Quant-seq表达谱文库构建试剂盒:Performance:3’端链特异性比对:以FDA提供的测序质控(SEQC)标准样品A和B为样本(A和B分别是ERCC外源RNA与有参RNA的混合物1和混合物2)1,2,用QuantSeq试剂盒进行文库构建,测序数据与近期生物分子资源设施协会(ABRF)发布的NGS研究中的mRNA-Seq数据组比对3。在标准mRNA-Seq中,测序Reads覆盖转录本的全长,而QuantSeq的Reads*覆盖转录本的3’端()。在该例子QuantSeq在精确的检测基因表达水平的同时,节省了大于90%的测序深度。由于spike-in转录本*来源于正义链的转录,因此链特异性的评估可以不依赖于于任何基因组注释。在各种情况下均显示出高于,而两个被评估的mRNA-SeqSEQC数据集(datasets)链特异性*分别为。QuantSeq可降低噪音,能够实现准确检测及定量反义转录本。QuantSeq量化范围宽--6个数量级:为了分析QuantSeq的基因计算准确性,用ERCC的spi-ke-in转录本覆盖reads数与input的分子数作图进行分析()。在线性模型评估和Spearman关联性评估中,QuantSeq展现出了非常高的input-output关联性和基因表达测定的准确性。 云生物专业致力于Lexogen试剂盒批发。广东PCR Add-on Kit for IlluminaLexogen试剂盒哪家好
RiboCoprRNA去除试剂盒(人/小鼠/大鼠):性能表现:RiboCop可高效地去除人类、大鼠和小鼠RNA样本中的rRNA(高达)。即使是高度降解的样本如FFPE(第3列),同样可以用RiboCop去除rRNA。通常回收率为RNAinput量的1-3%,同时高度取决于input的材料。此外,RiboCop的重复性极好。对于input量为100ng或10ng的UHRR样本,重复结果的相关性R2分别为。Lexogen的RiboCoprRNA去除试剂盒%的rRNA去除效率。RiboCop去除rRNA后,建库并在HiSeq仪器上测序。测序结果与rRNA参考序列比对,并以对应的未***rRNA的文库为参考进行定量。表格中的数据为100ng总RNA每反应的input量。UHRR—通用的人类参考RNA;HBRR—人类大脑参考RNA;mtrRNA—线粒体rRNA。 浙江RiboCop细菌核糖体去除试剂盒Lexogen试剂盒代理价格上海Lexogen试剂盒代理哪家好?
RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:RNA input范围宽、性能表现优异、转录组丰度无偏差:核糖体RNA占到细菌转录本的98%。有效去除rRNA可以大幅降低测序成本,并实现对细菌转录组的***分析。为展示RiboCop 细菌核糖体RNA 去除试剂盒的性能,用RiboCop 革兰氏阴性rRNA去除试剂盒对E. coli 的总RNA进行rRNA去除处理(input:1 ng - 1 μg)。对于所有测试input量,RiboCop有效地将rRNA reads数从98%降低到1- 3%,同时维持转录组丰度的无偏差,无脱靶效应。
SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:数据分析:将spike-inRNA-seq实验的数据统一比对到参考基因组以及SIRVome(人工“基因组”涵盖标准品的详细序列和注释信息)上。常规和定制的生物信息学工具可从不同维度对检测的结果和预期的SIRVreads分布进行比较,如从原始reads的比对到转录本鉴定及定量。在“Galaxy”环境中使用已经发表的软件工具以及算法,能够在**的“SIRVSuite”中实现示例性数据评估的工作流程()。它可以为单个SIRV实验以及实验间的比较提供设计和评估。为了评估RNA测序中的ERCC测序数据,NIST提供了名为“ERCCdashboard”5的软件包,并且在SEQC/MAQC-III协会的出版物中对其做了进一步的评估。数据分析的质量测定包括准确度和精度以及偏差系数,衡量实测和预期之间的偏差。虽然在方法开发过程中监控***排序非常重要,但实验数据比较的关键参数不是实验中偏差的程度,而是偏差的一致性。可以基于SIRV的复杂性来确定实验之间的偏差。这些分析的结论有助于判断数据之间是否具有可比性,并且有助于设置实验固有偏差的基线,了解样本之间的技术差异是提出有意义的生物学问题的先决条件。 您知道云生物的Lexogen试剂盒系列都有哪些吗?
Lexogen是一个为NGS技术提供创新性解决方案的生物公司。公司的主要专注于RNA测序技术的开发,以解决转录组的复杂性。Lexogen于2007年成立,在2013年发布了***款商业化产品。公司总部位于奥地利维也纳,北美办事处设在美国新罕布什尔州。SLAMseq Metabolic RNA Labeling Kit:通过区分新合成和已存在的RNA来分析RNA合成和降解;与Quantseq联合使用,在控制基因表达方面获取新的见解。SPLIT RNA Extraction Kit:不需要DNase,高产量,高效回收,***适用于各种分物种;可从同一个样本中纯化总RNA或小片段或大片段RNA;同样适用于血液RNA提取。QuantSeq3’mRNA-Seq Library PrepKits、QuantSeq-Flex Targeted RNA-Seq Library PrepKit:低成本基因表达谱分析-适用于低起始量,低质量以及血液样本。 Lexogen试剂盒多种系列供您选择。浙江QuantSeq-Flex链合成模块Lexogen试剂盒代理价格
Lexogen试剂盒的不同系列会有不同的优势。广东PCR Add-on Kit for IlluminaLexogen试剂盒哪家好
QuantSeq-Flex第二链合成模块 V2:QuantSeq-Flex第二链合成模块V2,在QuantSeq操作流程中随机的第二链合成引物可以被靶向特异性引物取代。*适用于QuantSeq FWD试剂盒(货号 015)。
货号、产品描述和规格如下:028.96QuanSeq-Flex Second Strand Symthesis Module for Illumina,96 preps96
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