一般来说，生物生产工艺用的核酸酶以BenzonaseTM（BenzonaseTM是Merck的注册商标）为主，能高效降解任何形式（双链、单链、线状、环状）的DNA和RNA。该酶来自于大自然界普遍存在的S.Marcescen，通过E.coli发酵生产得到。该酶的适宜反应条件是低盐浓度范围（<100mM盐浓度），且酶活随着盐浓度上升而下降，在300mM盐浓度时酶活几乎丧失。对于细胞基因药物常用的两种病毒载体LV和AAV，LV由于含有脂包膜结构一般都在生理盐条件下存在，而AAV在高盐条件下不易团聚、更稳定。而在生理盐浓度及更高浓度条件下，Benzonase活性受到抑制。中盐核酸酶适宜pH范围广（pH7.2-8.7），且在125–250mM盐浓度内具有较高活性。陕西ArcticZymes中盐核酸酶70950-160
M-SAN HQ中盐核酸酶，这款核酸酶的适宜pH范围很广（pH 7.2 - 8.7），且在125 – 250 mM盐浓度内具有良好活性。在细胞培养液或收获的培养上清中，不需调整任何组分，直接加入M-SAN HQ即可表现良好核酸酶活性。相比传统的全能核酸酶，M-SAN HQ中盐核酸酶在生理盐条件下，对HCD的去除更高效、更彻底。Medium-Salt Active Nuclease High Quality (M-SAN HQ) 中盐核酸酶是用Pichia pastoris表达的重组非特异内切核酸酶，广泛应用于生产工艺流程中，在生理盐条件下去除双链及单链的DNA及RNA。重庆ArcticZymes中盐核酸酶ArcticZymes致力于提供高质量产品，中盐核酸酶具有好的批间一致性、稳定可靠的质量。
此外，文章作者对每个步骤的样品进行纳米颗粒分析（NTA），结果发现：澄清环节后，M-SAN HQ中盐核酸酶和Benzonase处理组才出现比较明确的LV病毒颗粒峰；TFF处理后，回流液样品的LV病毒颗粒峰更加尖锐，表明病毒颗粒分散度更好、稳定性更高。回流液的NTA结果进一步表明，M-SAN HQ中盐核酸酶处理组只有一个病毒颗粒峰，而Benzonase处理组的回流液中有三个峰。作者推测Benzonase处理组的病毒颗粒还有严重的病毒团聚现象，而呈现多峰现象。
除了获得载体的滴度及产量，生产慢病毒更关心的指标主要是各种污染物的去除。总DNA污染的去除百分比在99.1-99.84%，总蛋白污染物的去除百分比在99.85-99.9%。针对宿主细胞的DNA（HCD）及蛋白（HCP），有报道其去除百分比分别为99.8%和99.4%。因为不仅残存的DNA可能是个问题，而且DNA的大小以及由此引起的可能转移整个有功能的开放阅读框也是问题，因此监管机构对残存DNA污染的分子量上限的要求越来越高。例如，FDA的指南‘生产用于传染病适应症的病毒疫苗的细胞基质和其他生物材料的特性和鉴定’中说明，残留的细胞宿主的DNA片段不能超过一个功能基因的长度，估计在200bp左右。M-SAN HQ中盐核酸酶生产符合ISO 13485:2016规范，提供相关文件用于申报。
在传统生物技术行业（如抗体、疫苗领域）使用的下游纯化工艺步骤，已经用于慢病毒的大规模下游处理。主要是基于膜(过滤/澄清，利用切向流过滤TFF进行浓缩/渗滤，基于膜的色谱)和色谱(离子交换色谱IEC，亲和色谱AC，体积排阻色谱SEC)的技术。这些不同的过程步骤的组合是可变的，在某些情况下，不同的纯化方法可以用于相同的目的。此外，采用benzonase/M-SAN HQ中盐核酸酶降解污染的DNA或者用于下游的一个步骤，或者用于病毒生产阶段。M-SAN HQ中盐核酸酶用在生产工艺流程中，在生理盐条件下去除双链及单链的DNA及RNA。北京M-SAN HQ中盐核酸酶70950-160
M-SAN HQ中盐核酸酶不含动物源成份，无蛋白酶活性；陕西ArcticZymes中盐核酸酶70950-160
在不同的盐浓度条件下，AAV病毒载体的存在形式不同。低盐浓度条件下，AAV病毒颗粒表面会通过电荷作用等非特异结合到HCD上，从而产生病毒颗粒团聚现象。随着溶液盐浓度上升，AAV病毒颗粒与HCD的离子相互作用会被破坏，AAV病毒颗粒会逐渐解离。当盐浓度升到更高范围（>400mM左右），AAV病毒颗粒与HCD的结合更弱，AAV颗粒更稳定。因此，在高盐浓度溶液中，AAV颗粒更加稳定，且有数据表明高盐浓度不会削弱AAV的侵染能力。所以，我们推荐提高AAV病毒生产中的盐浓度。陕西ArcticZymes中盐核酸酶70950-160
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