企业商机
Lexogen试剂盒基本参数
  • 品牌
  • 云生物,Lexogen
  • 型号
  • 齐全
Lexogen试剂盒企业商机
Lexogen LUTHOR 3' mRNA-Seq单细胞建库试剂盒:细胞间的差异在多细胞生物中普遍存在。对单个细胞进行测序可以评估基因表达的异质性及相似类型或来源的细胞之间的异质性,并为鉴定细胞群、分类和亚型提供基础。传统的文库转化率只有所有转录本的10-20%。因此,目前的单细胞方法依赖于对数千个细胞进行测序通过增加数据测序深度来弥补低转换效率。然后只使用高丰度的marker转录本对细胞进行聚类。

THOR扩增技术和LUTHOR 3’mRNA-Seq:THOR稳定的扩增技术可对内源性mRNA模板直接进行线性复制生成更多RNA拷贝。原始mRNA与扩增所需的T7启动子融合。然后,RNA模板在体外转录产生反义RNA拷贝,但缺乏启动子序列。只有原始的mRNA分子作为模板,并被反复放大。从而提高RNA浓度,制备文库。文库是在一个高度特异性的链转换步骤中生成的。完整的LUTHOR工作流没有连接、模板转换和打断 ,因此可用于具有挑战性的样本。通过PCR扩增得到单链的cDNA,并引入与Illumina平台兼容的用于簇生成和i5、i7位置的UDIs的全长接头。Lexogen提供预混合的12nt UDIs index。


****的灵敏度

对于**input量和单细胞测序可获得高质量结果表现

优异的重现性


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QuantSeq FWD UMI第二连合成模块(Illumina, Read 1):UMI模块含6个碱基长的**分子标签(UMIs)对单个转录本进行**标记,在Read 1开始的时候就读出来。模块中包含UMI第二链合成Mix(USS),代替了QuantSeq FWD试剂盒中的第二链合成Mix1(SS1)(注意:此模块与 QuantSeq REV不兼容)。Bluebee Genomics平台可为QuantSeq UMI提供数据分析。

货号、产品描述和规格信息:081.96UMI Second Strand Synthesis Module for QuantSeq FWD (Illumina, Read 1), 96 rxn96


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    SmallRNA文库构建试剂盒:SmallRNA试剂盒建库流程简单,可在5个小时内完成smallRNA的建库(以totalRNA或富集好的smallRNA为模板)。可用于smallRNA的发现和分析,如microRNA或siRNA,这些smallRNA已被发现在基因表达调控中发挥关键作用。产品优势:5小时内即可完成测序文库的构建;input量范围宽:从50pg(富集好的smallRNA)或100ng(totalRNA)到1000ngRNA;适用于低RNA含量的样品,如血浆、血清和尿液;内含i7index,**多可同时对96个样品进行混样分析。工作流程:SmallRNA文库构建是通过将接头连接到TotalRNA或富集的smallRNA的3'和5'端。对于inputRNA,连接上5’端和3’端接头后,将反转录成cDNA,并通过PCR将i7端index引入到文库中,**多可以达96种index。通常情况下,特别是当inputRNA为富集好的microRNA时,构建好的文库可直接用于测序分析。对于totalRNA进行的smallRNA文库构建,可以用试剂盒中带的磁珠纯化模块除去接头自连片段,以及将smallRNA文库从totalRNA文库中分离出来。

Mix2 RNA-Seq 数据分析软件:Mix2 (Mix-Square)通过RNA-Seq数据中的位置覆盖偏差,来准确计算出基因isoform的丰度。使用Mix2进行isoform定量是可重复跨变量条件的,并可准确检测差异表达。

优势:

l 准确评估转录本浓度;

l 不同测序设备、文库制备和各种降解类型RNA,丰度评测的结果都可重复;

l 准确检测差异表达;

l 可以对RNA测序中的数据偏差类型进行检测并归类;

l 运算速度超快,且占用内存小。

工作原理:RNA测序中isoform定量的准确性和重复性,受RNA测序数据中的片段偏差的影响。Mix2没有对覆盖偏差做出任何假设,而是将混合模型与每个基因的isoform数据进行拟合。因此,Mix2可以准确地表现5'偏差,而Cufflinks软件**于均匀分布。 一个好的Lexogen试剂盒需要具备哪些特点您了解吗?


Globin mRNA Block模块:

使用Globin Block在QuantSeq文库构建过程中无需额外的操作步骤:对于生物学及疾病相关研究,血液是一种信息量大且易于获得的样本。Globin mRNAs(HBA1, HBA2, HBB)占血液总RNA的50-80%,严重影响了基因的检测和定量的灵敏度。其他Globin RNA的去除方法需要对RNA进行前处理,需要高起始量的RNA,额外增加成本。

Globin Block可降低Globin RNA Mapped Reads至0.7%:使用Globin Block模块的文库比标准Quantseq文库***降低了总Globin RNA mapped read百分比。在白膜层样品和全血中,使用Globin Block模块可使总Globin RNA mapped read百分比分别低至0.7%和9.7%。

QuantSeq 自动化:Lexogen可提供QuantSeq 3’ mRNA-Seq文库构建流程的自动化版本。在自动化平台上构建Illumina兼容的 3’mRNA-Seq文库,能够提供9,216个i5 / i7 index组合,能实现高通量、大规模基因表达检测。自动化减少了手动操作的时间,提高通量,避免手动操作误差和样本错乱。

自动化 QuantSeq 数据分析:Bluebee Genomics Platform**为QuantSeq 3’ mRNASeq文库构建试剂盒(FWD和REV)的数据提供分析。Lexogen为每个试剂盒提供一个密码,使用者可以登录该平台分析数据。也可用Partek Flow (license required)平台进行数据分析。


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Quanteq pool样品barcode 3‘ mRNA-seq文库构建试剂盒:产品优势:对于筛查项目是高性价比的基因表达分析方法批量处理,省时、省力、省成本可从几个样本到36,864个样本的批量处理。简介:迄今为止,基因表达谱分析是RNA-Seq在生物医学研究和诊断中**常用的应用。传统的基因表达项目使用mRNA测序技术,可以对全长转录本进行单核苷水平的***解析,但对样品处理数量有限,成本高。尽管测序的价格在持续下降,样品制备、测序和数据处理仍然是限制高通量筛选的主要成本。




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