QuantSeq Data Analysis:
63.02 SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-2 GB2 GB
63.06SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-6 GB6 GB
63.12SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-12 GB12 GB
63.25SLAMdunk Data Analysis for SLAMseq Integrated on Bluebee® Platform, 0-25 GB25 GB
090.24QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 24 runs24
091.24QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 24 runs24
093.03QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB
093.06QuantSeq Data Analysis (FWD/FWD-UMI) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB
094.03QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 3 GB3 GB
094.06QuantSeq Data Analysis (REV) on Bluebee® Platform, 1 run, 0 - 6 GB6 GB Lexogen试剂盒的好处有很多。上海PCR Add-on Kit for Ion TorrentLexogen试剂盒哪家好
SLAM-ITseq:确定哺乳动物体内特定组织和细胞类型的基因表达:对于该应用,将4-Thiouracil(不是SLAMseq中的S4U)注射到转基因生物体中,例如*在特定细胞类型中表达尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)的小鼠中,新合成RNA*在该细胞类型中被标记,然后提取纯化RNA,***进行标准SLAMseq分析。可根据RNAseq数据中碱基的转换信息,对体内特定组织和细胞类型的基因表达进行定量(Matsushimaetal.,2018)。SLAMseq合成代谢动力学试剂盒模块包含SLAM-ITseq所需的组分(4-Thiouracil除外),同时SLAMdunk软件与SLAM-ITseq数据兼容,可对其进行分析。 浙江PCR Add-on Kit for Ion TorrentLexogen试剂盒云生物主做Lexogen试剂盒的批发销售。
SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:作为强有力的转录组分析工具,RNA测序已经被应用到众多研究项目中,并且很有希望将其应用范围进一步扩展到诊断与***领域中。为保证分析的有效性,实验室测试必须提供可重复性和稳定性俱佳的精细信息。Makers和质控品是**可以准确无误的判定实验可靠性的方式。Lexogen公司研发的SIRVs可以评估转录组测序实验的质量和数据可比性。产品优势:通用的标准品,用于比较分析和监控整个RNA测序实验;验证RNA测序流程,发现测序错误的来源和偏差,改善RNA测序从建库到数据分析的整个流程;兼容所有的测序平台,各种生物来源的RNA,甚至单细胞水平的RNA;通过综合设计,*****isoform和转录组丰度的复杂性;提供三套不同的标准品(SIRV1,2,3),适用于复杂的isoform表达分析以及简单的样品之间的比较。工作流程:Spike-InRNAVariant(SIRV)对照质控品是人工转录本,*****了转录组的复杂性,实验过程中将其掺入样品(匀浆组织/细胞或纯化的RNA)中,标准品的数据量占总reads数的1-2%。通过SIRV的数据分析,可以评估RNA测序过程的精度和准确性,以确定每个处理样本的技术噪音。然后根据质量评测和偏差系数来计算实验之间的一致性。
SLAMseq代谢标记试剂盒:SLAM-ITseq:监测体内RNA的运输。组织特异性表达的尿嘧啶磷酸核糖基转移酶(UPRT)和基于4-Thiouracil标记的RNA也可用于监测组织间RNA的运输(Sharmaetal.,2018).SLAMdunk–SLAMseq数据分析软件:Lexogen可以为客户提供对SLAMdunk1的访问,可定制化分析来自QuantSeq3'mRNA-Seq文库的SLAMseqRNA-Seq数据。用户在Bluebee®Genomics平台上使用SLAMdunk软件可以很容易的对SLAMseq实验数据进行分析。只需上传压缩的fastq文件并选择适当的物种即可。处理数据之后,SLAMdunk可获得T>C转换率统计数据,以及比对到3'UTR区域的统计数据,然后可以从Bluebee®平台下载结果。SLAMseq,QuantSeq和SLAMdunk为高通量时间分辨RNA-Seq实验提供了完整且友好的解决方案。 Lexogen试剂盒的特点成为了一个重要因素。
Lexogen i7 6 nt Index Set (7001-7096):96孔板中有96个6碱基的 i7 index(用于Illumina平台),可用于QuantSeq,和 CORALL试剂盒。
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Quanteqpool样品barcode3‘mRNA-seq文库构建试剂盒:3’mRNA-Seq是基因表达谱分析的强有力工具。3’mRNA-Seq方法生成的NGS文库插入片段为多聚腺苷酸RNAs的3端,无需事先进行poly(A)富集处理(表1)。表1丨常规mRNA-Seq和QuantSeq3'mRNA-Seq基因表达谱分析方案比较。由于3'mRNA-seq每个转录本只产生一个文库片段,比对到给定基因的reads与其表达量成正比。3'mRNA-Seq不依赖于正确的异构体(isoform)注释和鉴定来确定确切基因表达值。此外,3'mRNA-Seq对RNA质量的差异不敏感。另一方面,传统的mRNA-seq需要高质量的RNA来富集mRNA,且对更长的转录本有偏好性,因为这些转录本产生更多的片段。因此,无论转录本长度如何,3'mRNA-Seq为基因表达谱提供了一个可靠且经济的解决方案1。 上海PCR Add-on Kit for Ion TorrentLexogen试剂盒哪家好