SLAMseq代谢标记试剂盒:SLAMseq试剂盒从S4U标记条件的优化到进行S4U标记动力学实验,以及后续的RNA提取和烷基化,SLAMseq试剂盒为RNA代谢测序实验提供了一个完整的解决方案。产品应用:测定RNA合成及降解速率用S4U标记小鼠胚胎干细胞,随后抽提出总RNA,烷基化,用QuantSeq3’mRNA试剂盒进行文库构建和测序。首先,用S4U标记mESCs24小时,然后用未标记的尿苷进行冲洗和尿苷终止反应(U终止反应)。测序数据用SLAMDUNK软件进行分析,测定整个转录组的RNA周转率。转录因子HES1具有高的周转速率(RNA合成与降解速率高),而对于管家基因NDUFA7,它的周转速率较低。 云生物主营产品包括Lexogen试剂盒。上海Lexogen i7 6 nt Index SetLexogen试剂盒哪家好
Lexogen LUTHOR 3' mRNA-Seq单细胞建库试剂盒:细胞间的差异在多细胞生物中普遍存在。对单个细胞进行测序可以评估基因表达的异质性及相似类型或来源的细胞之间的异质性,并为鉴定细胞群、分类和亚型提供基础。传统的文库转化率只有所有转录本的10-20%。因此,目前的单细胞方法依赖于对数千个细胞进行测序通过增加数据测序深度来弥补低转换效率。然后只使用高丰度的marker转录本对细胞进行聚类。THOR扩增技术和LUTHOR 3’mRNA-Seq:THOR稳定的扩增技术可对内源性mRNA模板直接进行线性复制生成更多RNA拷贝。原始mRNA与扩增所需的T7启动子融合。然后,RNA模板在体外转录产生反义RNA拷贝,但缺乏启动子序列。只有原始的mRNA分子作为模板,并被反复放大。从而提高RNA浓度,制备文库。文库是在一个高度特异性的链转换步骤中生成的。完整的LUTHOR工作流没有连接、模板转换和打断 ,因此可用于具有挑战性的样本。通过PCR扩增得到单链的cDNA,并引入与Illumina平台兼容的用于簇生成和i5、i7位置的UDIs的全长接头。Lexogen提供预混合的12nt UDIs index。
****的灵敏度
对于**input量和单细胞测序可获得高质量结果表现
优异的重现性
上海代谢标记Lexogen试剂盒报价Lexogen试剂盒的系列有很多种。
PCR Add-on Kit for Ion Torrent:PCR Add-on试剂盒包含PCR Mix,PCR Mix中包括Ion Torrent特异性引物和热稳定聚合酶。使用PCR Add-on试剂盒,可以做更多的PCR来确定合适的循环数,防止文库不足或过量。如果样品PCR循环数不够(文库量不够),则该试剂盒可用于增加PCR循环数,重新放大文库。
021.96PCR Add-on Kit for Ion Torrent, 96 rxn96
021.96PCR Add-on Kit for Ion Torrent, 96 rxn96
021.96PCR Add-on Kit for Ion Torrent, 96 rxn96
021.96PCR Add-on Kit for Ion Torrent, 96 rxn96
Mix2 RNA-Seq 数据分析软件:Mix2 (Mix-Square)通过RNA-Seq数据中的位置覆盖偏差,来准确计算出基因isoform的丰度。使用Mix2进行isoform定量是可重复跨变量条件的,并可准确检测差异表达。
优势:
l 准确评估转录本浓度;
l 不同测序设备、文库制备和各种降解类型RNA,丰度评测的结果都可重复;
l 准确检测差异表达;
l 可以对RNA测序中的数据偏差类型进行检测并归类;
l 运算速度超快,且占用内存小。
工作原理:RNA测序中isoform定量的准确性和重复性,受RNA测序数据中的片段偏差的影响。Mix2没有对覆盖偏差做出任何假设,而是将混合模型与每个基因的isoform数据进行拟合。因此,Mix2可以准确地表现5'偏差,而Cufflinks软件**于均匀分布。 Lexogen试剂盒的好处有很多。SmallRNA文库构建试剂盒:SmallRNA试剂盒建库流程简单,可在5个小时内完成smallRNA的建库(以totalRNA或富集好的smallRNA为模板)。可用于smallRNA的发现和分析,如microRNA或siRNA,这些smallRNA已被发现在基因表达调控中发挥关键作用。产品优势:5小时内即可完成测序文库的构建;input量范围宽:从50pg(富集好的smallRNA)或100ng(totalRNA)到1000ngRNA;适用于低RNA含量的样品,如血浆、血清和尿液;内含i7index,**多可同时对96个样品进行混样分析。工作流程:SmallRNA文库构建是通过将接头连接到TotalRNA或富集的smallRNA的3'和5'端。对于inputRNA,连接上5’端和3’端接头后,将反转录成cDNA,并通过PCR将i7端index引入到文库中,**多可以达96种index。通常情况下,特别是当inputRNA为富集好的microRNA时,构建好的文库可直接用于测序分析。对于totalRNA进行的smallRNA文库构建,可以用试剂盒中带的磁珠纯化模块除去接头自连片段,以及将smallRNA文库从totalRNA文库中分离出来。 云生物专业致力于Lexogen试剂盒批发。广东胶提取Lexogen试剂盒报价
Lexogen试剂盒的各种系列应用领域还是不一样的。上海Lexogen i7 6 nt Index SetLexogen试剂盒哪家好
PCR Add-on Kit for Illumina:用于Illumina平台的PCR Add-on试剂盒包含PCR Mix、酶Mix和兼容的P7引 物,用于qPCR分析确定PCR的循环数。还包括再扩增引物,其可用于再扩增 Single-index(i7)文库。该Add-on Kit与QuantSeq及CORALL文库制备试剂盒兼容。
020.9 6PCR Add-on Kit for Illumina, 96 rxn96
020.9 6PCR Add-on Kit for Illumina, 96 rxn96
020.9 6PCR Add-on Kit for Illumina, 96 rxn96
020.9 6PCR Add-on Kit for Illumina, 96 rxn96
020.9 6PCR Add-on Kit for Illumina, 96 rxn96 上海Lexogen i7 6 nt Index SetLexogen试剂盒哪家好