Quantseq有非常高的灵敏度。测序量在reads时,RNA完整性好的新鲜冷冻样本中检测到25,842个基因(数据未显示)。当单个样本测序数据量在,在新鲜冷冻样本中检测出20,081个基因,且每个基因只少有1个read;相应的,在FFPE样本中能检测到15,190个,两者有24%的差异()。但是,当阈值提高到5或者10个reads/基因时,差异分别下降至3%和1%。此对比数据表示Quantseq可在冷冻样本和FFPE样本中准确检测基因表达。两者之间在低表达基因检测存在的差异,是由于FFPE样本在处理、储存及回收过程中低拷贝转录本很容易降解至无法检测到。Quantseq用oligo(dT)引物进行逆转录,每个转录本只产生1个片段。这样能够使得无论RNA的质量如何(包含FFPE样本)都可准确定量。标准的mRNA-seq操作流程旨在覆盖整个转录本,但是在使用降解样本时将导致严重的3’偏好性。因此,相对于其他用Poly(A)分选mRNA操作流程,Quantseq3’mRNA-Seq更有效的对低质量的样本进行建库。 上海Lexogen试剂盒代理哪家好?湖北Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒价格
SPLITRNA提取试剂盒:SPLITRNA提取试剂盒是专门为需要RNA纯化的下游应用特别设计的,如RNA-Seq。它可快速高效的提取出DNA-free的RNA。更重要的,SPLIT无需DNase处理(DNase可能会对RNA造成损害)。SPLITRNA提取试剂盒既可以回收总RNA,还可以分别提取大片段的RNA和小片段的RNA。产品优势:可提取从17nt到大于10,000nt的TotalRNA;可以选择性的提取大片段或者小片段的RNA(Cut-off值在150nt左右);*需要30分钟;很高的RNA完整性和纯度(组织:RIN>8,细胞培养物:RIN10);试验过程无需DNase处理,且保证RNA中无基因组DNA;**的提取效率(低投入量,低至);本试剂盒可用于FFPE样本(样本需经过脱蜡处理);NEW!SPLITforblood试剂盒可去除人血液样本中的GlobinmRNAs。工作流程:SPLITRNA提取试剂盒可以简单、快捷、可靠地从不同物种(如哺乳动物、植物、昆虫、***和细菌)的多种材料(血浆、组织、细胞系)中提取RNA。样品在高盐提取缓冲液下匀浆,既可使RNase失活,又能提高样品的裂解。用酸性的酚-氯仿法抽提RNA,并辅以锁相凝胶管,将含RNA的水相与有机相(含DNA和蛋白质)清晰的分离开来。紧接着将RNA组分用硅胶柱纯化回收,既可回收总RNA,也可回收大片段或/和小片段RNA。 广东Lexogen i5 6 nt UDI Add-on Kits Lexogen试剂盒价格云生物主营产品包括Lexogen试剂盒。
RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:在宏转录组样本上的性能表现:RiboCopMETArRNA去除试剂盒是专门针对复杂的样本而设计,用于混合细菌样本,如环境群落或微生物组样本的rRNA去除。RiboCopMETArRNA去除试剂盒的性能,样本为粪便提取的低质量微生物组样本。METArRNA去除试剂盒也可以用于单一菌株培养物,input量可达100ng总RNA。RiboCopMETArRNA去除试剂盒可有效的去除复杂的微生物组样本以及单一菌株样本中的rRNA,同时保持转录组结果的保真性。另外,RiboCop性能上优于竞品。不同RiboCoprRNA试剂盒:革兰氏阴性(G-)和革兰氏阳性(G+)细菌及混合细菌样本(META)对rRNA的去除效率。将大肠杆菌、枯草芽孢杆菌以及铜绿假单胞菌的100ng总RNA用相应的rRNA去除试剂盒进行处理。处理后样本用CORALL制备文库,在NextSeq500(1×75bp)上测序,并使用BBMap将数据比对到各自的参考基因组上,以评估每个类别的rRNAreads百分比。未处理的总RNA作为对照。rRNA百分比为两次以上实验的平均值。
QuantSeq FWD UMI第二连合成模块(Illumina, Read 1):UMI模块含6个碱基长的**分子标签(UMIs)对单个转录本进行**标记,在Read 1开始的时候就读出来。模块中包含UMI第二链合成Mix(USS),代替了QuantSeq FWD试剂盒中的第二链合成Mix1(SS1)(注意:此模块与 QuantSeq REV不兼容)。Bluebee Genomics平台可为QuantSeq UMI提供数据分析。
货号、产品描述和规格信息:081.96UMI Second Strand Synthesis Module for QuantSeq FWD (Illumina, Read 1), 96 rxn96
云生物的Lexogen试剂盒产品种类繁多。
RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:RNA input范围宽、性能表现优异、转录组丰度无偏差:核糖体RNA占到细菌转录本的98%。有效去除rRNA可以大幅降低测序成本,并实现对细菌转录组的***分析。为展示RiboCop 细菌核糖体RNA 去除试剂盒的性能,用RiboCop 革兰氏阴性rRNA去除试剂盒对E. coli 的总RNA进行rRNA去除处理(input:1 ng - 1 μg)。对于所有测试input量,RiboCop有效地将rRNA reads数从98%降低到1- 3%,同时维持转录组丰度的无偏差,无脱靶效应。想要买Lexogen试剂盒?您要先了解Lexogen试剂盒的特点。湖北表达谱文库构建Lexogen试剂盒
Lexogen试剂盒的主要特点有很多。湖北Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒价格
SLAMseq代谢标记试剂盒:SLAM-ITseq:监测体内RNA的运输。组织特异性表达的尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)和基于4-Thiouracil标记的RNA也可用于监测组织间RNA的运输(Sharmaetal.,2018).SLAMdunk–SLAMseq数据分析软件:Lexogen可以为客户提供对SLAMdunk1的访问,可定制化分析来自QuantSeq3'mRNA-Seq文库的SLAMseqRNA-Seq数据。用户在Bluebee®Genomics平台上使用SLAMdunk软件可以很容易的对SLAMseq实验数据进行分析。只需上传压缩的fastq文件并选择适当的物种即可。处理数据之后,SLAMdunk可获得T>C转换率统计数据,以及比对到3'UTR区域的统计数据,然后可以从Bluebee®平台下载结果。SLAMseq,QuantSeq和SLAMdunk为高通量时间分辨RNA-Seq实验提供了完整且友好的解决方案。 湖北Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒价格