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    叶绿体是植物进行光合作用的细胞器。具有叶绿体的植物除高等植物外，还有真核藻类。叶绿体的形状因物种的不同而有所差异。藻类的叶绿体形态差异较大，可以是板状、带状、杯状、囊状、星状等。高等植物的叶绿体一般形状比较固定，多为扁平的椭球形，平均直径为4〜6μm,厚2〜3μm。叶绿体由双层膜包被，每层膜厚6〜8nm,外膜与内膜之间有10〜20nm宽的膜间隙。两层膜均由单位膜（由脂质双层及嵌合蛋白质构成的一层生物膜）组成，具有选择透过性。叶绿体膜内的基础物质称为基质。基质中悬浮着复杂的膜片层系统，其基本单位是由单位膜封闭形成的扁平小囊，称为类囊体（也称片层）。类囊体有规律地垛叠在一起形成好似一摞硬币的结构被称为基粒类囊体。贯穿在两个或两个以上基粒之间没有发生垛叠的类囊体，称为基质类囊体。相邻基粒由基质类囊体链接在一起，使类囊体腔之间彼此相通，因而，一个叶绿体内的全部类囊体实际上是一个连续的封闭的三维结构。类囊体膜上有多种蛋白复合体，包括光合电子传递体和光合色素蛋白质复合体，是光合作用中进行光反应的结构。类囊体膜上的光合色素负责在光合作用中吸收光能，这种膜片层系统极大地增加了光合作用中的受光面积，提升了光合作用的效率。 云生物专业致力于小基因组测序服务。北京小基因组测序小基因组测序售后服务

    使用IlluminaHiseq测序平台对样品进行测序，产生的原始数据（RawData）存在一定比例低质量数据，为了使得后续分析的结果更加准确可靠，会对原始的测序数据进行如下处理：1)去除reads中的adapter序列；2)剪切前去除5’端含有非AGCT的碱基；3)修剪测序质量较低的reads末端(测序质量值小于Q20)；4)去除含N的比例达到10%的reads；5)舍弃去adapter及质量修剪后长度小于50bp的小片段。PacBioSequel平台测序数据以bam格式保存，可以转化成fasta或fastq序列格式。PacBioSequel平台原始测序数据中存在接头序列、低质量序列、测序错误序列等，为了得到更精确的组装结果，需要对原始的测序数据进行如下处理：1.过滤掉长度小于100bp的Polymerasereads；2.过滤掉质量小于reads；3.从Polymerasereads中提取Subreads，过滤掉adapter序列；4.过滤掉长度小于500bp的Subreads。 江苏小基因组测序小基因组测序售后服务云生物提供基因组多态性分析。

虎耳草科植物叶绿体基因组比较：五种虎耳草叶绿体基因组相对保守，基因组没有重排；与其他叶绿体基因组相比，叶绿体基因组较小；rps16内含子从Penthorum chinense参考基因组中丢失，M. rossii和O. rupifraga中rpl2内含子丢失。 此外，IR区域在这些物种中比LSC和SSC区域更保守。LSC / IRB，IRB / SSC，SSC / IRA和IRA / LSC的边界区域**高度可变的区域，在密切相关的物种cpDNA中有许多核苷酸变化。因此，我们比较了五种虎耳草叶绿体基因组和参考基因组之间的IR边界位置及其相邻基因。结果表明，IR区域在这些物种中比LSC和SSC区域更保守。推测，具有更接近系统发育关系的物种将具有更多相似的边界特征。

    线粒体和叶绿体的基因组与细菌基因组具有明显的相似性，线粒体和叶绿体具有细菌基因组的典型特征。它们均为单条环状双链DNA分子，不含5-甲基胞嗨睫，无组蛋白结合并能进行**的复制和转录。此外，在碱基比例、核背酸序列和基因结构特征等方面，线粒体和叶绿体基因组也与细胞核基因组表现出***差异，而与原核生物极为相似。同时，线粒体和叶绿体具有自身的DNA聚合酶及RNA聚合酶，能**复制和转录。线粒体和叶绿体具备**、完整的蛋白质合成系统。线粒体和叶绿体的蛋白质合成机制类似于细菌，而有别于真核生物。例如，与细菌一样，线粒体和叶绿体中蛋白质的合成从N-甲酰甲硫氨酸开始，而真核细胞中蛋白质的合成从甲硫氨酸开始；线粒体和叶绿体的核糖体较小于真核生物80S核糖体；线粒体、叶绿体和原核生物的核糖体中只有5SrRNA,而不少真核细胞的核糖体中存在SrRNA；线粒体RNA聚合酶可被原核细胞RNA聚合酶的***剂（如利福霉素）所***，但不被真核细胞RNA聚合酶的***剂（如放线菌素D）所***等。 云生物提供叶绿体与线粒体片段交流分析。

虎耳草科植物cpDNA的重复序列和热点区域：O. rupifraga-BJCP cpDNA***鉴定出58个gSSRs。其中，44个位于LSC区域，而8个和6个分别位于IR和SSC区域。 在这些SSR中，43个mo**1个di-，4个tetra-。在O. rupifraga和M. rossii的叶绿体基因组中，分别检测到15和17个正向重复序列序列（>30bp），3个叶绿体基因组中都检测到17个回文重复序列。在cpDNA中同事检测到60bp、61bp、62bp和79bp长重复序列。热点区域将为随后的Oresitrophe和Mukdenia的系统地理学和分化历史研究提供重要的遗传信息。 那么小基因组测序的优势都有哪些呢？江苏小基因组测序小基因组测序售后服务

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线粒体基因组与疾病研究：线粒体是生物细胞内的能量工厂，具有单独的基因组。线粒体是核外**含有遗传效应物质的细胞器,能够**进行基因的转录、翻译和蛋白质的表达，起基因组约占人类基因组的1%，比核DNA突变率高约10倍,损伤修复能力比核DNA低。研究线粒体基因组序列，有助于研究细胞代谢，线粒体遗传病及法医研究等。云生物拥有多种物种线粒体基因组检测**，可以快速准确的测序线粒体基因组。同时利用数字PCR仪，还可对线粒体数目进行精确的拷贝数定量，还可以用焦磷酸测序仪对线粒体多态性和异质性进行检测。北京小基因组测序小基因组测序售后服务