SIRVs-Spike-InRNA质控标准品:SIRV-Sets三套SIRV,每一套含有不同的SIRVMix或者Mix组合,满足不用的用途()。Table1|SIRV选择指南。SIRV-Set1(货号)包含Isoform模块的MixesE0、E1和E2;SIRV-Set2(货号and)*含IsoformMixE0;而SIRV-Set3(货号)包含SIRVIsoformMixE0和ERCCs.✔:**可用,:**不可用,部分可用(部分Set可用)。SIRV-Set1:SIRV-Set1含有3种不同的“isoform模块”:E0、E1和E2,每种混合物含有所有69种SIRVisoform转录本(来自7个SIRV基因),但浓度比例不同。在特定的RNA测序工作流程下,E0是评估isoform检测能力的理想选择,因为所有69种转录本都以等摩尔浓度存在,它们不作为测序深度的评估选择。E1中包含中等浓度的给定基因的各种转录本;E2**了一种自然的状态,1个基因的一种转录本占主要丰度(转录本可达17种isoform),其他低表达量的转录本小于1%。E2不*可以校正短读长的转录本检测,而且还可以对长读长或者限制读长的测序平台进行线性和灵敏度评测。 您了解Lexogen试剂盒的优势吗?浙江Quant-seq表达谱文库构建试剂盒Lexogen试剂盒销售厂家
Globin mRNA Block模块:
使用Globin Block在QuantSeq文库构建过程中无需额外的操作步骤:对于生物学及疾病相关研究,血液是一种信息量大且易于获得的样本。Globin mRNAs(HBA1, HBA2, HBB)占血液总RNA的50-80%,严重影响了基因的检测和定量的灵敏度。其他Globin RNA的去除方法需要对RNA进行前处理,需要高起始量的RNA,额外增加成本。
Globin Block可降低Globin RNA Mapped Reads至0.7%:使用Globin Block模块的文库比标准Quantseq文库***降低了总Globin RNA mapped read百分比。在白膜层样品和全血中,使用Globin Block模块可使总Globin RNA mapped read百分比分别低至0.7%和9.7%。
QuantSeq 自动化:Lexogen可提供QuantSeq 3’ mRNA-Seq文库构建流程的自动化版本。在自动化平台上构建Illumina兼容的 3’mRNA-Seq文库,能够提供9,216个i5 / i7 index组合,能实现高通量、大规模基因表达检测。自动化减少了手动操作的时间,提高通量,避免手动操作误差和样本错乱。
自动化 QuantSeq 数据分析:Bluebee Genomics Platform**为QuantSeq 3’ mRNASeq文库构建试剂盒(FWD和REV)的数据提供分析。Lexogen为每个试剂盒提供一个密码,使用者可以登录该平台分析数据。也可用Partek Flow (license required)平台进行数据分析。
天津RiboCop rRNA去除试剂盒 V1.3Lexogen试剂盒价格云生物主营产品包括Lexogen试剂盒,批发价格优惠。
QuantSeq-Flex靶向RNA-Seq文库构建试剂盒V2:QuantSeq-FlexRNA-Seq文库构建试剂盒V2是一个非常灵活的靶向建库试剂盒,使用者可用定制引物进行**链和/或第二链合成,因此可进行靶向测序。同时在定量测序中,每个转录本只生产一个片段,确保定量结果准确。产品优势:试剂盒应用灵活,可用于靶向测序;>100多重引物的靶向文库构建;每个转录本只生成一个片段—对基因表达精确定量;识别已知和未知融合转录本;只需;节省测序成本,Dualindex兼容多达9,216种组合(i5/i7组合)。工作流程:使用QuantSeq-Flex靶向RNA-seq文库构建试剂盒,根据使用的引物类型,可生成四种不同的文库:1)Oligo(dT)用于**链合成,随机引物用于第二链合成(QuantseqFWD);2)Oligo(dT)用**链合成,特异性靶向引物用于第二链合成(靶向3’mRNA-Seq);3)特异性靶向引物用于**链合成,随机引物用于第二链合成(靶向RNA-seq,可用于发现新的融合基因);4)特异性靶向引物用于**链及第二链合成(靶向RNAseq,只检测已知目标基因)。
