industryTemplate云生物专业致力于外泌体服务。上海数据库外泌体多少钱
与复旦大学问附属**医院合作,开发人血液外泌体中RNA的数据库(exoRBase),目前已经稳定运行三年,**个血液外泌体RNA自有数据库,形成区域数据中心,集本院所数据搜集、全球数据检索上传、文献引用、二次分析模块滚动开发、药物及治疗方案革新的重要平台;数据库***期建设同时发表于NucleicAcidsResearch,关联影响因子10分以上文章3篇,且在不断增加中。微生物分析平台:BSL-3实验室致病***原微生物数据分析平台,根据实验室现有数据,建立本地化数据自动化、智能化分析平台,加速实验室数据分析速度与产出。**全转录组研究:与南京鼓楼医院合作,对其测定的乳腺*组织RNA-seq样本进行***重新分析(原有基础分析无法获得有效靶点),并联系**对其原始科研方案进行修改,同时进行大规模数据挖掘,弥补其有效样本不足问题(两期分析,共入组800余例深度测序样本);通过分析,获得8个全新的与乳腺*转移复发相关的LncRNA和cicleRNA候选靶点;我方联系第三方公司与医院实验室同时进行平行双盲有效性验证,通过260例实际人体样本检测,8个靶点在98%的样本中与预测结果完全一致,且平行实验结果完全吻合。 浙江WB外泌体活动云生物就带您了解一下外泌体的特点。
外泌体内包含多种不同分子,如蛋白质、脂质、DNA、mRNA和miRNA,其中miRNA受到**多的关注,由于它们在基因表达调控上有着重要作用。Goldieetal.发现在所有的小RNA中,miRNA在外泌体中所占的比例比它们的来源细胞更高。有证据显示,miRNA并不是随机整合入外泌体中的。Guduric-Fuchsetal.分析了许多不同细胞系和它们各自分泌的外泌体中miRNA的表达水平,发现一些miRNA亚群,如miR-150,miR-142-3p,miR-451更偏好于进入外泌体。类似的是,Ohshimaetal.比较了不同*细胞株分泌的外泌体中的let-7miRNAfamilymembers的表达水平,将胃*细胞株AZ-P7a的外泌体与其他细胞株如肺*细胞株SBC-3/DMS-35/NCI-H69,结直肠*细胞株SW480/SW620和胃*细胞株AZ-521的外泌体中的let-7miRNA家族的表达水平。结果是,他们发现let-7miRNA家族在胃*细胞株AZ-P7a分泌的外泌体中较丰富,但是不如其他细胞株中含量多。
exoRBase由云生物平台协助复旦大学上海**研究所黄胜林研究员团队构建,该数据库于2018年1月发表在NucleicAcidsResearch杂志,文章题为:exoRBase:adatabaseofcircRNA,lncRNAandmRNAinhumanbloodexosomes。exoRBase是人类血液外泌体的RNA-seq数据分析的circRNA、LncRNA和mRNA的存储库,还包括已发表文献的实验验证。exoRBase对标准化RNA-seq数据的RNA表达谱进行了整合和可视化,数据涵盖了正常个体和不同疾病患者。数据库网址:。exoRBase数据库收集和描述人类血液外泌体中所有长的RNA,目前包含58330个circRNA、15501个LncRNA和18333个mRNA,提供了注释、表达水平和可能的来源组织,数据库将定期更新,提供更多的外泌体RNA信息。数据库收录的样本包括健康对照者32例,冠状动脉心脏疾病(CHD)6例,结肠*(CRC)12例,肝细胞*(HCC)21例,胰腺腺*(PAAD)14例,乳腺*2例。所有收集到的数据都经过相同的预处理。除此之外,还分析了LncRNA和mRNA在人类组织中的组织特异性,以及circRNA的来源等。 外泌体全转录组测序实验步骤是什么?
外泌体的相关成分:⊙外泌体的膜同细胞一样,是磷脂双分子层
⊙外泌体膜含有MHC-1/2蛋白,能绑定特异性的肽链
⊙外泌体膜中有跨膜蛋白PGRL、LAMP1、LAMP2
⊙外泌体膜中有膜转运融合蛋白annexins、RAN、GTPases
⊙外泌体膜上有脂质筏Chol、ceramide、SM、PC,限制膜流动,参与包括跨膜信号转导、物质内吞、脂质及蛋白定向分选的多种功能
⊙外泌体中含有核酸,包括miRNA、DNA、lncRNA、mRNA;同时还有一些蛋白、脂类也能被包裹到外泌体中
⊙与外泌体产生相关的重要分子:Ral、ARF6、PLD2、RAB家族
⊙一些物质进行外泌体中是特异性的:如hnRNPA2B1能结合lncRNA或miRNA特异性的序列(GGAG/CCCU),进行主动包埋 外泌体的好处有很多。江苏分离外泌体售后分析
血清样品外泌体怎么制备?上海数据库外泌体多少钱
样本准备注意事项:●采集的样本需要符合纳入标准:如年龄、肥胖(身高、体重)、血糖血脂血压、诊断情况等。●统一早晨空腹**,尽量避免样本间的差异影响。●如个别样本发生溶血,则弃掉。●样本编号用油性笔清楚地写在管壁及管盖上。●离心管在放入冰箱前,用封口膜密封。●如果提供的是冻存细胞株,需提供详尽的复苏方法。●细胞培养基必须使用去除exosome(de-exosome)的血清或者无血清培养基(例如ThermoFisher的SFM)。●分离外泌体前的样品不能加入任何RNA保护剂(如Trizol)。●分离好的外泌体如需进行电镜观察,需要放4°C保存,并且不宜保存太久。●全血建议使用PAXgene管保存,不可冻融,取血后尽早制备血浆或血清,血浆或血清可以-80°C保存,但应避免反复冻融。●储存条件以及储存时间影响外泌体得率,保存在-80℃冰箱中的样本,如果储存时间过长,外泌体产量也会***降低。●干冰运输应采用壁厚且质量完好的泡沫箱,24小时到达的,干冰数量不得低于5公斤;48小时到达的,干冰数量不得低于8公斤;夏季适当增加干冰(倍)。 上海数据库外泌体多少钱