免疫沉淀技术的实验方法通常包括以下步骤:
1. 样本准备
2. 细胞裂解:使用裂解缓冲液(含有蛋白酶抑制剂以防止蛋白质降解)裂解细胞,释放蛋白质。
3. 蛋白质浓度测定:使用BCA、Bradford或Lowry等方法测定裂解液中蛋白质的浓度。
4. 抗体预处理:如果使用预固定的抗体,需先将抗体固定在固相支持物上,如琼脂糖珠或磁性微珠。
5. 免疫沉淀反应:将裂解液与特异性抗体(固定或未固定)混合,并在4°C下缓慢摇晃孵育过夜,以允许抗体与目标蛋白质充分结合。
6. 固相支持物的回收:对于未固定的抗体,加入与抗体特异性结合的蛋白A或蛋白G结合的固相支持物。
7. 洗涤:去除未结合的蛋白质和杂质,通常需要多次洗涤固相支持物。
8. 洗脱:使用适当的洗脱缓冲液(如加热的SDS加载缓冲液或酸性缓冲液)从固相支持物上洗脱免疫复合物。
9. 后续分析:对洗脱的蛋白质进行SDS-PAGE电泳、Western Blot、质谱分析等,以进一步分析目标蛋白质。
10. 对照实验:包括正对照(已知能沉淀目标蛋白的抗体)和负对照(非特异性抗体或无抗体)以验证实验的特异性。
免疫沉淀技术的综述。广州Protein AG免疫沉淀技术服务
ChIP实验的基本步骤包括:
1. 交联(Crosslinking):细胞被甲醛等交联剂处理,使得蛋白质和DNA之间的相互作用被固定,形成稳定的蛋白质-DNA复合物。
2. 细胞裂解:裂解细胞,释放染色质,同时保持蛋白质-DNA复合物的完整性。
3. 超声或酶解:通过超声或酶解将染色质切割成较小的片段,以便于后续步骤中的免疫沉淀。
4. 免疫沉淀(Immunoprecipitation):加入针对特定组蛋白修饰或转录因子的抗体,这些抗体会特异性地结合到目标蛋白质上。
5. 捕获复合物:使用蛋白A或蛋白G结合的珠子捕获抗体-蛋白质-DNA复合物。
6. 洗涤:洗涤珠子以去除未特异性结合的蛋白质和DNA片段。
7. 逆转录交联:将捕获的复合物从珠子上洗脱,并进行逆转录交联,使固定的蛋白质-DNA复合物分离。
8. DNA纯化:纯化从免疫沉淀中得到的DNA片段。
9. 分析:通过qPCR、芯片分析(ChIP-chip)或高通量测序(ChIP-seq)等方法分析沉淀的DNA片段,以确定特定蛋白质在基因组上的结合位点。
深圳RIP免疫沉淀磁珠的选择免疫沉淀纯化所得抗原纯度低是什么原因?
RIP 技术的原理(RNA Binding Protein Immunoprecipitation Assay,RNA 结合蛋白免疫沉淀)主要是运用针对目标蛋白的抗体把相应的RNA-蛋白复合物沉淀下来,经过分离纯化就可以对结合在复合物上的RNA 进行q-PCR验证或者测序分析。
RIP 是研究细胞内RNA 与蛋白结合情况的技术,是了解转录后调控网络动态过程的有力工具。RIP可以看成是普遍使用的染色质免疫沉淀ChIP技术的类似应用,但由于研究对象是RNA-蛋白复合物而不是DNA-蛋白复合物,RIP实验的优化条件与ChIP实验不太相同,如:RIP反应体系中的试剂和抗体不能含有RNA酶,抗体需经RIP实验验证等等。
RIP实验步骤通常包括:
1. 细胞收集与交联:培养细胞至适当密度。使用交联剂(如甲醛)进行交联,以固定蛋白质-RNA复合物。
2. 细胞裂解:收集细胞并进行裂解,释放RNA-蛋白质复合物。在裂解过程中添加蛋白酶抑制剂以防止蛋白质降解。
3. 超声处理:使用超声波破坏细胞,获得更小的染色质片段,这有助于后续步骤中抗体的接触。
4. 除去细胞碎片:通过离心去除细胞碎片和未裂解的细胞,收集含RNA-蛋白质复合物的上清液。
5. 免疫沉淀:将针对特定RNA结合蛋白(RBP)的抗体加入到上清液中。孵育一段时间,使抗体与目标蛋白充分结合。
6. 捕获免疫复合物:添加蛋白A或蛋白G结合的磁珠或琼脂糖珠。孵育使抗体-蛋白质-RNA复合物与珠子结合。
7. 洗涤:多次洗涤珠子以去除未特异性结合的蛋白质和RNA。
8. 洗脱与逆转交联:使用适当的缓冲液洗脱免疫复合物。使用蛋白酶K处理样品以逆转交联,释放RNA。
9. RNA提取与纯化:从免疫沉淀样品中提取RNA,并进行纯化。
10. RNA分析:使用qPCR、Northern blot、RNA-Seq等方法分析沉淀的RNA,以确定与目标蛋白相互作用的RNA种类。
免疫沉淀技术的实验设计。
免疫沉淀技术(Immunoprecipitation, IP)是一种利用抗体与特定蛋白质结合的特性,从复杂样本中分离和纯化目标蛋白质的实验方法。这项技术在生物医学研究中有着广泛的应用场景,以下是一些主要的应用领域:
1. 蛋白质相互作用分析:通过免疫沉淀技术,研究人员可以研究蛋白质之间的相互作用,揭示蛋白质复合物的组成以及它们在细胞内的功能和调控机制。
2. 抗体药物开发:免疫沉淀技术可以用于研究抗体药物与其靶标蛋白的结合特性,评估抗体药物的亲和力和特异性,指导抗体药物的设计和优化。
3. 蛋白质表达水平分析:通过比较不同条件下的免疫沉淀结果,可以评估目标蛋白的相对量,进而研究蛋白质的表达调控。
4. 染色质免疫沉淀(ChIP):这是一种特殊的免疫沉淀技术,用于研究蛋白质与DNA的相互作用,如转录因子或组蛋白修饰与基因组特定区域的结合情况。
5. RNA免疫沉淀(RIP):类似于ChIP,RIP用于研究RNA结合蛋白与RNA分子之间的相互作用。
免疫沉淀技术IP实验步骤。苏州IP免疫沉淀实验视频
免疫沉淀技术Co-IP的实验设计。广州Protein AG免疫沉淀技术服务
Co-IP(免疫共沉淀)技术主要用于研究蛋白质之间的相互作用,其应用场景如下:
1. 蛋白质相互作用网络的鉴定:Co-IP可用于构建蛋白质相互作用网络,发现目标蛋白的结合伙伴。
2. 信号传导途径的研究:通过Co-IP技术,科学家们发现了许多关键的细胞信号通路,如MAPK和PI3K/Akt通路等,为深入理解这些通路的功能和调控机制提供了重要线索。
3. 药物靶点筛选:利用Co-IP技术,研究人员可以筛选潜在的药物靶点。
疾病机制研究:通过分析疾病相关蛋白质的相互作用,Co-IP有助于揭示疾病的分子机制。
4. 抗体药物开发:Co-IP可用于研究抗体药物与其靶标蛋白的结合特性,评估抗体药物的亲和力和特异性。
5. 转录因子研究:Co-IP技术可以用于研究转录因子与蛋白质的相互作用,进而揭示基因调控网络。
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