天津LUTHOR单细胞建库试剂盒Lexogen试剂盒报价

    Quantseq有非常高的灵敏度。测序量在reads时，RNA完整性好的新鲜冷冻样本中检测到25,842个基因(数据未显示)。当单个样本测序数据量在，在新鲜冷冻样本中检测出20,081个基因，且每个基因只少有1个read；相应的，在FFPE样本中能检测到15,190个，两者有24%的差异()。但是，当阈值提高到5或者10个reads/基因时，差异分别下降至3%和1%。此对比数据表示Quantseq可在冷冻样本和FFPE样本中准确检测基因表达。两者之间在低表达基因检测存在的差异，是由于FFPE样本在处理、储存及回收过程中低拷贝转录本很容易降解至无法检测到。Quantseq用oligo(dT)引物进行逆转录，每个转录本只产生1个片段。这样能够使得无论RNA的质量如何(包含FFPE样本)都可准确定量。标准的mRNA-seq操作流程旨在覆盖整个转录本，但是在使用降解样本时将导致严重的3’偏好性。因此，相对于其他用Poly(A)分选mRNA操作流程，Quantseq3’mRNA-Seq更有效的对低质量的样本进行建库。 Lexogen试剂盒的优缺点您知道吗？天津LUTHOR单细胞建库试剂盒Lexogen试剂盒报价

QuantSeq Data Analysis：

63.02   SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform, 0-2 GB2 GB

63.06SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform, 0-6 GB6 GB

63.12SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform,   0-12 GB12 GB

63.25SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee®   Platform,   0-25 GB25 GB

090.24QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 24   runs24

091.24QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 24 runs24

093.03QuantSeq Data   Analysis   (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB

093.06QuantSeq Data   Analysis   (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB

094.03QuantSeq Data   Analysis   (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB

094.06QuantSeq Data   Analysis   (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB 上海胶提取Lexogen试剂盒代理Lexogen试剂盒的系列有很多种。

    Quant-seq表达谱文库构建试剂盒：Quantseq在低质量RNA中的表现：Quantseq在高质量和低质量（FFPE）样本中有很好的相关性：用同一来源的不同质量RNA样本进行比较，评估Quantseq适用于高度降解的样本（如FFPE样本）的能力。将人的MOLP-8**细胞系分成两份，一份进行新鲜冷冻，一份处理成FFPE样本，从而使同一个来源的样本得到不同质量的RNA。用RIN值（RNA完整度）来区分RNA的质量。RIN值大于8表示RNA质量高。对应严重降解的样本，RIN值不适用于质量的评估，因此使用DV200值（大于200nt的RN**段的分布值）来表示RNA质量。低完整度的RNA对应低DV200值。RNA提取后，FFPE样本的DV200值为87%（RIN值），冷冻样本RIN值为。使用50ng总RNA，用QuantSeqFWD试剂盒进行文库构建。FFPE样本提取的RNA，即使DV200值低至23%（数据未显示）仍能成功构建Quantseq文库。FFPE样本有对应的低质量RNA建库操作流程，对应冷冻样本，应用标准操作流程。文库在Hiseq2500上进行用1x50bp读长测序。FFPE-RNA文库和冷冻保存RNA文库的基因表达的相关性很高（R²=），表示Quantseq能在不同质量的RNA中表现稳定。

    SLAM-ITseq:确定哺乳动物体内特定组织和细胞类型的基因表达：对于该应用，将4-Thiouracil(不是SLAMseq中的S4U)注射到转基因生物体中，例如*在特定细胞类型中表达尿嘧啶磷酸核糖基转移酶（UPRT）的小鼠中，新合成RNA*在该细胞类型中被标记，然后提取纯化RNA，***进行标准SLAMseq分析。可根据RNAseq数据中碱基的转换信息，对体内特定组织和细胞类型的基因表达进行定量(Matsushimaetal.,2018)。SLAMseq合成代谢动力学试剂盒模块包含SLAM-ITseq所需的组分（4-Thiouracil除外），同时SLAMdunk软件与SLAM-ITseq数据兼容，可对其进行分析。 想要买Lexogen试剂盒？您要先了解Lexogen试剂盒的特点。

Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7096)：96孔板中有96个6碱基的 i7 index(用于Illumina平台)，可用于QuantSeq，和 CORALL试剂盒。

Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7096)：96孔板中有96个6碱基的 i7 index(用于Illumina平台)，可用于QuantSeq，和 CORALL试剂盒。

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云生物主营产品包括Lexogen试剂盒，批发价格优惠。天津LUTHOR单细胞建库试剂盒Lexogen试剂盒报价

    Quant-seq表达谱文库构建试剂盒：Performance：3’端链特异性比对：以FDA提供的测序质控(SEQC)标准样品A和B为样本（A和B分别是ERCC外源RNA与有参RNA的混合物1和混合物2）1,2，用QuantSeq试剂盒进行文库构建，测序数据与近期生物分子资源设施协会(ABRF)发布的NGS研究中的mRNA-Seq数据组比对3。在标准mRNA-Seq中，测序Reads覆盖转录本的全长，而QuantSeq的Reads*覆盖转录本的3’端()。在该例子QuantSeq在精确的检测基因表达水平的同时，节省了大于90%的测序深度。由于spike-in转录本*来源于正义链的转录，因此链特异性的评估可以不依赖于于任何基因组注释。在各种情况下均显示出高于，而两个被评估的mRNA-SeqSEQC数据集(datasets)链特异性*分别为。QuantSeq可降低噪音，能够实现准确检测及定量反义转录本。QuantSeq量化范围宽--6个数量级：为了分析QuantSeq的基因计算准确性，用ERCC的spi-ke-in转录本覆盖reads数与input的分子数作图进行分析()。在线性模型评估和Spearman关联性评估中，QuantSeq展现出了非常高的input-output关联性和基因表达测定的准确性。 天津LUTHOR单细胞建库试剂盒Lexogen试剂盒报价