Adonis(置换多元方差分析,分析不同分组或环境因子对样品差异的解释度):ADONIS置换多元方差分析(Permutationalmultivariateanalysisofvariance,PERMANOVA),又称非参数多因素方差分析(nonparametricmultivariateanalysisofvariance)、或者ADONIS分析。使用PERMANOVA可分析不同分组因素对样品差异的解释度,并使用置换检验进行***性统计。基本原理:置换多元方差分析(PERMANOVA,Adonis)是一种基于F统计的方差分析,依据距离矩阵对总方差进行分解的非参数多元方差分析方法。基本步骤是基于OTU丰度表,计算样本间样本间Bray-curtis距离,然后adonis分析生成结果,绘图展示。术语解读:OTU:operationaltaxonomicunits,分类单元Df:自由度,其值=所比较的分组数量-1;SumsOfSqs:即Sumsofsquares,总方差,又称离差平方和;MeanSqs:即Meansquares,均方(差);FModel:F检验值;R2:即Variation(R2),方差贡献,表示不同分组对样品差异的解释度,即分组方差与总方差的比值,R2越大表示分组对差异的解释度越高;Pr(>F):***性p值,小于***。数据要求:OTU丰度表或者样本距离矩阵。 根据委托方提供的参考文献和要求进行个性化特定分析。辽宁成果发表指导数据科学活动
RoastROAST是一种差异表达分析方法,有助于提高统计能力、组织和解释结果以及在不同实验中的关联表达模式,一般适用于microarray、RNA-seq的表达矩阵,用limma给全部基因做差异表达分析,不需要筛差异表达基因。基本原理:ROAST是一种假设驱动的测试,对结果基因集做富集分析,富集分析考虑基因集中基因的方向性(上调或下调)和强度(log2倍变化),判断上/下调基因是否***富于集目标基因集;ROAST使用rotation,一种MonteCarlotechnology的多元回归方法,适用于样本数量较少的情况;roast检验一个geneset,对于复杂矩阵,使用mroast做multipleroasttests。富集分析结果用barcodeplot展示,使上/下调基因在目标基因集中的分布可视化。数据要求:表达矩阵。 北京组学数据处理数据科学售后服务云生物提供数据科学服务。
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当前位置:首页>商城导航>immunetherapy免疫***收藏|分享immunetherapy免疫***价格:¥:标准套餐高级套餐购买数量:加入购物车立即购买产品详情产品评论(0)immunetherapy免疫疗法免疫疗法是指利用人体自身免疫系统,来终止**细胞。它通过操纵免疫系统,来实现靶向**抗原或突破T细胞浸润的障碍。免疫系统是**的重要***者。很多临床数据表明,**的发生与机体免疫功能密切相关,宿主免疫功能低下或受***往往都会导致**发生率增高。**能够发生的原因之一在于**细胞的免疫逃逸和其分泌的免疫***因子,导致**微环境中的免疫细胞获得免疫***性。因此重新***免疫细胞,逆转**微环境的免疫***状态,是免疫疗法的重要目标。应用场景预测单个样本或者某亚型对免疫***的响应可能性基本原理:通过靶向***免疫检查点受体——CTLA4,PD1及其配体(PDL1,PDL2),来抵抗**微环境的免疫***作用,进而解除机体免疫***,****功能发挥抗**作用。PD-1是共刺激受体B7/CD28家族的成员。它通过与其配体programmeddeathligand1(PD-L1)和programmeddeathligand2(PD-L2)结合来调节T细胞活化。CTLA-4介导的T细胞***。 承担各类项目超过400余项。
TMB**突变负荷**突变负荷(TMB)作为免疫疗法的生物标志物,能够较好的预测患者免疫***的疗效。基于**突变负荷,可以从一种新的角度探寻基因跟免疫及预后的关系。一般应用场景:基于TMB预测不同性状的免疫***疗效、不同基因表达或突变对免疫***潜在的影响。基本原理:**突变负荷(TumorMutationBurden,TMB),通常被定义为一份**样本中,所评估基因的外显子编码区每兆碱基中发生置换和插入/缺失突变的总数。近年许多研究都报道了TMB与PD-1/PD-L1抑制剂的疗效高度相关,同时基于TMB进行的临床研究都得到了较好的结果。这让一些**患者可以通过TMB标志物对免疫疗法的疗效进行一定程度的预测。结合TMB,可以从免疫***角度探寻关键基因、探究不同亚型**存在的不同发病机制。数据要求:基因突变数据,临床或其他分类数据。 与复旦大学问附属医院合作,开发人血液外泌体中RNA的数据库。云南数据库建设数据科学专业服务
自有服务器机房,可随时调用各计算平台算力,且团队成员有多年科研经历。辽宁成果发表指导数据科学活动
单细胞测序数据挖掘:GEO目前收录的单细胞研究样本已经超过2万例,单细胞测序几乎成为生物医学领域CNS***文章的标配。实验费用高昂,阻断了CNS梦,既然其他数据可以挖,单细胞测序数据照样可以挖。已知公共数据库中单细胞测序数据涉及各种疾病类型,包括**、免疫细胞、炎症类甚至神经、肌肉、骨骼等,样本丰富、数据庞大,你不挖就是失去了一座金山。我们提供各种设计单细胞测序、各种测序、芯片、多组学的公共数据库挖掘、培训、模型构建、临床统计、算法还原服务;你能想到,我能做到;你提供参考文献、思路和目的,我们提供结果;如果没有思路,我们提供付费科研设计服务。示例如下:利用公共数据库的1539个单细胞样本,构建自己的生物学故事。 辽宁成果发表指导数据科学活动