1991年提出环境基因组学（environmentalgenomics）的概念，同年构建了个通过克隆环境样品中DNA的噬菌体文库。1998年美国国立环境卫生科学研究所启动了环境基因组计划（environmentalgenomeproject，EGP），开展有关人体遗传变异与环境胁迫相互关系的研究。环境基因组学次提出特定生态条件下，全部生物基因组总体概念，这是基因组学的重要进展。1998年提出生命研究对象应是生物环境中全部微小生物的基因组，提出针对特定环境样品中细菌和的基因组总和进行研究的这一宏基因组(metagenome)概念2007年3月，美国国家科学院以“环境基因组学新科学——揭示微生物世界的奥秘”为题发表咨询报告，指出宏基因组学为探索微生物世界的奥秘提供新的方法，这是继发明显微镜以来研究微生物方法的重要进展。 应对全球性挑战（如环境污染、疾病防控等）具有重要意义。差异微生物宏基因组测序
宏基因组学还可以用于研究微生物的代谢途径和生态功能。宏基因组测序技术的发展也带来了一些挑战。例如，如何从大量的测序数据中准确地识别和注释微生物基因，如何分析微生物群落的复杂性和动态变化等。为了解决这些问题，需要发展新的数据分析方法和算法。为了促进宏基因组学的发展，国际上已经建立了一些大型的宏基因组研究项目和数据库。例如，美国国立卫生研究院的人类微生物组计划（Human Microbiome Project）旨在研究人类体内的微生物群落，以及它们与健康和疾病的关系。高通量测序 英文基于测序的宏基因组，也提供了一种基于群落功能、群体功能差异化比较以及功能菌株搜寻探索的一种方法。
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宏基因组测序技术是一种快速发展的高通量测序技术，广泛应用于微生物群落研究领域。通过对微生物群体中所有基因进行测序，宏基因组测序技术可以帮助科研人员了解微生物群落的组成结构、功能潜力以及与环境之间的相互作用。这种技术的突出优势在于能够揭示微生物群体中潜在的未知物种和功能基因，为生态环境的研究提供重要的支持。通过宏基因组测序技术，科研人员可以探索微生物在不同环境条件下的适应性和响应机制，从而为环境保护、生物资源利用以及疾病防控提供新的理论基础和技术手段。未来，随着宏基因组测序技术的不断创新和普及，相信将为微生物学、生态学和医学等领域的研究带来更多的突破和发展。它通过测序环境中的所有遗传物质来揭示微生物的多样性。
广义宏基因组是指特定环境下所有生物遗传物质的总和，它决定了生物群体的生命现象。它是以生态环境中全部DNA作为研究对象，通过克隆、异源表达来筛选有用基因及其产物，研究其功能和彼此之间的关系和相互作用，并揭示其规律的一门科学狭义宏基因组学则以生态环境中全部细菌和基因组DNA作为研究对象，它不是采用传统的培养微生物的基因组，包含了可培养和还不能培养的微生物的基因，通过克隆、异源表达来筛选有用基因及其产物，研究其功能和彼此之间的关系和相互作用，并揭示其规律可获得环境微生物基因信息总和。高通量测序 英文
对宏基因组的深入研究将为解决全球性问题提供重要的科学依据。差异微生物宏基因组测序
宏基因组测序是一项极具创新性和影响力的技术。它仿佛是一把神奇的钥匙，开启了我们对微生物世界的深入认知之门。通过宏基因组测序，我们能够、无偏地分析环境中复杂多样的微生物群落。无论是土壤、水体还是人体内部，都能被清晰呈现。它帮助我们发现新的微生物物种，理解微生物之间的相互作用以及它们与生态系统的关系。在医学领域，宏基因组测序为疾病诊断和提供了新思路。这项技术正带领着我们在微生物学研究中不断前进，为解决诸多科学问题和实际应用带来无限可能。差异微生物宏基因组测序
