SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:SIRV-Sets三套SIRV,每一套含有不同的SIRVMix或者Mix组合,满足不用的用途()。Table1|SIRV选择指南。SIRV-Set1(货号)包含Isoform模块的MixesE0、E1和E2;SIRV-Set2(货号and)*含IsoformMixE0;而SIRV-Set3(货号)包含SIRVIsoformMixE0和ERCCs.✔:**可用,:**不可用,部分可用(部分Set可用)。SIRV-Set1:SIRV-Set1含有3种不同的“isoform模块”:E0、E1和E2,每种混合物含有所有69种SIRVisoform转录本(来自7个SIRV基因),但浓度比例不同。在特定的RNA测序工作流程下,E0是评估isoform检测能力的理想选择,因为所有69种转录本都以等摩尔浓度存在,它们不作为测序深度的评估选择。E1中包含中等浓度的给定基因的各种转录本;E2**了一种自然的状态,1个基因的一种转录本占主要丰度(转录本可达17种isoform),其他低表达量的转录本小于1%。E2不*可以校正短读长的转录本检测,而且还可以对长读长或者限制读长的测序平台进行线性和灵敏度评测。 云生物专业致力于Lexogen试剂盒维修。江苏QuantSeq Data AnalysisLexogen试剂盒销售
Mix2 RNA-Seq 数据分析软件:Mix2 (Mix-Square)通过RNA-Seq数据中的位置覆盖偏差,来准确计算出基因isoform的丰度。使用Mix2进行isoform定量是可重复跨变量条件的,并可准确检测差异表达。
优势:
l 准确评估转录本浓度;
l 不同测序设备、文库制备和各种降解类型RNA,丰度评测的结果都可重复;
l 准确检测差异表达;
l 可以对RNA测序中的数据偏差类型进行检测并归类;
l 运算速度超快,且占用内存小。
工作原理:RNA测序中isoform定量的准确性和重复性,受RNA测序数据中的片段偏差的影响。Mix2没有对覆盖偏差做出任何假设,而是将混合模型与每个基因的isoform数据进行拟合。因此,Mix2可以准确地表现5'偏差,而Cufflinks软件**于均匀分布。 上海Lexogen试剂盒活动云生物的Lexogen试剂盒产品种类繁多。云生物专注于生物医药科研平台服务及基因检测定制,包括测序、芯片、数据库建设、软件开发以及其他科研解决方案和民用型基因检测产品。云生物拥有多个经验丰富、可提供一对一个性化定制分析服务的实验室平台,包括基因调控(ATAC-seq、CHIP-seq、Hi-C测序)、分子生物(数字PCR、荧光定量PCR、焦磷酸测序、PGM)、核酸测序(基因组、转录组、多样性)、芯片检测(基因芯片、蛋白芯片、组织芯片、PCR芯片)、蛋白代谢(蛋白组、代谢组、脂质组)、形态影像(免疫组化)、蛋白定量(定量Wes检测)、细胞生物(细胞生物学、ips、CRISPR/Cas9、细胞株构建)、生物信息(在线系统、软件开发、相关数据库)和转化应用(MicrobeTrakr)等等。
ploy(A)RNA选择试剂盒:LexogenPoly(A)RNA选择试剂盒可以快速、高度特异性富集来自总RNA样品的多腺苷酸化RNA,从而有效地去除通常不太感兴趣的高丰度细胞质核糖体RNA(rRNA)。适用于各种RNA分析需求,例如RNA-seq。产品优势:高度特异性富集来自总RNA样品的多腺苷酸化RNA(>97%蛋白编码RNA);灵活的RNA投入量(500ng-100μg的总RNA投入量);对于CORALL,input量可以低至1ng-1μg;Poly(A)RNA纯化比较高可达500μg(100x5μg)或1,000μg总RNA(10x100μg);自动化友好的操作流程—基于磁珠纯化流程;快速—手动操作时间只需20min;洗脱的或与磁珠结合的Poly(A)RNA可与下游各种应用无缝衔接。工作流程:总RNA变性后,mRNA3'端的poly(A)会与磁珠上的oligo(dT)进行杂交。通过清洗,将没有poly(A)结构的RNA(例如rRNA、tRNA)去除掉。从磁珠上洗脱下来的mRNA(含polyA结构)可用于下游的各种应用,例如cDNA文库构建,RT-PCR,以及总RNA-seq。同样,结合在磁珠上的mRNA也可以直接用于下游的应用(如一链的合成)。Poly(A)RNA选择试剂盒可以与CORALLTotalRNA-Seq文库构建试剂盒结合使用。性能表现:Poly(A)RNA选择试剂盒可以高效特异的对含poly(A)RNA进行富集。 Lexogen试剂盒的多种系列总有一款是您满意。
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CORALLTotalRNA-seq文库构建试剂盒CORALL试剂盒:可以在(UMIs)以及链特异性(>99%)的RNA文库构建。Lexogen专有的链置换终止和连接技术,无需片段化,可提供完整的转录表达信息,包括转录的起始和终止位点信息。产品优势:完整覆盖转录本信息,从起始到终止位点信息,用于全转录组分析;整合UMIs,准确反映转录本信息;出色的链特异性(>99%)操作流程;低起始量(1ng-1μg),兼容mRNA捕获及核糖体去除建库;适用低起始量或低质量的FFPE样本;自动化友好。工作流程:CORALL文库构建基于特有的链置换终止和连接技术,首先置换终止引物(DSP,包含P7序列)3’端可随机结合到RNA模板上,然后进行反转录延伸,当延伸到下一个DSP时,延伸终止,因此文库构建过程不需要进行片段化。插入片段的大小取决于两个结合到模板RNA上DSP的距离。此外,这种终止可阻止伪第二链的合成,保持出色的链特异性。寡核苷酸连接序列可以与**链cDN**段的3’端进行高效的连接,同时引入P5序列和单分子标签(UMIs)。通过PCR进行第二链的合成和双链cDNA扩增,同时把i7和i5(可选)端index以及簇生成所需的完整接头序列引入到文库中。所有的核酸纯化都使用磁珠,操作流程高度匹配自动化。 江苏QuantSeq Data AnalysisLexogen试剂盒销售