一直以来，病毒基因组测序都是疾病诊断、流行病学调查和宿主-病原关系研究的重要手段。病毒的全基因组测序以及对应的生物信息学分析方法是研究病毒进化、毒力因子变异、疫病爆发之间的关系、疫病传播途径、不同遗传变异的分布模式、疫病发生地理区域的基础。与传统Sanger测序相比，NGS技术的发展使得一个小的研究小组可以拥有大量病毒株的全基因组序列，测序成本也在逐步降低。由于NGS产生的数据量非常庞大，其序列拼接难度也随之增加。而且对于低浓度高复杂度的样本，研究者除了PCR外别无他法。而PCR方法往往具有偏好性，丢失的片段将为序列组装带来非常高的失败率。对于完全未知的样本，无法通过PCR进行富集，要鉴定其种类需要调用各种方法，逐个尝试，工作量之大，其效率之低，使得一个新的研究方法的出现及其必要。病毒全基因组测序具有的特点：独有的一定定量技术，实现病原定量分析。DNA病毒序列测序哪家好
对病毒的全基因组进行测序时，生物信息学分析工作的进行：生存环境和状态决定病毒的状态，病毒的全基因组测序的下机数据一般都伴随大量的宿主和其他微生物的数据。探普生物基于该特点，优化了自有数据库，搭载了专门用的的生物信息学分析流程，可处理复杂背景下的目标物种序列。探普生物基于该特点，优化了自有数据库，专门搭载了生物信息学分析流程，可处理复杂背景下的目标物种序列。生物信息学流程主要包括对非目标数据进行去除以及对目标序列进行筛选，高质量高完整度的序列拼接以及后续的高级分析，如SNP分析，进化分析，耐药位点分析等。在探普的专门用的流程下，可以获得完整性很高的基因组序列。RNA病毒深度测序检测对病毒的全基因组进行测序主要是通过非特异性扩增+克隆结合sanger测序来完成。
哪些应用场景需要对病毒的全基因组进行测序呢？在探普生物长时间运行过程中，我们接触到的对病毒的全基因组进行测序项目有比较丰富的应用场景。先，从事基因进化/疫苗/药品/抗体研制方向的研究的研究者一定会用到测序。这种场景一般是用密集的sanger测序监测某几个关键基因，搭载一定频率的全基因组测序。这样的组合省时省力省经费，同时能达到研究目的。此外，有的单位需要对传染病的病原进行流行病学监测和研究，如疾控/疫控中心、医院的传染病科室以及一些高校和研究所的相应课题组，可能需要对病毒的全基因组进行测序以后，结合其他上下游的研究数据，达到研究或者监测疫病的目的。
病毒的蛋白组成的特点是什么？（1）结构蛋白由病毒的基因组编码，结构蛋白组成病毒体的蛋白成分如病毒体的衣壳蛋白、基质蛋白和包膜蛋白。（2）非结构蛋白由病毒的基因组编码，但非结构蛋白不参与病毒体构成的蛋白成分。非结构蛋白可存在于病毒体内，如病毒的酶就属于非结构蛋白，也可存在于侵染细胞。病毒结构蛋白有以下几种功能：①病毒结构蛋白可保护病毒核酸，避免环境中的核酸酶和其他理化因素对病毒核酸造成破坏；②病毒结构蛋白可参与病毒的侵染过程，衣壳蛋白和包膜上的蛋白突起能吸附至易感细胞受体，引起侵染；③具有抗原***毒基因编码的衣壳蛋白和包膜蛋白具有良好的抗原性，能刺激机体产生免疫反应。探普生物优化了自有数据库。
高通量基因组测序中，什么是测序深度和覆盖度？测序深度是指测序得到的总碱基数与待测基因组大小的比值。假设一个基因大小为2M，测序深度为10X，那么获得的总数据量为20M。覆盖度是指测序获得的序列占整个基因组的比例。由于基因组中的高GC、重复序列等复杂结构的存在，测序终拼接组装获得的序列往往无法覆盖有所的区域，这部分没有获得的区域就称为Gap。例如一个细菌基因组测序，覆盖度是98%，那么还有2%的序列区域是没有通过测序获得的。在探普生物进行病毒基因组测序是比较简单的。DNA病毒高通量测序服务
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探普生物对病毒的全基因组进行测序的实验基于二代测序技术。样本经过核酸纯化-文库构建-生物信息学分析这3大基本流程后转换成了序列数据。先，在核酸纯化环节，探普提供专门针对性的核酸纯化样本指南，以提高目的物种的核酸纯度和得率，与此同时探普生物也提供核酸纯化服务。第二，文库构建环节，样本的核酸具备浓度低，总量少的特点。探普生物专门针对这一点开发了超微量核酸文库构建，可以将0.01ng/μl甚至更低浓度的核酸构建成测序文库。第三，生物信息学分析环节。生存环境和状态决定了对病毒的全基因组进行测序的下机数据一般都伴随大量的宿主和其他微生物的数据。探普生物基于该特点，优化了自有数据库，搭载了的生物信息学分析流程，可处理复杂背景下的目标物种序列。DNA病毒序列测序哪家好
