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技术服务企业商机

    DNA甲基化(DNAmethylation)是指在DNA甲基化转移酶(DNMT)催化下,以S-腺苷甲硫氨酸为甲基供体,将活性甲基转移至DNA链中特定碱基上的化学修饰过程。哺乳动物基因组中,DNA甲基化多发生在CpG二核苷酸中的胞嘧啶的5位碳原子。DNA甲基化是一种表观(epigenetic)修饰,它在不改变DNA序列的情况下,对个体的生长、发育、基因表达模式以及基因组的稳定性起到重要的调控作用,这种修饰是可逆的,并且这种修饰在发育和细胞增殖的过程中是可以稳定传递的。近年来的大量研究表明,DNA异常甲基化与**的发生、发展、细胞*变有着密切的联系。DNA甲基化在**中的作用主要表现在以下几个方面:一是甲基化的CpG岛二核苷酸中的胞嘧啶以较高的频率脱氨基变成胸腺嘧啶,造成碱基突变;二是抑*基因和DNA修复基因由于超甲基化而沉默;三是*基因甲基化水平降低而活化;四是基因组总体甲基化水平降低使转座子、重复序列活化导致染色体稳定性下降。这些因素是导致**发展、转移、恶化**终导致患者死亡的重要原因。其中后三个方面源于甲基化水平的改变,而甲基化的过程是可逆的,因此可以甲基化位点为靶点,靶向用药进行**的预防、***。 中小样本筛选, 大样本中进一步验证。江苏RRBS技术服务

    羟甲基化DNA免疫沉淀测序(HydroxymethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,hMeDIP-Seq)是通过5hmC特异性抗体富集羟甲基化的DN**段,然后结合高通量测序技术在全基因组水平上以较小的数据量,快速、高效地寻找羟甲基化区域。可广泛应用于羟甲基化与疾病关系研究以及羟甲基化在胚胎发育过程中的研究。技术优势从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序,到数据分析每个项目有特定的科学问题;需要专业、有价值的建议;科学、缜密的设计及时高效的沟通;以保障高质量研究成果样本要求:基因组DNA:>=3ug;样品浓度>50ng/ul;无RNA和蛋白污染建库测序:测序策略:IlluminaHiSeq,PE150;测序深度:20-30Mreads信息分析基于全基因组范围的羟甲基化分析,数据质控,Peak锋Calling,Peak锋在基因组、染色体、功能元件上的分布,多样本羟甲基化差异聚类,差异羟甲基化DMR鉴定及相关基因的功能分析,结合项目背景和科学问题的数据亮点挖掘。 四川MeDIP-Seq技术服务怎么样WGBS用于人、哺乳动物及农林牧渔方向的高水平甲基化研究。

    2019国自然基金解析—甲基化研究专题。从生命科学部和医学科学部总体来看:2019年度,生命科学部获自然科学基金委批准资助6478项(不含杰出青年基金项目),批准资助金额共计,单项平均资助金额。2019年度,医学科学部共批资助10138项(不含杰出青年基金项目),批准资助金额共计,单项平均资助金额。从甲基化研究方向来看,与甲基化研究相关的项目总数达283项,项目总金额超过12669万元。其中生命科学部项目总数62项,项目金额3235万元,医学科学部项目总数221项,项目金额9434万元。从2011-2019年甲基化研究方向的项目金额和项目数目分析,整体呈上升趋势;从医学科学部来看,甲基化研究项目获批数量221项,项目金额达到9434万,较之2018年度项目获批金额(7166万元)上升趋势尤为明显,可以看出,甲基化研究日益成为国自然的研究热点。

甲基化敏感性高分辨率熔解曲线分析(MS-HRM)


通过熔解曲线分析可以将单碱基序列的差异转变成熔解曲线的差异,因此DNA样本经过亚硫酸氢盐处理后,甲基化与未甲基化DNA会存在序列差异,这种差异可通过熔解曲线分析来发现。使用该方法进行甲基化分析*需一对引物,相对简单,不过这种方法对仪器的要求颇高,需要带HRM模块的荧光定量PCR仪,并且在进行实时定量PCR过程中,需要使用饱和的荧光染料。利用MS-HRM技术进行甲基化检测只能对检测片段整体甲基化情况进行分析,并不能明确每个CpG位点的甲基化状态。因此这种技术适用于大量样本的检测,筛选出感兴趣的CPG位点,然后利用其他方法进行单个位点的精确检测及甲基化程度的精确定量。 重亚硫酸盐处理结合测序是目前检测甲基化的金标准。

发育基因的表观突变是养殖欧洲鲈鱼开始驯化的基础

Epimutations in developmental

genes underlie the onset of domestication in farmed European sea bass. Mol Biol Evol. 2019 May 30 (IF= 14.797)

本研究通过RRBS测序,比较了早期驯化的

(n=12)与野生的(n=12)

欧洲鲈鱼在驯化过程中DNA甲基化变化,发现早期驯化的鲈鱼与野生的没有遗传差异,但在不同胚胎起源的组织中发生DNA甲基化变化。这些甲基化突变与经过25年选择性育种后的胞嘧啶至胸腺嘧啶多态性***重叠,表观突变基因与正选择基因一致。结果表明驯化初始阶的表观变异是一个重要事件。 甲基化验证方案是TBS。北京ATAC技术服务共同合作

基于高通量测序平台的甲基化图谱分析。江苏RRBS技术服务

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