ImpaRATOR 是一种 O-聚糖依赖性蛋白酶，可催化糖蛋白和糖肽中与糖基化丝氨酸或苏氨酸残基相邻的肽键的水解。它切割用粘蛋白型O-聚糖修饰的丝氨酸或苏氨酸残基的N-末端，包括唾液酸化物种。粘蛋白型O-聚糖是ImpaRAT活性所必需的，该酶不会消化未修饰的丝氨酸或苏氨酸残基，也不会在糖蛋白的N-糖基化位点。该酶接受 O-聚糖结构，包括唾液酸化he心 1 和he心 2 结构以及 Tn 抗原。Genovis的ImpaRATOR 来源于铜绿假单胞菌，在大肠杆菌中表达。该酶含有 His 标签，分子量为 97 kDa。将依那西普与GalactEXO固定化孵育60分钟。浙江用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究
当在完整状态下进行分析时，EPO的聚糖异质性导致了非常复杂的质谱图。通过在 37°C 下在 OmniGLYZOR Microspin 柱上孵育 1 小时，可以有效地去除 N 糖（含有PNGase F酶）和 O-糖，如对应于未修饰蛋白质的单个峰所示。EPO上残留了少量用乙酰化唾液酸修饰的O-聚糖，因为OmniGLYZOR对这种结构的水解效率低下。根据制造商Genvois的建议（在37°C下进行O/N孵育），两种底物蛋白也用另一种市售的去糖基化产物处理，并显示数据以供比较。另一方面，N-聚糖在内质网中翻译地连接到未折叠的蛋白质上。这导致某些 N-糖基化位点难以被 Genovis的PNGase F 接近，或者一旦底物蛋白折叠成其天然状态，就根本无法接近。因此，这种N-聚糖的水解需要底物蛋白以与酶活性相容的方式变性。湖北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶瑞典GenovisOglyZOR以冻干粉的形式提供，装在 2000 个单位的小瓶中，用于在 2 mg 糖蛋白上水解he心 1 O-聚糖。
Genovis的ImpaRATOR™ 可用于多种 O-聚糖：依那西普是一种融合蛋白，由TNF受体的胞外结构域与人IgG1的Fc部分相连。该蛋白质在Fc区域上方含有多达13个O-糖基化的Ser/Thr残基簇，使其成为一种非常难以在结构上表征的生物制药。为了证明ImpaRATOR的聚糖特异性，制备了三种具有不同聚糖组成的依那西普样品：（i）携带单唾液酸和二唾液酸化he心1结构混合物的未经处理的糖蛋白，（ii）用SialEXO处理的糖蛋白去除唾液酸并产生裸核1结构，以及（iii）用SialEXO和GalactEXO处理的糖蛋白产生单个GalNAc残基， 也称为Tn抗原。用ImpaRATOR和FabRICATOR在一锅反应中处理三个样品（图1）。作为比较，SialEXO处理的依那西普用OpeRATOR和FabRICATOR处理。将所得肽还原、烷基化并用HILIC-MS进行分析。FabRICATOR被包括在反应中，以将Fc区与大多数C端糖肽分离，以促进其表征。
我们测量了FucosEXO从一组dai表不同键的不同寡糖底物中释放的岩藻糖。FucosEXO可有效释放α1-2、α1-3和α1-4连接的岩藻糖，对α1-6连接的岩藻糖残基没有活Genovis的FucosEXO的底物特异性：岩藻糖以不同的键存在于N-和O-聚糖上。α1-2、α1-3 和 α1-4 连接的岩藻糖常见于 O-聚糖中，并作为 N-聚糖的天线岩藻糖基化，而 α1-6 连接的岩藻糖被发现是 N-聚糖he心的修饰。β1-3,4半乳糖的水解：Genovis的GalactEXO 是一种β-半乳糖苷酶混合物，可水解 N-和 O-糖基化蛋白中的 β1-3,4-连接末端半乳糖。倍笃生物代理多条产品线，用于聚糖分析用酶、ADC偶联技术、QED抗体对、AAV中和抗体、IdeS蛋白酶等。
由于蛋白质的O-糖模式的异质性和O-糖结构的OpeRATOR特异性，形成了重叠的肽，从而可以获得O-糖位点的完整图谱为了进行比较，相同材料的标准胰蛋白酶消化物， 显示难以分析的少量且非常大的糖肽。使用Genovis的OpeRATOR进行O-糖位点定位：OpeRATOR 是一种 O-聚糖特异性蛋白酶，可消化丝氨酸和苏氨酸糖基化位点的粘蛋白型 O-糖蛋白 N 端。这会产生携带O-糖的糖肽，并能够使用质谱法进行O-糖分析、O-糖肽图谱以及中级分析。下面是OpeRATOR消解位点的示意图。GalNAcEXO冻干剂以冻干粉末的形式提供，装在2000单位的小瓶中，用于水解2mg糖蛋白上的GalNAc残基。湖北冻干粉形式PNGaseF去糖基化酶瑞典Genovis
GalNAcEXO酶是可降低样品异质性，用于分析携带α连接的 GalNAc 残基作为未成熟截短he心 1 的复杂 O-糖蛋白。浙江用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究
为了研究 OglyZOR 对天然糖蛋白的活性，将该酶与依那西普、TNFR 和阿巴西普在 37°C 下有或没有 SialEXO 孵育 1 小时。当唾液酸被去除时，OglyZOR酶有效地水解了所有三种底物中的O-聚糖。Genovis的OglyZOR 酶可有效水解天然糖蛋白中的he心 1 二糖 （Gal-β1,3-GalNAc）。这使得这些酶适合在LC-MS分析之前制备样品，以鉴定其他PTM或确认氨基酸序列O-糖基化生物制药的全去糖基化：O-糖基化生物制药（如依那西普）很难表征。为了能够通过质谱法测定完整质量数，我们进行了酶促总去糖基化。N-聚糖被Genovis的PNGase F裂解，而O-聚糖可以与OglyZOR和SialEXO一起去除。。浙江用于自动化系统的96孔板形式PNGaseF去糖基化酶糖生物学研究
GalNAcEXO固定化离心柱含有与琼脂糖珠共价偶联的GalNAcEXO酶，用于水解糖蛋白上的Gal...
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