SLAMseq代谢标记试剂盒:SLAM-ITseq:监测体内RNA的运输。组织特异性表达的尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)和基于4-Thiouracil标记的RNA也可用于监测组织间RNA的运输(Sharmaetal.,2018).SLAMdunk–SLAMseq数据分析软件:Lexogen可以为客户提供对SLAMdunk1的访问,可定制化分析来自QuantSeq3'mRNA-Seq文库的SLAMseqRNA-Seq数据。用户在Bluebee®Genomics平台上使用SLAMdunk软件可以很容易的对SLAMseq实验数据进行分析。只需上传压缩的fastq文件并选择适当的物种即可。处理数据之后,SLAMdunk可获得T>C转换率统计数据,以及比对到3'UTR区域的统计数据,然后可以从Bluebee®平台下载结果。SLAMseq,QuantSeq和SLAMdunk为高通量时间分辨RNA-Seq实验提供了完整且友好的解决方案。 上海Lexogen试剂盒批发推荐云生物。浙江链合成Lexogen试剂盒哪家好
SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:数据分析:将spike-inRNA-seq实验的数据统一比对到参考基因组以及SIRVome(人工“基因组”涵盖标准品的详细序列和注释信息)上。常规和定制的生物信息学工具可从不同维度对检测的结果和预期的SIRVreads分布进行比较,如从原始reads的比对到转录本鉴定及定量。在“Galaxy”环境中使用已经发表的软件工具以及算法,能够在**的“SIRVSuite”中实现示例性数据评估的工作流程()。它可以为单个SIRV实验以及实验间的比较提供设计和评估。为了评估RNA测序中的ERCC测序数据,NIST提供了名为“ERCCdashboard”5的软件包,并且在SEQC/MAQC-III协会的出版物中对其做了进一步的评估。数据分析的质量测定包括准确度和精度以及偏差系数,衡量实测和预期之间的偏差。虽然在方法开发过程中监控***排序非常重要,但实验数据比较的关键参数不是实验中偏差的程度,而是偏差的一致性。可以基于SIRV的复杂性来确定实验之间的偏差。这些分析的结论有助于判断数据之间是否具有可比性,并且有助于设置实验固有偏差的基线,了解样本之间的技术差异是提出有意义的生物学问题的先决条件。 天津RiboCop细菌核糖体去除试剂盒Lexogen试剂盒销售云生物销售的Lexogen试剂盒质量上乘。
SLAMseq代谢标记试剂盒:SLAM-ITseq: 确定哺乳动物体内特定组织和细胞类型的基因表达。对于该应用,将4-硫尿嘧啶(4-Thiouracil,不是LAMseq中的S4U)注射到转基因生物体中,例如*在特定细胞类型中表达尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)的小鼠中,新合成RNA*在该细胞类型中被标记,然后提取纯化RNA,***进行标准SLAMseq分析。可根据RNA -seq数据中碱基的转换信息,对体内特定组织和细胞类型的基因表达进行定量(Matsushima et al.,2018)。 SLAMseq合成代谢动力学试剂盒模块包含SLAM-ITseq所需的组分(4-Thiouracil除外),同时SLAMdunk软件与SLAM -ITseq数据兼容,可对其进行分析。
SmallRNA文库构建试剂盒:性能表现:与其他竞品相比,Lexogen small RNA建库试剂盒检出miRNA能力***,尤其在低起始量的时候。高灵敏度使其高度适用于具有挑战性、低含量的RNA样本,如液体活检(血浆、血清和尿液)以及外泌体。此外本试剂盒重现性***,不同的input量的结果也表现出超高的相关性。Lexogen small RNA文库构建试剂盒可以检测到更多的miRNA,尤其是在RNA低input量的情况下。以血浆RNA为样本,input量分别为6pg,60pg以及600pg,用4种不同试剂盒进行文库构建,对所得到的文库进行测序,每个样本获得相同的reads数约-2M,比较4种试剂盒检测到的总miRNA数量。在≥5个原始reads水平下,LexogensmallRNA-S文eq库构建试剂盒检测到更多的miRNA,尤其是在input量较低的情况下。 云生物主做Lexogen试剂盒的批发销售。
QuantSeq-Flex第二链合成模块 V2:QuantSeq-Flex第二链合成模块V2,在QuantSeq操作流程中随机的第二链合成引物可以被靶向特异性引物取代。*适用于QuantSeq FWD试剂盒(货号 015)。
货号、产品描述和规格如下:028.96QuanSeq-Flex Second Strand Symthesis Module for Illumina,96 preps96
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Mix2 RNA-Seq 数据分析软件:Mix2 (Mix-Square)通过RNA-Seq数据中的位置覆盖偏差,来准确计算出基因isoform的丰度。使用Mix2进行isoform定量是可重复跨变量条件的,并可准确检测差异表达。
优势:
l 准确评估转录本浓度;
l 不同测序设备、文库制备和各种降解类型RNA,丰度评测的结果都可重复;
l 准确检测差异表达;
l 可以对RNA测序中的数据偏差类型进行检测并归类;
l 运算速度超快,且占用内存小。
工作原理:RNA测序中isoform定量的准确性和重复性,受RNA测序数据中的片段偏差的影响。Mix2没有对覆盖偏差做出任何假设,而是将混合模型与每个基因的isoform数据进行拟合。因此,Mix2可以准确地表现5'偏差,而Cufflinks软件**于均匀分布。 浙江链合成Lexogen试剂盒哪家好