SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:设计模块化概念:Spike-InRNA对照质控品有两个模块,即isoform模块和ERCC模块,每个模块用于特定的研究场景。Isoform模块SIRVisoform模块以“**浓缩”方式模拟转录组的复杂性,它包括来自7个人类模型基因的69个人工可变剪切转录本组成。该模块***反映了可变剪接、可变转录起始和终止位点、重叠基因和反义转录的变化。每个模型基因有6到18个可变转录本,isoform的复杂性非常高,可以对RNASeq工作流程进行深入的探测1。为不同转录本的注释流程提供了正确的以及(示例性的)不充分和过度的注释2。SIRVisoform模块有三种,MixE0(所有的SIRV转录本等摩尔比例混合),E1(不同转录本拷贝数之间差异可高达8倍),E2(不同转录本拷贝数之间的差异可高达128倍)。ERCC模块ExternalRNAControlsConsortium(ERCC),由92个人工转录本组成,且无重叠序列。由于其序列的独特性,在不考虑isoform的情况下,适用于技术参数的评估。ERCCMix1覆盖220(106)的动态范围,可解决整个表达谱转录本丰度的复杂性问题3,4。将指定和评估的reads与已知浓度进行比较,可以评估动态范围、响应剂量、检测下限和工作流程的有效性。 想要买Lexogen试剂盒?您要先了解Lexogen试剂盒的特点。四川磁珠纯化模块Lexogen试剂盒
SLAMseq代谢标记试剂盒:标准的RNA-seq方法可以评估总RNA丰度,但不能解决RNA转录和降解整体动态水平的动力学问题。SLAMseq系列产品以时间作为RNA-Seq的一个新维度,能同时对新合成的和已有的RNA进行定量分析。产品优势:可进行转录组--RNA合成及降解的动力学分析;获取控制基因表达的新见解;建立刺激诱导的RNA转录和降解之间序列改变的模型;通过比较新生转录水平,***提高差异表达的分辨率;只需向RNA-Seq工作流添加两个步骤,无需pull-down实验或生化隔离;对于时间分辨的RNA-seq,整合了Lexogen’sSLAMseq标记试剂盒,QuantSeq3’mRNA-Seq文库构建试剂盒,以及SLAMdunk分析软件。工作流程:SLAMseq系列产品是基于一种新的全转录组定量、快速和可靠的标记方法:通过硫醇(SH)烷基化标记用于RNA的代谢测序1。用核苷酸类似物4-硫代嘌呤(4-Thiouridine,S4U)与细胞孵育,S4U被细胞摄入,并整合到新转录的,新生的RNA中。该工作流程的关键特点是烷基化步骤,使用碘乙酰胺(iodoacetamide,IAA)修饰S4U核苷酸,导致核苷酸在逆转录过程中发生转化。因此,S4U标记的转录本,在测序读取过程中,会导致胸腺嘧啶变成胞嘧啶(T>C)。 浙江QuantSeq Data AnalysisLexogen试剂盒销售厂家云生物主做Lexogen试剂盒的批发销售。
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RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:RNA input范围宽、性能表现优异、转录组丰度无偏差:核糖体RNA占到细菌转录本的98%。有效去除rRNA可以大幅降低测序成本,并实现对细菌转录组的***分析。为展示RiboCop 细菌核糖体RNA 去除试剂盒的性能,用RiboCop 革兰氏阴性rRNA去除试剂盒对E. coli 的总RNA进行rRNA去除处理(input:1 ng - 1 μg)。对于所有测试input量,RiboCop有效地将rRNA reads数从98%降低到1- 3%,同时维持转录组丰度的无偏差,无脱靶效应。Lexogen试剂盒多种系列供您选择。
SmallRNA文库构建试剂盒:SmallRNA试剂盒建库流程简单,可在5个小时内完成smallRNA的建库(以totalRNA或富集好的smallRNA为模板)。可用于smallRNA的发现和分析,如microRNA或siRNA,这些smallRNA已被发现在基因表达调控中发挥关键作用。产品优势:5小时内即可完成测序文库的构建;input量范围宽:从50pg(富集好的smallRNA)或100ng(totalRNA)到1000ngRNA;适用于低RNA含量的样品,如血浆、血清和尿液;内含i7index,**多可同时对96个样品进行混样分析。工作流程:SmallRNA文库构建是通过将接头连接到TotalRNA或富集的smallRNA的3'和5'端。对于inputRNA,连接上5’端和3’端接头后,将反转录成cDNA,并通过PCR将i7端index引入到文库中,**多可以达96种index。通常情况下,特别是当inputRNA为富集好的microRNA时,构建好的文库可直接用于测序分析。对于totalRNA进行的smallRNA文库构建,可以用试剂盒中带的磁珠纯化模块除去接头自连片段,以及将smallRNA文库从totalRNA文库中分离出来。 Lexogen试剂盒有哪些分类呢?上海Small RNA文库构建试剂盒Lexogen试剂盒活动
Lexogen试剂盒的好处您了解吗?四川磁珠纯化模块Lexogen试剂盒
RiboCoprRNA去除试剂盒(人/小鼠/大鼠):总RNA中包含大量核糖体RNA(rRNA),通常科研人员对这些rRNA不感兴趣。Lexogen公司的RiboCoprRNA去除试剂盒可以高效地从完整的或降解的大鼠、小鼠和人类总RNA样本中去除rRNA。去除rRNA后的RNA样本可以用于二代测序(NGS),或其它需求的RNA分析应用。产品优势:高度特异性去除(高达%)人类、小鼠、大鼠RNA样本中的细胞质rRNA(28S、18S、、5S、45S)和线粒体rRNA(mt16S、mt12S);适用于完整高质量的或降解的RNA(如FFPE样本);灵活的RNAinput量(1ng-1μg的总RNAinput量);自动化友好的操作流程—基于磁珠纯化流程;简单稳定的工作流程—无酶促反应和机械剪切步骤;可以与任何RNA-seq文库构建试剂盒无缝对接(包括Lexogen公司的CORALLTotalRNA-Seq);NEW!流程更快:(包括20min的手动操作时间)。工作流程:亲和探针和总RNA(1ng–1μg)一起混合并变性,促进探针结合靶标序列。然后,在高温下进行RNA和探针的杂交,同时,rRNA去除磁珠可以从溶液中除去探针和杂交的核糖体RNA。***用磁珠纯化剩余的RNA完成整个过程。整个流程通过使用磁珠达到rRNA的***和纯化的目的,便于实现自动化操作,并可在2小时内快速、便捷的除去rRNA。 四川磁珠纯化模块Lexogen试剂盒