Co-IP（免疫共沉淀）技术的基本原理是利用抗原与抗体之间的专一性作用，将特定蛋白质及其与之相互作用的蛋白质一同沉淀下来。这种技术常用于研究蛋白质之间的相互作用和复合物形成。在Co-IP实验中，研究人员首先会制备针对目标蛋白的特异性抗体，并将其与固相载体偶联。然后，将含有目标蛋白及其相互作用伙伴的细胞或组织裂解液与抗体-载体复合物混合。由于抗体与目标蛋白之间的特异性结合，目标蛋白及其相互作用伙伴会被固定在抗体-载体复合物上。接下来，通过洗涤步骤去除非特异性结合的杂质，以确保沉淀下来的蛋白质复合物是特异性的。然后，使用适当的洗脱缓冲液将目标蛋白及其相互作用伙伴从抗体-载体复合物上洗脱下来，以便进行后续的分析和检测。在CoIP（免疫共沉淀）实验对照组的设计。湖南免疫共沉淀检测CoIP质谱
Co-IP实验的外源检测是一种通过引入外源表达的蛋白来验证蛋白质间相互作用的方法。与外源检测相对的是内源检测，即检测细胞内自然状态下蛋白质间的相互作用。在外源检测中，研究者通常会在细胞中转染含有特定基因的质粒，使该基因在细胞内过量表达，从而产生大量的外源蛋白。然后，利用特异性抗体对这些外源蛋白进行免疫共沉淀（Co-IP），并通过Western Blot等技术检测与其相互作用的蛋白是否也被沉淀下来。这种方法有助于验证蛋白质间的相互作用，并确定相互作用的具体条件或影响因素。同时，由于外源蛋白的表达量较高，因此外源检测通常比内源检测更为敏感，更容易检测到较弱的相互作用。然而，需要注意的是，外源检测的结果可能受到多种因素的影响，如外源蛋白的表达水平、转染效率、细胞状态等。因此，在进行外源检测时，需要严格控制实验条件，确保实验结果的准确性和可靠性。同时，为了更好地了解蛋白质间的相互作用，通常需要结合内源检测和外源检测的结果进行综合分析。湖南免疫共沉淀检测CoIP质谱Co-IP技术虽广泛应用，但受抗体特异性、低丰度蛋白、样品制备和瞬时互作等限制，需结合其他方法验证！
CoIP实验细胞的收集及裂解方法：
收集2E7个细胞样品，加入PBS洗涤细胞，离心后弃上清收集细胞沉淀。
准备500μl预冷的CellLysisBuffer,分别加入5μlProteaseInhibitor、5μlPMSF，混匀后加进细胞沉淀中吹打均匀，冰上孵育30min，期间涡旋混匀几次。
4℃,12000rpm离心10min，取上清，进行蛋白浓度测定及后续实验。
CoIP实验免疫复合物的制备：
在离心管中，将每个样品的细胞裂解液与2-10μg免疫沉淀抗体结合。每个免疫沉淀反应推荐的总蛋白量为500-1000μg，由PierceBCAProteinAssay蛋白浓度检测试剂盒测定。
用免疫沉淀裂解/漂洗缓冲液将抗体/裂解液稀释至500μL。
在室温下孵育1-2h，或4℃过夜，以形成免疫复合物。
免疫沉淀(IP)的原理及应用：
免过疫沉淀技术是以抗体和抗原之间的专一性作用为基础，用于研究蛋白质相互作用、蛋白质与遗传物质之间相互作用的经典方法，可有效确定两种蛋白质在完整细胞内生理性相互作用，也是用于抗原检测和纯化的方法之一。CO-IP、CHIP、RIP等技术由IP演化而来。
原理:IP利用特定抗体与目标蛋白结合，将其从混合物中沉淀出来，实现蛋白的纯化与鉴定。
作用:富集和检测某单一蛋白。
应用:主要用于蛋白质-蛋白质相互作用研究，帮助分析蛋白质复合物的组成。IP侧重于研究蛋白质复合物，适用于探究特定蛋白质的结合伙伴以及信号通路的研究。 CoIP实验技术重复和生物重复设计建议。
CoIP-Mass和CoIP-WB检测要点：
抗体关键质控：抗体特异性和亲和效价要求高，尽量采用标签抗体或经过CoIP效果验证的抗体。抗体质量参差不齐（WB能检测到预期条带不到1/2，能检测到良好结果的不到1/4）和存在非特异性结合（几乎所有的抗体都存在非特异结合，部分非特异结合条带远大于目的条带），CoIP-MS需做WB和CoIP-WB质控。初次和检测CoIP都需要做WB质控。正式CoIP可同时增加考染/银染质控。抗体可参考数据库（ValidatedAntibodyDB,)。 免疫共沉淀法证实蛋白互作，基于抗体专一性，揭示生理性相互作用。湖南免疫共沉淀检测CoIP质谱
免疫共沉淀实验：样品处理、抗体处理、共沉淀、洗涤及鉴定，一气呵成！湖南免疫共沉淀检测CoIP质谱
Co-IP技术虽然广泛应用于蛋白质相互作用的研究，但也存在一些局限性。首先，Co-IP技术的结果可能受到抗体特异性的影响。如果抗体与目标蛋白的结合不够特异，可能导致非特异性蛋白的共沉淀，增加背景噪声。其次，Co-IP技术可能无法检测到低丰度的蛋白质相互作用，因为低丰度蛋白在细胞裂解液中的浓度较低，难以形成稳定的复合物。此外，Co-IP技术还受到样品制备和实验条件的影响。样品中的杂质、降解产物或酶活性等因素都可能干扰实验结果。另外，Co-IP技术只能检测到在细胞裂解时存在的蛋白质相互作用，对于瞬时或动态的相互作用可能无法准确捕捉。因此，在使用Co-IP技术时，需要注意这些局限性，并结合其他实验方法和验证手段，以获得更准确的蛋白质相互作用结果。湖南免疫共沉淀检测CoIP质谱