SPLITRNA提取试剂盒:SPLITRNA提取试剂盒是专门为需要RNA纯化的下游应用特别设计的,如RNA-Seq。它可快速高效的提取出DNA-free的RNA。更重要的,SPLIT无需DNase处理(DNase可能会对RNA造成损害)。SPLITRNA提取试剂盒既可以回收总RNA,还可以分别提取大片段的RNA和小片段的RNA。产品优势:可提取从17nt到大于10,000nt的TotalRNA;可以选择性的提取大片段或者小片段的RNA(Cut-off值在150nt左右);*需要30分钟;很高的RNA完整性和纯度(组织:RIN>8,细胞培养物:RIN10);试验过程无需DNase处理,且保证RNA中无基因组DNA;**的提取效率(低投入量,低至);本试剂盒可用于FFPE样本(样本需经过脱蜡处理);NEW!SPLITforblood试剂盒可去除人血液样本中的GlobinmRNAs。工作流程:SPLITRNA提取试剂盒可以简单、快捷、可靠地从不同物种(如哺乳动物、植物、昆虫、***和细菌)的多种材料(血浆、组织、细胞系)中提取RNA。样品在高盐提取缓冲液下匀浆,既可使RNase失活,又能提高样品的裂解。用酸性的酚-氯仿法抽提RNA,并辅以锁相凝胶管,将含RNA的水相与有机相(含DNA和蛋白质)清晰的分离开来。紧接着将RNA组分用硅胶柱纯化回收,既可回收总RNA,也可回收大片段或/和小片段RNA。 云生物销售的Lexogen试剂盒拥有完善的售后服务。
Quant-seq表达谱文库构建试剂盒:Quantseq在低质量RNA中的表现:Quantseq在高质量和低质量(FFPE)样本中有很好的相关性:用同一来源的不同质量RNA样本进行比较,评估Quantseq适用于高度降解的样本(如FFPE样本)的能力。将人的MOLP-8**细胞系分成两份,一份进行新鲜冷冻,一份处理成FFPE样本,从而使同一个来源的样本得到不同质量的RNA。用RIN值(RNA完整度)来区分RNA的质量。RIN值大于8表示RNA质量高。对应严重降解的样本,RIN值不适用于质量的评估,因此使用DV200值(大于200nt的RN**段的分布值)来表示RNA质量。低完整度的RNA对应低DV200值。RNA提取后,FFPE样本的DV200值为87%(RIN值),冷冻样本RIN值为。使用50ng总RNA,用QuantSeqFWD试剂盒进行文库构建。FFPE样本提取的RNA,即使DV200值低至23%(数据未显示)仍能成功构建Quantseq文库。FFPE样本有对应的低质量RNA建库操作流程,对应冷冻样本,应用标准操作流程。文库在Hiseq2500上进行用1x50bp读长测序。FFPE-RNA文库和冷冻保存RNA文库的基因表达的相关性很高(R²=),表示Quantseq能在不同质量的RNA中表现稳定。 Lexogen试剂盒的不同系列会有不同的优势。四川Mix2 RNA-Seq 数据分析软件Lexogen试剂盒销售
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RiboCop细菌核糖体去除试剂盒:Lexogen的RiboCop细菌核糖体RNA去除试剂盒基于磁珠捕获(无酶促反应),自动化友好的工作流程去除细菌总RNA中的rRNA。RiboCopinput范围宽泛(1ng-1μg),适用于完整的及降解的RNA。针对革兰氏阴性、革兰氏阳性和混合细菌种类进行优化的探针设计以确保转录组结果的无偏差(无脱靶效应),同时有效地去除23S、16S和5SrRNA。细菌中rRNA的含量可高达98%,对于细菌转录组分析来说具有一定的挑战性,特别是在分析复杂细菌群落的转录组时,难度更大。Lexogen的RiboCoprRNA去除试剂盒可有效地从混合细菌样品或单一菌株中去除23S、16S和5SrRNA。兼容完整的以及降解的RNA样本,工作流程简单、高效。rRNA去除后的RNA样品适用于NGS文库的制备及类似的应用,为细菌转录组组成提供一个***的分析方案。RiboCop通过杂交捕获去除不需要的rRNA:RiboCop采用一套亲和探针,可从完整的及降解的RNA中特异和高效地去除rRNA序列。Lexogen精密的探针设计**限度地减少了可能导致NGS数据发生偏差的脱靶效应。Input量可低至1ng,高至1μg的总RNA,取决于样品组成和使用的产品类型。rRNA去除试剂盒中**的探针池可用于革兰氏阴性和革兰氏阳性细菌。 浙江Quant-seq表达谱文库构建试剂盒Lexogen试剂盒销售厂家