线粒体与叶绿体相比,线粒体要小一些,直径0.5〜1μm,长1〜2μm,通常呈椭球状或圆柱体。线粒体也由内外两层单位膜包裹,内外膜之间有腔。外膜平整光滑,内膜内折形成嵴。内膜上分布有许多规律排列的带柄的球状小体,即ATP合酶,它利用电子传递过程中形成的质子跨膜电化学势梯度合成ATP。线粒体膜的内部为基质,具有一定的pH和渗透压,含有进行三羧酸循环等多种代谢途径的酶。除此之外,线粒体基质中还含有自身的DNA、RNA和核糖体。96%以上样本实现完成图水平交付。浙江物种分类小基因组测序多少钱
叶绿体是植物进行光合作用的细胞器。具有叶绿体的植物除高等植物外,还有真核藻类。叶绿体的形状因物种的不同而有所差异。藻类的叶绿体形态差异较大,可以是板状、带状、杯状、囊状、星状等。高等植物的叶绿体一般形状比较固定,多为扁平的椭球形,平均直径为4〜6μm,厚2〜3μm。叶绿体由双层膜包被,每层膜厚6〜8nm,外膜与内膜之间有10〜20nm宽的膜间隙。两层膜均由单位膜(由脂质双层及嵌合蛋白质构成的一层生物膜)组成,具有选择透过性。叶绿体膜内的基础物质称为基质。基质中悬浮着复杂的膜片层系统,其基本单位是由单位膜封闭形成的扁平小囊,称为类囊体(也称片层)。类囊体有规律地垛叠在一起形成好似一摞硬币的结构被称为基粒类囊体。贯穿在两个或两个以上基粒之间没有发生垛叠的类囊体,称为基质类囊体。相邻基粒由基质类囊体链接在一起,使类囊体腔之间彼此相通,因而,一个叶绿体内的全部类囊体实际上是一个连续的封闭的三维结构。类囊体膜上有多种蛋白复合体,包括光合电子传递体和光合色素蛋白质复合体,是光合作用中进行光反应的结构。类囊体膜上的光合色素负责在光合作用中吸收光能,这种膜片层系统极大地增加了光合作用中的受光面积,提升了光合作用的效率。 甘肃小基因组测序小基因组测序服务云生物专业小基因组测序服务。
标准分析:1.测序数据概况
(1) 原始测序数据说明
(2) 测序数据质控及统计
(3) 三代测序数据统计
2.基因组组装
3. 基因组组分分析
(1) 编码基因分析
(2) ORFs扫描及跨膜结构预测
(3) 非编码RNA分析
4. 基因功能注释
基因组圈图
高级分析:
比较基因组分析
1.SNP检测与注释
2.Indel检测与注释
3.SV检测
4.基因组共线性分析
5.线粒体与叶绿体基因组片段交流分析
6.共有和特有基因分析
7.系统进化分析、选择压力分析
定制化生信分析
1.密码子偏好性分析
2.长重复序列Long repeat分析
3.简单重复序列SSR分析
4.基因表达量及表达差异分析(可由客户提供RNAseq)
植物叶绿体样本采集操作指南:采样步骤
1. 建议取样,植物绿色组织部分(叶片等)。
2. 取样前建议光照6h 以上,使样本中合成大量叶绿体,再进行取样。建议5g 以上绿色组织样本(叶片等),可多采集一些留做备份样本。
3. 取样后,样本用锡箔纸包裹(或冻存管盛放),迅速过液氮速冻,转移至-80℃冰箱内冻存。
4. 干冰运输。干冰用量建议以3kg/day 计算。一般建议10kg 起。
植物线粒体样本采集操作指南:
采样步骤
1. 建议取样:推荐植物愈伤组织
无法培养愈伤组织的,可采用白化苗(叶绿体含量极低的组织)
2. 愈伤组织取样5g 以上样本;
3. 无法培养愈伤组织的植株,可进行暗培养,建议取样前植株避光培养一周,获得白化苗,取白化苗组织5g 以上(叶片等),可多采集一些留做备份样本。
4. 取样后,样本用锡箔纸包裹(或冻存管盛放),迅速过液氮速冻,转移至-80℃冰箱内冻存。
5. 干冰运输。干冰用量建议以3kg/day 计算。一般建议10kg 起。
一个好的小基因组测序需要具备哪些特点您知道吗?
叶绿体和线粒体有自己的基因组、蛋白质合成系统和膜系统,说明这两种细胞器具有自我繁殖所必须的基本物质,能够进行转录和翻译,这就保证了它们在真核细胞中仍然有一定程度的自主性。有关线粒体遗传的研究,已经清楚地显示出了线粒体的自主性。通过细胞的结合,一种细胞的线粒体可以在杂种细胞及其后代的体内生活和增殖。不仅一种动物的线粒体可以生活在另一种动物的细胞中,而且连叶绿体都可以人工地使它们生活在动物细胞中。例如,在离体的小鼠成纤维细胞的培养基中加入菠菜叶绿体,半小时就可以看到有些叶绿体已经在小鼠的细胞中生存。事实上,叶绿体在***外也能独自生存相当长的时间。例如,把刺海松(一种管藻)的叶绿体培养在简单的无机培养基中,5d后它们仍然能够进行光合作用。 关于小基因组测序的国自然基金有哪些?浙江小基因组测序小基因组测序报价
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叶绿体基因组楝科植物叶绿体揭示物种进化遗传标记:以无患子科Acerbuergerianum为外群的系统发育树显示4种新的楝科是印度楝(Azadirachtaindica)的单系姊妹进化枝。在这个分支内,Cedrelaodorata和Entandrophragmacylindricum聚类在一起,Khayasenegalensis和Carapaguianensis聚类到一起。那么楝科叶绿体基因组标签区(BarcodingRegion)存在哪些潜在的特异性cpDNA变异?这些变异有何意义?文章选取了五种楝科植物和五种非楝科物种(无患子目和蔷薇亚纲)cpDNA的matK基因(cpDNA保守基因之一,用于遗传条码)进行比较分析,旨在鉴定潜在的楝科。鉴定了16个SNP位置,其中五个楝科个体显示相同的核苷酸,其与相同位置的非楝科物种的核苷酸不同。在从GenBank下载的100个楝科物种的matK基因,序列多重比对进一步分析这16个SNP位置。其中三个SNP位于matK基因的3’-末端,编码C-末端与线粒体II内含子的结构域X同源的结构域,并且与N-末端区域相比具有更高的碱性氨基酸。潜在的楝科特异性SNP的进一步验证对木材或木制品的分类学差异具有很大意义。 浙江物种分类小基因组测序多少钱