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Lexogen试剂盒基本参数
  • 品牌
  • 云生物,Lexogen
  • 型号
  • 齐全
Lexogen试剂盒企业商机

    SLAMseq代谢标记试剂盒产品应用测量RNA合成及降解速率:用S4U标记小鼠胚胎干细胞,随后抽提出总RNA,烷基化,用QuantSeq3’mRNA试剂盒进行文库构建和测序。首先,用S4U标记mESCs24小时,然后用未标记的尿苷进行冲洗和尿苷终止反应(U终止反应)。测序数据用SLAMDUNK软件进行分析。RNA的周转速率决定了整个转录组。图2显示了两个基因的合成与降解典型动力学实验数据。转录因子HES1具有高的周转速率(RNA合成与降解速率高),而对于管家基因NDUFA7,它的周转速率较低。新转录RNA及总RNA差异表达谱并行分析SLAMseq可以从同一个样本中同时分析总RNA及新转录RNA的表达。为阐明标准RNA测序,稳态RNA-seq以及基于SLAMseq的代谢RNA测序之间的差异,Muhar等人在人细胞系中做了基因差异表达分析(Muharetal.,2018)。SLAMseq可***提高基因差异表达检测和定量的灵敏度()。SLAMseq可分析新合成mRNA水平来揭示抑制剂处理对转录的反应,而标准RNA-Seq却不行。因此,SLAMseq是揭示细胞反应潜在机制和药物发现研究的理想选择。 一个好的Lexogen试剂盒需要具备哪些特点您了解吗?广东CORALL Total RNA-seq文库构建试剂盒Lexogen试剂盒要多少钱

Quant-seq表达谱文库构建试剂盒建库流程:QuantSeq 表达谱建库试剂盒通过oligo dT引物特异逆转录poly(A)尾3’mRNA,第二链使用随机引物进行合成。由于插入片段的大小是由第二链合成引物和poly(A)尾之间的距离决定的,因此无需额外进行 RN**段化。随后的PCR可以提供9,216个不同的i5/i7index组合用于Illumina平台,48个index 用于Ion Torrent平台。能够实现更多样本混样测序。Lexogen提供两个版本的Illumina Quantseq 表达谱建库试剂盒,不同处在于Illumina接头序列的位置。下图绿色的是Read 1的序列,蓝色的是Read 2的序列。QuantSeq Forward (FWD) 在第二链合成的引物中包含Read 1 序列。因此,测序的方向是朝向poly(A)尾的方向。推荐使用这种方法进行基因表达的分析。如果研究关注的是转录的3’端序列或者双端测序策略,推荐使用QuantSeq Reverse (REV),Read 1 接头序列由oligo(dT)引物引入。RNA质控标准品Lexogen试剂盒报价使用Lexogen试剂盒的好处您了解多少呢?

QuantSeq-Flex靶向RNA-Seq文库构建试剂盒V2:QuantSeq-FlexRNA-Seq文库构建试剂盒V2是一个非常灵活的靶向建库试剂盒,使用者可用定制引物进行**链和/或第二链合成,因此可进行靶向测序。同时在定量测序中,每个转录本只生产一个片段,确保定量结果准确。产品优势:试剂盒应用灵活,可用于靶向测序;>100多重引物的靶向文库构建;每个转录本只生成一个片段—对基因表达精确定量;识别已知和未知融合转录本;只需;节省测序成本,Dualindex兼容多达9,216种组合(i5/i7组合)。工作流程:使用QuantSeq-Flex靶向RNA-seq文库构建试剂盒,根据使用的引物类型,可生成四种不同的文库:1)Oligo(dT)用于**链合成,随机引物用于第二链合成(QuantseqFWD);2)Oligo(dT)用**链合成,特异性靶向引物用于第二链合成(靶向3’mRNA-Seq);3)特异性靶向引物用于**链合成,随机引物用于第二链合成(靶向RNA-seq,可用于发现新的融合基因);4)特异性靶向引物用于**链及第二链合成(靶向RNAseq,只检测已知目标基因)。

Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7096):96孔板中有96个6碱基的 i7 index(用于Illumina平台),可用于QuantSeq,和 CORALL试剂盒。

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Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7096):96孔板中有96个6碱基的 i7 index(用于Illumina平台),可用于QuantSeq,和 CORALL试剂盒。 对于不同的需求我们选择不同的Lexogen试剂盒系列。

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Lexogen试剂盒的不同系列会有不同的优势。广东CORALL Total RNA-seq文库构建试剂盒Lexogen试剂盒要多少钱

    SLAM-ITseq:确定哺乳动物体内特定组织和细胞类型的基因表达:对于该应用,将4-Thiouracil(不是SLAMseq中的S4U)注射到转基因生物体中,例如*在特定细胞类型中表达尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)的小鼠中,新合成RNA*在该细胞类型中被标记,然后提取纯化RNA,***进行标准SLAMseq分析。可根据RNAseq数据中碱基的转换信息,对体内特定组织和细胞类型的基因表达进行定量(Matsushimaetal.,2018)。SLAMseq合成代谢动力学试剂盒模块包含SLAM-ITseq所需的组分(4-Thiouracil除外),同时SLAMdunk软件与SLAM-ITseq数据兼容,可对其进行分析。 广东CORALL Total RNA-seq文库构建试剂盒Lexogen试剂盒要多少钱

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