QuantSeq-Flex**链合成模块:QuantSeq-Flex**链合成模块可在QuantSeq 操作流程中,允许反转录引物与 靶向特异性引物进行交换。如果需要,它还可以用QuantSeq 3'mRNA试剂 盒制备更长的文库。*适用于QuantSeq FWD试剂盒(货号015)。
货号、产品描述和规格如下:026.96QuantSeq-Flex First Strand Synthesis Module for Illumina,96 preps96
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Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7096):96孔板中有96个6碱基的 i7 index(用于Illumina平台),可用于QuantSeq,和 CORALL试剂盒。
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QuantSeq-Flex靶向RNA-Seq文库构建试剂盒V2:QuantSeq-FlexRNA-Seq文库构建试剂盒V2是一个非常灵活的靶向建库试剂盒,使用者可用定制引物进行**链和/或第二链合成,因此可进行靶向测序。同时在定量测序中,每个转录本只生产一个片段,确保定量结果准确。产品优势:试剂盒应用灵活,可用于靶向测序;>100多重引物的靶向文库构建;每个转录本只生成一个片段—对基因表达精确定量;识别已知和未知融合转录本;只需;节省测序成本,Dualindex兼容多达9,216种组合(i5/i7组合)。工作流程:使用QuantSeq-Flex靶向RNA-seq文库构建试剂盒,根据使用的引物类型,可生成四种不同的文库:1)Oligo(dT)用于**链合成,随机引物用于第二链合成(QuantseqFWD);2)Oligo(dT)用**链合成,特异性靶向引物用于第二链合成(靶向3’mRNA-Seq);3)特异性靶向引物用于**链合成,随机引物用于第二链合成(靶向RNA-seq,可用于发现新的融合基因);4)特异性靶向引物用于**链及第二链合成(靶向RNAseq,只检测已知目标基因)。
SLAM-ITseq:确定哺乳动物体内特定组织和细胞类型的基因表达:对于该应用,将4-Thiouracil(不是SLAMseq中的S4U)注射到转基因生物体中,例如*在特定细胞类型中表达尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)的小鼠中,新合成RNA*在该细胞类型中被标记,然后提取纯化RNA,***进行标准SLAMseq分析。可根据RNAseq数据中碱基的转换信息,对体内特定组织和细胞类型的基因表达进行定量(Matsushimaetal.,2018)。SLAMseq合成代谢动力学试剂盒模块包含SLAM-ITseq所需的组分(4-Thiouracil除外),同时SLAMdunk软件与SLAM-ITseq数据兼容,可对其进行分析。 云生物销售的Lexogen试剂盒拥有完善的售后服务。
Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒:QuantSeq-Pool加快基因表达项目研究。LexogenQuantSeq-Pool结合了早期样本barcode标记和3'mRNA-Seq的所有的优点(图1)。因此,QuantSeq-Pool极大地增加了混样的能力,并且高度精简的流程减少了手动操作时间、耗材和测序的费用。通量灵活,适用于大规模的通量项目。在文库扩增步骤中,可通过在文库的i5和i7位置引入额外的UDIindex,以获得更高的通量。稳定的基因检测性能,即使非常浅的测序深度。高通量筛选项目需要在较低的测序深度也可获得稳定且可靠的基因表达谱。QuantSeq-Pool可以可靠地检测到7500至9000个高表达基因,每个样本测序深度为100K至1M。这种高灵敏度在8个重复中是一致的,这归功于早期pooling和批处理减少技术误差。因此,在更低或相同成本下,可增加更多的重复样本以获得更加可信的异基因表达。 使用Lexogen试剂盒的好处您了解多少呢?北京QuantSeq-Flex第二链合成模块Lexogen试剂盒哪家好
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SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:数据分析:将spike-inRNA-seq实验的数据统一比对到参考基因组以及SIRVome(人工“基因组”涵盖标准品的详细序列和注释信息)上。常规和定制的生物信息学工具可从不同维度对检测的结果和预期的SIRVreads分布进行比较,如从原始reads的比对到转录本鉴定及定量。在“Galaxy”环境中使用已经发表的软件工具以及算法,能够在**的“SIRVSuite”中实现示例性数据评估的工作流程()。它可以为单个SIRV实验以及实验间的比较提供设计和评估。为了评估RNA测序中的ERCC测序数据,NIST提供了名为“ERCCdashboard”5的软件包,并且在SEQC/MAQC-III协会的出版物中对其做了进一步的评估。数据分析的质量测定包括准确度和精度以及偏差系数,衡量实测和预期之间的偏差。虽然在方法开发过程中监控***排序非常重要,但实验数据比较的关键参数不是实验中偏差的程度,而是偏差的一致性。可以基于SIRV的复杂性来确定实验之间的偏差。这些分析的结论有助于判断数据之间是否具有可比性,并且有助于设置实验固有偏差的基线,了解样本之间的技术差异是提出有意义的生物学问题的先决条件。 山东RNA质控标准品Lexogen试剂盒价格