核酸分离与纯化的步骤:(1) 机械作用:包括低渗裂解、超声裂解、微波裂解、冻融裂解和颗粒破碎等物理裂解方法。这些方法用机械力使细胞破碎,但机械力也可引起核酸链的断裂,因而不适用于高分子量长链核酸的分离。有报道超声裂解法提取的核酸片段长度从< 500bp ~ > 20kb 之间,而颗粒匀浆法提取的核酸一般< 10kb。(2) 化学作用:在一定的p H 环境和变性条件下,细胞破裂,蛋白质变性沉淀,核酸被释放到水相。上述变性条件可通过加热、加入表面活性剂(SDS、Triton X-100 、Tween 20 、NP-40 、CTAB、sar-cosyl 、Chelex-100 等) 或强离子剂(异硫氰酸胍、盐酸胍、肌酸胍) 而获得。而p H 环境则由加入的强碱(NaOH) 或缓冲液 ( TE、STE 等) 提供。在一定的p H 环境下,表面活性剂或强离子剂可使细胞裂解、蛋白质和多糖沉淀,缓冲液中的一些金属离子螯合剂( EDTA 等) 可螯合对核酸酶活性所必须的金属离子Mg2+ 、Ca2+ ,从而克制核酸酶的活性,保护核酸不被降解。利用特殊的核酸释放剂,在常温下快速裂解病原体释放核酸。天津核算提取设备厂家
磁珠法核酸提取,具有传统DNA提取方法无法比拟的优势,主要体现在:①能够实现自动化、大批量操作,目前已有96孔的核酸自动提取仪,用一个样品的提取时间即可实现对96个样品的处理,符合生物学高通量的操作要求,使得传染性疾病爆发时能够进行快速及时的应对,这一特点使得传统方法望尘莫及;②操作简单、用时短,整个提取流程只有四步,大多可以在36-40分钟内完成;③安全无毒,不使用传统方法中的苯、氯仿等有毒试剂,对实验操作人员的伤害减少到较少,完全符合现代环保理念;④磁珠与核酸的特异性结合使得提取的核酸纯度高、浓度大。武汉自动核算提取试剂盒销售公司细胞或组织在裂解液作用下,其中的DNA/RNA被释放出来。
提取方法:1.表面活性剂快速制备法使用TritonX-100A或NP40表面活性剂对细胞破碎,然后使用蛋白酶K或酚将蛋白去除,使用乙醇沉淀或透析。2.加热法快速制备温度96℃-100℃加热5min,之后离心后取上清,能够在PCR反应时使用。3.碱变性快速制备首先使用NaOH作用20min,再将HCI加入中和,离心后取上清,含有少量DNA。4.玻璃棒缠绕法使用盐酸胍对细胞进行裂解,在乙醇上铺上裂解物,然后在界面使用带钩或U型玻璃棒轻搅,在玻棒绕DNA沉淀液,使得80kbDNA生成。
磁棒法核酸提取仪:通量通常有8、16、32、96通道,磁棒只带走磁珠,转移到下一个步骤相应的反应孔中,另外选择磁棒法的提取仪器较好要功能更齐全的,比如可以加热,每个加热槽较好单独温控,这样可以设置加热、裂解、洗脱的不同温度,另外很重要的一点是,带动磁棒的电机要能带动磁棒进行液体的快速混匀和搅拌,这样才有利于自动化和有助于裂解和漂洗彻底。磁棒法核酸提取仪混匀方式1)震荡混匀:通过磁棒的上下震动混匀磁珠和核酸,为市面上主流方法2)旋转混匀:通过磁棒的旋转混匀磁珠和核酸,相比传统的振荡式混匀技术,气溶胶的产生量大幅降低50%以上。交叉污染而导致的假阳性风险被更有效控制,进一步保障实验结果的准确性。另外,旋转的混匀方式较大限度的保留了DNA的长链,减少核酸机械的断裂,提高后续检测的灵敏度。核酸提取纯化原则和要求:排除其它分子的污染(如提取DNA时排除RNA的干扰)。
核酸检测试剂盒的选择:对于医院检验科及检测机构来说,采用何种核酸提取方法和核酸检测试剂盒是影响病毒检出率的重要因素。对核酸检测试剂盒的评价,虽然Ct值的高低从侧面反映了试剂盒的敏感度,但是该值的高低与试剂盒的扩增体系和条件等均有较大关系,所以不能光通过评价指标来评定试剂盒的好坏,还应结合检测的阳性率等指标,综合选择漏检率低的,尤其是对低浓度的核酸具有较高扩增能力的试剂盒,这样能有效降低漏检的概率。如品牌A扩增试剂盒的Ct值结果虽不如其他品牌,但其检测的阳性率却是较高的,从体系的比较中可见,品牌A的体系中加入的模板量较多为20 μl,而品牌B、D、E、F加入的模板量为10~15 μl,均发生了不同程度的漏检,品牌C及G所加入的模板量相对较低,分别为5和2.5 μl,所以该两个品牌发生单阳或阴性的概率较大,更易导致漏检的发生。因此体系中模板量的高低是影响阳性率重要因素之一,加入模板量高的体系对于低浓度的样本具有较好的检测效果。核酸提取纯化原则和要求:核酸样品中不应存在对酶有克制作用的有机溶剂和高浓度的金属离子。广州全血核算提取设备生产公司
磁珠法核酸提取技术是目前市场上临床应用较普遍的自动化核酸提取技术。天津核算提取设备厂家
在磁珠法核酸提取的过程当中,混合是一个比较重要的步骤,因为磁珠很容易因为重力沉淀到反应容器的底部,所以如何让磁珠和反应溶液充分混合,是完成高精度提取的一个关键。现在常规的混合方式其实很简单,就是把试管晃一晃摇一摇,或者是现在有自动化混合装置,把试管放到装置上,然后它产生一个震动,这个溶剂就混合了,所以这个平台本身可以起到一个搅拌震荡的作用。但是如果要集成到一个集成系统里面的话,现在这些振动混合的装置就不太适合了。如果要在芯片上实现混合的话,我们就提出来用加热气泡的方法,用气体搅动反应溶液形成涡流,这样能够让磁珠和反应溶液充分混合,所以我们这个芯片采用的就是这个方法,这样能够让芯片集成系统更加简单。天津核算提取设备厂家