RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:在宏转录组样本上的性能表现:RiboCopMETArRNA去除试剂盒是专门针对复杂的样本而设计,用于混合细菌样本,如环境群落或微生物组样本的rRNA去除。RiboCopMETArRNA去除试剂盒的性能,样本为粪便提取的低质量微生物组样本。METArRNA去除试剂盒也可以用于单一菌株培养物,input量可达100ng总RNA。RiboCopMETArRNA去除试剂盒可有效的去除复杂的微生物组样本以及单一菌株样本中的rRNA,同时保持转录组结果的保真性。另外,RiboCop性能上优于竞品。不同RiboCoprRNA试剂盒:革兰氏阴性(G-)和革兰氏阳性(G+)细菌及混合细菌样本(META)对rRNA的去除效率。将大肠杆菌、枯草芽孢杆菌以及铜绿假单胞菌的100ng总RNA用相应的rRNA去除试剂盒进行处理。处理后样本用CORALL制备文库,在NextSeq500(1×75bp)上测序,并使用BBMap将数据比对到各自的参考基因组上,以评估每个类别的rRNAreads百分比。未处理的总RNA作为对照。rRNA百分比为两次以上实验的平均值。 Lexogen试剂盒的各种系列应用领域还是不一样的。PCR Add-on Kit for Ion TorrentLexogen试剂盒价格
SLAMseq代谢标记试剂盒:产品应用:测量RNA合成及降解速率:用S4U标记小鼠胚胎干细胞,随后抽提出总RNA,烷基化,用QuantSeq3’mRNA试剂盒进行文库构建和测序。首先,用S4U标记mESCs24小时,然后用未标记的尿苷进行冲洗和尿苷终止反应(U终止反应)。测序数据用SLAMDUNK软件进行分析。RNA的周转速率决定了整个转录组。图2显示了两个基因的合成与降解典型动力学实验数据。转录因子HES1具有高的周转速率(RNA合成与降解速率高),而对于管家基因NDUFA7,它的周转速率较低。新转录RNA及总RNA差异表达谱并行分析SLAMseq可以从同一个样本中同时分析总RNA及新转录RNA的表达。为阐明标准RNA测序,稳态RNA-seq以及基于SLAMseq的代谢RNA测序之间的差异,Muhar等人在人细胞系中做了基因差异表达分析(Muharetal.,2018)。SLAMseq可***提高基因差异表达检测和定量的灵敏度()。SLAMseq可分析新合成mRNA水平来揭示抑制剂处理对转录的反应,而标准RNA-Seq却不行。因此,SLAMseq是揭示细胞反应潜在机制和药物发现研究的理想选择。 浙江PCR Add-on Kit for Ion TorrentLexogen试剂盒销售厂家云生物主营产品包括Lexogen试剂盒,批发价格优惠。
Quant-seq表达谱文库构建试剂盒:建库流程:QuantSeq 表达谱建库试剂盒通过oligo dT引物特异逆转录poly(A)尾3’mRNA,第二链使用随机引物进行合成。由于插入片段的大小是由第二链合成引物和poly(A)尾之间的距离决定的,因此无需额外进行 RN**段化。随后的PCR可以提供9,216个不同的i5/i7index组合用于Illumina平台,48个index 用于Ion Torrent平台。能够实现更多样本混样测序。Lexogen提供两个版本的Illumina Quantseq 表达谱建库试剂盒,不同处在于Illumina接头序列的位置。下图绿色的是Read 1的序列,蓝色的是Read 2的序列。QuantSeq Forward (FWD) 在第二链合成的引物中包含Read 1 序列。因此,测序的方向是朝向poly(A)尾的方向。推荐使用这种方法进行基因表达的分析。如果研究关注的是转录的3’端序列或者双端测序策略,推荐使用QuantSeq Reverse (REV),Read 1 接头序列由oligo(dT)引物引入。
SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:设计模块化概念:Spike-InRNA对照质控品有两个模块,即isoform模块和ERCC模块,每个模块用于特定的研究场景。Isoform模块SIRVisoform模块以“**浓缩”方式模拟转录组的复杂性,它包括来自7个人类模型基因的69个人工可变剪切转录本组成。该模块***反映了可变剪接、可变转录起始和终止位点、重叠基因和反义转录的变化。每个模型基因有6到18个可变转录本,isoform的复杂性非常高,可以对RNASeq工作流程进行深入的探测1。为不同转录本的注释流程提供了正确的以及(示例性的)不充分和过度的注释2。SIRVisoform模块有三种,MixE0(所有的SIRV转录本等摩尔比例混合),E1(不同转录本拷贝数之间差异可高达8倍),E2(不同转录本拷贝数之间的差异可高达128倍)。ERCC模块ExternalRNAControlsConsortium(ERCC),由92个人工转录本组成,且无重叠序列。由于其序列的独特性,在不考虑isoform的情况下,适用于技术参数的评估。ERCCMix1覆盖220(106)的动态范围,可解决整个表达谱转录本丰度的复杂性问题3,4。将指定和评估的reads与已知浓度进行比较,可以评估动态范围、响应剂量、检测下限和工作流程的有效性。 想要买Lexogen试剂盒?您要先了解Lexogen试剂盒的特点。
ploy(A)RNA选择试剂盒:LexogenPoly(A)RNA选择试剂盒可以快速、高度特异性富集来自总RNA样品的多腺苷酸化RNA,从而有效地去除通常不太感兴趣的高丰度细胞质核糖体RNA(rRNA)。适用于各种RNA分析需求,例如RNA-seq。产品优势:高度特异性富集来自总RNA样品的多腺苷酸化RNA(>97%蛋白编码RNA);灵活的RNA投入量(500ng-100μg的总RNA投入量);对于CORALL,input量可以低至1ng-1μg;Poly(A)RNA纯化比较高可达500μg(100x5μg)或1,000μg总RNA(10x100μg);自动化友好的操作流程—基于磁珠纯化流程;快速—手动操作时间只需20min;洗脱的或与磁珠结合的Poly(A)RNA可与下游各种应用无缝衔接。工作流程:总RNA变性后,mRNA3'端的poly(A)会与磁珠上的oligo(dT)进行杂交。通过清洗,将没有poly(A)结构的RNA(例如rRNA、tRNA)去除掉。从磁珠上洗脱下来的mRNA(含polyA结构)可用于下游的各种应用,例如cDNA文库构建,RT-PCR,以及总RNA-seq。同样,结合在磁珠上的mRNA也可以直接用于下游的应用(如一链的合成)。Poly(A)RNA选择试剂盒可以与CORALLTotalRNA-Seq文库构建试剂盒结合使用。性能表现:Poly(A)RNA选择试剂盒可以高效特异的对含poly(A)RNA进行富集。 上海Lexogen试剂盒批发推荐云生物。广东磁珠纯化Lexogen试剂盒报价
Lexogen试剂盒的优缺点您知道吗?PCR Add-on Kit for Ion TorrentLexogen试剂盒价格
Quant-seq表达谱文库构建试剂盒:QuantSeq3'mRNA-seq文库构建试剂盒是以mRNA靠近3'端序列进行文库构建,文库可兼容Illumina和IonTorrent测序平台。每个转录组本只产生一个片段,因此能准确进行基因表达定量,同时减少测序深度,能使更多样本混样测序。
产品优势:快速简单的一体化实验方案:从总RNA到可用于测序的文库时间不超过;每个转录本*有一个片段产生—可进行全基因组范围的基因表达分析;能稳定、灵敏检测低丰度的转录本;适用于低起始量(100pg(FWD)或10ng(REV)总RNA)及低质量RNA(如FFPE样本);可高效替代芯片检测或传统的RNA测序,友好匹配自动化工作站;在Blubee基因组分析平台上**进行数据分析;NEW!节约成本,优化的globinmRNA去除流程可用于QuantSeq文库构建;Dualindexes能支持9,216个i5/i7index,或者可选择96个uniqueindex,同时提供能够检测、排除扩增偏好性的UMIs。 PCR Add-on Kit for Ion TorrentLexogen试剂盒价格