结合了抗体的磁珠或树脂（Beads）与样本裂解液孵育，通过”抗原-抗体“之间的免疫作用，诱饵蛋白被吸附在Beads上，与此同时，诱饵蛋白的互作蛋白，也一起“共沉淀”到Beads上。洗涤去掉未结合的蛋白后，再用洗脱缓冲液将互作蛋白复合物从Beads上洗脱下来，得到免疫共沉淀（Co-IP）产物。Co-IP产物既可以用WesternBlot检测已知蛋白，也可以用质谱鉴定未知蛋白。当没有合适的诱饵蛋白抗体时，还可以通过表达融合了Flag标签的诱饵蛋白，利用Flag标签抗体做免疫沉淀。即样本过表达Flag-Bait，经裂解后与anti-Flag珠子孵育，诱饵融合蛋白与Beads结合，其互作蛋白“共沉淀”到Beads上，再经洗涤、洗脱后，用WB或质谱检测。Co-IP实验检测：制备样品、裂解细胞、免疫沉淀、WB检测！四川免疫沉淀检测CoIP-mass spectrometry
Co-IP技术作为研究蛋白质相互作用的重要手段，其结果在多数情况下是可靠的。然而，该技术也存在一些潜在的限制和影响因素，需要研究人员予以注意。在实际应用中，由于细胞内蛋白质种类繁多且相互作用复杂，可能会出现非特异性结合或背景噪声，这要求研究者选择特异性强的抗体，并通过洗涤步骤去除杂质。此外，样品的纯度、抗体的质量和实验条件等也会对结果产生影响，因此，对抗体的选择和验证、样品的准备以及实验条件的控制都至关重要。为了进一步提高结果的准确性，研究人员通常会结合多种方法进行相互验证，如使用不同抗体或实验条件重复实验，或结合质谱技术来验证Co-IP的结果。这些措施共同增强了Co-IP技术结果的可靠性。北京蛋白蛋白互作检测CoIP Mass检测免疫共沉淀是研究蛋白质相互作用的方法，可用于确定候选或未知蛋白的相互作用，并可通过WB或质谱检测。
对于Co-IP实验初学者，常遇到的“坑”主要有：首先，抗体选择至关重要。选择特异性不强或亲和力低的抗体，可能导致非特异性结合，干扰实验结果。因此，选择经过验证的高质量抗体是关键。其次，实验操作规范不容忽视。细胞裂解不充分、洗涤不当等都会影响蛋白复合物的纯化，进而影响实验结果。初学者应严格按照步骤操作，确保每一步都精确无误。再者，结果解读需谨慎。初学者可能因经验不足，误将非特异性结合视为真实相互作用。因此，解读结果时，需结合其他实验方法如Western Blot进行验证。另外，实验安全不可忽视。遵守实验室规章制度，注意个人防护和实验室卫生，是确保实验顺利进行的基础。综上所述，初学者在进行Co-IP实验时，应关注抗体选择、实验操作、结果解读和实验安全等方面，通过不断学习和实践，逐渐积累经验，避免常见错误。
CoIP实验细胞的收集及裂解方法：
收集2E7个细胞样品，加入PBS洗涤细胞，离心后弃上清收集细胞沉淀。
准备500μl预冷的CellLysisBuffer,分别加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF，混匀后加进细胞沉淀中吹打均匀，冰上孵育30min，期间涡旋混匀几次。
4℃,12000rpm离心10min，取上清，进行蛋白浓度测定及后续实验。
CoIP实验免疫复合物的制备：
在离心管中，将每个样品的细胞裂解液与2-10μg免疫沉淀抗体结合。每个免疫沉淀反应推荐的总蛋白量为500-1000μg，由PierceBCAProteinAssay蛋白浓度检测试剂盒测定。
用免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液将抗体/裂解液稀释至500μL。
在室温下孵育1-2h，或4℃过夜，以形成免疫复合物。 Co-IP内源检测验证蛋白互作，结果可靠需严控条件，抗体特异、洗涤充分是关键！
CoIP-Mass和CoIP-WB优劣势：优势：高通量获得目的蛋白的专属蛋白互作库。劣势：CoIP的蛋白库鱼龙混杂，包含目的蛋白的直接/间接互作蛋白，非特异结合，残留蛋白。常规理想IP-Mass项目可鉴定到1000-2000个蛋白，其中绝大部分是非特异性结合及清洗残留的背景蛋白，导致CoIP-Mass假阳性高，CoIP-WB验证成功率低，导致研发进展反复跌宕，时间和经费成本占用较大，严重影响士气。其次，项目受限于蛋白表达量和IP抗体有效性，达到理想状态的CoIP-Mass较难，同时分析门槛较高。因此，该项目成功实施，比较依赖成熟和有分析经验的团队。建议整包交给专业的服务商开展检测。入门Co-IP实验，需理解原理、选对抗体、处理样本、严控操作，安全细心，不断积累经验！四川免疫沉淀检测CoIP-mass spectrometry
Co-IP技术持续创新，提升灵敏度和高通量，助力蛋白互作研究！四川免疫沉淀检测CoIP-mass spectrometry
CoIP免疫共沉淀技术原理及应用：
免过疫共沉淀技术是一种研究两种蛋白在体内是否存在相互作用的有效方法，通过抗体和已知蛋白结合，从而捕获整个已知蛋白复合物，进而研究复合物中与已知蛋白存在相互作用的蛋白。
原理:CO-IP在IP基础上，通过特定抗体沉淀出与目标蛋白相互作用的蛋白质，揭示蛋白质间的相互关系。
作用:检测2个蛋白是否在体内。
应用:可用于构建蛋白质相互作用的网络，发现目标蛋白的结合伙伴。适用于鉴定特定蛋白质的相互作用伙伴，有助于了解蛋白质功能和信号传导。 四川免疫沉淀检测CoIP-mass spectrometry
