的暴露量范围,临床试验中可能只能观察部分剂量水平的安全性特征,而无法确定MTD。但须认识到,早期研究往往难以准确估计产品的有效推荐剂量,申请人需仔细评估早期研究未能确定MTD对后续试验的影响。原则上确证性临床试验剂量不应超出探索性研究的剂量范围。上海LV整合位点评估