众所周知,成熟的miRNA可以与装配蛋白(assemblyproteins)相互作用,形成一个复合物,称miRISC。miRISC的主要成分包括miRNA、可被miRNA***的mRNA、GW182和AGO2。人类AGO2蛋白,主要结合miRNA5’末端的U或A碱基,能介导mRNA和miRNA结合,介导后续的翻译***或mRNA分子降解。**近研究发现AGO2蛋白和外泌体miRNA分拣机制之间有一种可能的联系。对外泌体蛋白进行分析时,用质谱MS或WBD都有发现AGO2蛋白的存在。Guduric-Fuchsetal.发现敲除了AGO2基因后,会减少那些偏好于进入外泌体的miRNA的类型或丰度,如HEK293T细胞系来源的外泌体中的miR-451,miR-150和miR-142-3p。还有些证据也支持miRISC和外泌体miRNA分拣之间的联系。首先,miRISC的主要成分被发现与MVB(多囊泡小体)有相同定位;其次,阻碍MVB被溶酶体降解会导致miRISC的过度累积,而阻断MVB形成会导致miRISC的丢失;再次,细胞***时出现的miRNA***靶序列水平的变化可能引起外泌体miRNA的分拣。总之,某些miRNA中的特异序列可能指导它们整合入外泌体,而有些酶或其他蛋白质可能也能控制外泌体miRNA的分拣--以一种不依赖于miRNA序列的形式。 云生物专业致力于外泌体分离。广东分离外泌体活动
基于目前的研究,miRNA分拣如外泌体有四条可能的途径,虽然深层的机制还远不够清楚。一、中性鞘磷脂酶-2(nSMase2)依赖性途径。nSMase2是***个被报道与miRNA进入外泌体有关的分子。Kosakaetal.发现nSMase2的过表达能增加外泌体miRNA的数量,相反地,***nSMase2表达减少外泌体miRNA数量。二、miRNA模体和苏素化核不均一核糖**白(hnRNPs)依赖性途径。Villarroya-Beltrietal.发现苏素化的hnRNPA2B1能识别miRNA序列上的3’端部分,引起特异性的miRNA被装入外泌体。类似的是,其他两种hnRNP家族蛋白,hnRNPA1和hnRNPC,也能与外泌体miRNA结合,提示它们也可能是miRNA分拣机制中的一员。然而,结合的模体还未明确。三、miRNA序列3’末端依赖性途径。Koppers-Lalicetal.发现尿苷化的内源性miRNA的3’末端主要存在于来自B细胞或尿液的外泌体中,而腺苷化的内源性miRNA的3’末端主要存在于B细胞中。以上两种选择模式共同提示了miRNA序列3’末端含有一个关键的分拣信号。四、miRNA诱导的沉默复合体(miRISC)相关途径。 四川测序外泌体要多少钱云生物主营产品包括外泌体。
**多组学研究:与中山大学附属***医院研究团队合作,在难以获得复发转移肝*组织样本的前提下,根据现有文献进行算法还原、建模及数据库挖掘,获取公共数据库中已有肝*样本(尤其是复发转移)RNA-seq、单细胞测序和部分蛋白组学数据,重新进行分析,几乎是零基础进行;协助其构建了相对完善的组学分析体系,并寻找到多个与复发转移相关的靶点,同时构建了新的临床预测模型。**科研基金:检测服务及数据分析助力取得2020年国自然面上十项、青年基金十八项。
基因表达谱的***重编程是*症发展的标志。因此,系统鉴定驱动病理基因表达模式的调节途径是理解和****症的关键步骤。除了作为转移基础的转录网络之外,转录后调控途径也已成为该过程的主要调节因子。miRNA是参与基因沉默的小RNA(smRNA)的亚类,是***个在功能上与乳腺*进展相关的转录后调节因子。RNA结合蛋白(RBPs)也是基因表达的关键调节因子,并且已经显示几种特异性RBP影响**发生和进展。近日,来自加州大学旧金山分校的研究人员探究了**是否存在RNA或蛋白质水平推动的新型调节方式。该研究团队重点关注了*细胞特异性小非编码RNA作为调节因子的可能来源是否能够调节疾病相关的通路和过程。为了搜索在乳腺*细胞中表达并且在正常乳腺组织中检测不到的smRNA,研究人员实施了一种无偏见的方法,将*细胞系的小RNA测序(smRNA-seq)和患者来源的异种移植物(PDX)模型结合起来,整合现有临床乳腺*数据集进行分析。研究发现并注释了201个先前未知的smRNA,这些smRNA在乳腺*细胞中表达而不在乳腺上皮细胞中表达。将这些RNA称为“孤儿”非编码RNA(oncRNA),以突出其*症特异性生物发生。为了评估该类别的任何成员是否在乳腺*进展中起直接作用。云生物专业外泌体服务。
Microenvironment-inducedPTENlossbyexosomalmicroRNAprimesbrainmetastasisoutgrowth。思路:2.那么到底是脑微环境中的哪种细胞,哪种物质介导,致使PTEN丢失呢?作者想想脑内的**细胞周围无非是:星形胶质细胞,**相关成纤维细胞(CAF),正常成纤维细胞,就把这些细胞分别与**细胞共培养,发现只有与星形胶质细胞共培养后,PTEN的表达明显下降。接着作者就把星形胶质细胞给干扰掉,把星形胶质细胞内特异性靶向PTEN丢失的microRNA干掉,发现脑转移的**细胞内的PTEN没有丢失,瘤体也变小了。得出第二个结论:星形胶质细胞来源的miR-19a沉默了**细胞中的PTEN。 尿液的外泌体怎么制备?四川WB外泌体活动
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细胞上清(需采用去除外泌体的培养基):
(1) 细胞在正常含有血清的培养基中培养一定时间,贴壁细胞密度在70 %-80 %,悬浮细胞密度在60 %-70 %;
(2) 对于贴壁细胞,去除原有培养基,换为新的不含外泌体的培养基或者无血清培养基;对于悬浮细胞,300 g,4°C,10 min收集细胞;
(3) 使用不含外泌体的培养基或者无血清培养基悬浮细胞并继续培养。细胞继续培养24-48 小时,根据细胞的生长速度确定收取上清时间;
(4) 收集细胞上清,300 g,4°C,离心10 min;小心吸取上清,注意避免吸入细胞或者细胞碎片;
(5) 3000 g,4°C,再次离心15 min,确保将细胞或者细胞碎片去除干净;
(6) 取上清,注意避免吸入细胞或者细胞碎片,合并相同的细胞培养液上清样品,装入无菌的玻璃瓶,可在4°C短期保存(1-2天),长期保存可冻存于-80°C 。建议细胞上清分离后尽快进行外泌体分离,保存在4°C和-80°C,都会对产量有一定的影响。
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