QuantSeq FWD UMI第二连合成模块(Illumina, Read 1):UMI模块含6个碱基长的**分子标签(UMIs)对单个转录本进行**标记,在Read 1开始的时候就读出来。模块中包含UMI第二链合成Mix(USS),代替了QuantSeq FWD试剂盒中的第二链合成Mix1(SS1)(注意:此模块与 QuantSeq REV不兼容)。Bluebee Genomics平台可为QuantSeq UMI提供数据分析。
货号、产品描述和规格信息:081.96UMI Second Strand Synthesis Module for QuantSeq FWD (Illumina, Read 1), 96 rxn96
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SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:数据分析:将spike-inRNA-seq实验的数据统一比对到参考基因组以及SIRVome(人工“基因组”涵盖标准品的详细序列和注释信息)上。常规和定制的生物信息学工具可从不同维度对检测的结果和预期的SIRVreads分布进行比较,如从原始reads的比对到转录本鉴定及定量。在“Galaxy”环境中使用已经发表的软件工具以及算法,能够在**的“SIRVSuite”中实现示例性数据评估的工作流程()。它可以为单个SIRV实验以及实验间的比较提供设计和评估。为了评估RNA测序中的ERCC测序数据,NIST提供了名为“ERCCdashboard”5的软件包,并且在SEQC/MAQC-III协会的出版物中对其做了进一步的评估。数据分析的质量测定包括准确度和精度以及偏差系数,衡量实测和预期之间的偏差。虽然在方法开发过程中监控***排序非常重要,但实验数据比较的关键参数不是实验中偏差的程度,而是偏差的一致性。可以基于SIRV的复杂性来确定实验之间的偏差。这些分析的结论有助于判断数据之间是否具有可比性,并且有助于设置实验固有偏差的基线,了解样本之间的技术差异是提出有意义的生物学问题的先决条件。 陕西磁珠纯化Lexogen试剂盒要多少钱云生物专业致力于Lexogen试剂盒批发。
GlobinBlock模块在血液RNA样本上的表现:使用GlobinBlock在QuantSeq文库构建过程中无需额外的操作步骤:对于生物及疾病相关研究,血液是一种信息量大且易于获得的样本。GlobinmRNAs(HBA1,HBA2,HBB)占血液总RNA的50-80%,严重影响了基因检测和定量的灵敏度。其他GlobinRNA的去除方法需要前处理RNA,需要高起始量的RNA,额外增加成本。LexogenQuantseq的GlobinBlock模块能通过简单的方法直接在建库流程中去除GlobinRNA,input量低至50ng的血液RNA。GlobinBlock模块与QuantSeq3’mRNA-Seq建库试剂盒搭配使用。GlobinBlockers在Quantseq流程中引入优化的GlobinRNA去除流程(RS-GlobinBlock):GlobinBlockers结合Globin***链cDNA,阻止GlobinmRNA形成双链cDNA。GlobinBlock兼容自动化平台,可用于人、猪样本。
PCR Add-on Kit for Illumina:用于Illumina平台的PCR Add-on试剂盒包含PCR Mix、酶Mix和兼容的P7引 物,用于qPCR分析确定PCR的循环数。还包括再扩增引物,其可用于再扩增 Single-index(i7)文库。该Add-on Kit与QuantSeq及CORALL文库制备试剂盒兼容。
020.9 6PCR Add-on Kit for Illumina, 96 rxn96
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PCR Add-on Kit for Ion Torrent:PCR Add-on试剂盒包含PCR Mix,PCR Mix中包括Ion Torrent特异性引物和热稳定聚合酶。使用PCR Add-on试剂盒,可以做更多的PCR来确定合适的循环数,防止文库不足或过量。如果样品PCR循环数不够(文库量不够),则该试剂盒可用于增加PCR循环数,重新放大文库。
021.96PCR Add-on Kit for Ion Torrent, 96 rxn96
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SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:SIRV-Sets三套SIRV,每一套含有不同的SIRVMix或者Mix组合,满足不用的用途()。Table1|SIRV选择指南。SIRV-Set1(货号)包含Isoform模块的MixesE0、E1和E2;SIRV-Set2(货号and)*含IsoformMixE0;而SIRV-Set3(货号)包含SIRVIsoformMixE0和ERCCs.✔:**可用,:**不可用,部分可用(部分Set可用)。SIRV-Set1:SIRV-Set1含有3种不同的“isoform模块”:E0、E1和E2,每种混合物含有所有69种SIRVisoform转录本(来自7个SIRV基因),但浓度比例不同。在特定的RNA测序工作流程下,E0是评估isoform检测能力的理想选择,因为所有69种转录本都以等摩尔浓度存在,它们不作为测序深度的评估选择。E1中包含中等浓度的给定基因的各种转录本;E2**了一种自然的状态,1个基因的一种转录本占主要丰度(转录本可达17种isoform),其他低表达量的转录本小于1%。E2不*可以校正短读长的转录本检测,而且还可以对长读长或者限制读长的测序平台进行线性和灵敏度评测。 天津Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒销售厂家