exoRBase由云生物平台协助复旦大学上海**研究所黄胜林研究员团队构建,该数据库于2018年1月发表在NucleicAcidsResearch杂志,文章题为:exoRBase:adatabaseofcircRNA,lncRNAandmRNAinhumanbloodexosomes。exoRBase是人类血液外泌体的RNA-seq数据分析的circRNA、LncRNA和mRNA的存储库,还包括已发表文献的实验验证。exoRBase对标准化RNA-seq数据的RNA表达谱进行了整合和可视化,数据涵盖了正常个体和不同疾病患者。数据库网址:。exoRBase数据库收集和描述人类血液外泌体中所有长的RNA,目前包含58330个circRNA、15501个LncRNA和18333个mRNA,提供了注释、表达水平和可能的来源组织,数据库将定期更新,提供更多的外泌体RNA信息。数据库收录的样本包括健康对照者32例,冠状动脉心脏疾病(CHD)6例,结肠*(CRC)12例,肝细胞*(HCC)21例,胰腺腺*(PAAD)14例,乳腺*2例。所有收集到的数据都经过相同的预处理。除此之外,还分析了LncRNA和mRNA在人类组织中的组织特异性,以及circRNA的来源等。 云生物专业致力于外泌体的销售。四川电镜外泌体多少钱
外i必体(exosomes)是一种能被机体内大多数细胞分泌的直径大约为30-150nm的具有脂质双层膜的微小囊泡。它***存在并分布于各种体液中,携带和传递重要的信号分子,形成了一种全新的细胞间信息传递系统,影响细胞的生理状态并与多种疾病的发生与进程密切相关。2013年,发现细胞囊泡转运机制的科学家们,荣获了当年的诺贝尔生理学或医学奖。作为人体内的一类重要囊泡,外泌体逐步成为科研热点。分离方法——超速离心。当前有多种纯化提取外泌体的方法,诸如PEG试剂盒、免疫提取等,但很多试剂盒的成分及分离原理都未有效披露,由于研究的是外泌你的亚群分类,推荐更倾向于选择超速离心的方法,它能够***有效的收集所需的外泌体而不会错失任何的数据。鉴定方法:电径、粒镜、蛋白。 四川鉴定外泌体售后服务血浆样品外泌体怎么制备?
体液样本收集外泌体,乳汁。1、样本采集:
1).采集方式:不同的方式(手动或电刺激)收集的乳汁会影响其脂肪的含量,皮肤对样本的污染程度也不同。
2). 采集部位:乳房的前后部产生的乳汁成分有一定差异,一般采集相同体积后混合,或者从全乳收集。
3). 样本保存:低温保存。不可冰冻或常温、高温保存。不同的保存容器(玻璃、聚乙烯、聚丙烯等)会通过影响细胞含量而影响外泌体的含量。
2、注意事项
要注意选择对照组,因为有很多因素可以影响乳汁中外泌体的成分,其中包括泌乳阶段、乳汁产量、婴儿哺乳、饮食、代谢状态、生理与心理状态等。例如初乳(1-5天)、过渡乳(6-15天)和成熟乳中蛋白质、脂肪、维生素和抗体的浓度相差很大。
体液样本收集外泌体,脑脊液。
脑脊液中的外泌体含量虽然较其他体液如血液少,但可作为神经系统疾病的潜在生物标志物。脑脊液相对较为稳定,但仍需注意以下方面:
1、CSF采集时避免CSF受血液污染
2、对照标本的获取
由于健康对照脑脊液获取困难,往往以其他神经异常的患者为对照。需要注意对外泌体的影响。
目前关于外泌体等胞外囊泡的收集,还缺少标准化的样本采集参考标准,需要在实验中不断摸索完善,各位勤劳的童鞋,多多努力,说不定你的方法,会成了标准化的蓝本哟。
根据您的具体需求选择不同的外泌体系列。基于目前的研究,miRNA分拣如外泌体有四条可能的途径,虽然深层的机制还远不够清楚。一、中性鞘磷脂酶-2(nSMase2)依赖性途径。nSMase2是***个被报道与miRNA进入外泌体有关的分子。Kosakaetal.发现nSMase2的过表达能增加外泌体miRNA的数量,相反地,***nSMase2表达减少外泌体miRNA数量。二、miRNA模体和苏素化核不均一核糖**白(hnRNPs)依赖性途径。Villarroya-Beltrietal.发现苏素化的hnRNPA2B1能识别miRNA序列上的3’端部分,引起特异性的miRNA被装入外泌体。类似的是,其他两种hnRNP家族蛋白,hnRNPA1和hnRNPC,也能与外泌体miRNA结合,提示它们也可能是miRNA分拣机制中的一员。然而,结合的模体还未明确。三、miRNA序列3’末端依赖性途径。Koppers-Lalicetal.发现尿苷化的内源性miRNA的3’末端主要存在于来自B细胞或尿液的外泌体中,而腺苷化的内源性miRNA的3’末端主要存在于B细胞中。以上两种选择模式共同提示了miRNA序列3’末端含有一个关键的分拣信号。四、miRNA诱导的沉默复合体(miRISC)相关途径。 尿液抽提外泌体需要提供多少量?河北WB外泌体销售
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外泌体内包含多种不同分子,如蛋白质、脂质、DNA、mRNA和miRNA,其中miRNA受到**多的关注,由于它们在基因表达调控上有着重要作用。Goldieetal.发现在所有的小RNA中,miRNA在外泌体中所占的比例比它们的来源细胞更高。有证据显示,miRNA并不是随机整合入外泌体中的。Guduric-Fuchsetal.分析了许多不同细胞系和它们各自分泌的外泌体中miRNA的表达水平,发现一些miRNA亚群,如miR-150,miR-142-3p,miR-451更偏好于进入外泌体。类似的是,Ohshimaetal.比较了不同*细胞株分泌的外泌体中的let-7miRNAfamilymembers的表达水平,将胃*细胞株AZ-P7a的外泌体与其他细胞株如肺*细胞株SBC-3/DMS-35/NCI-H69,结直肠*细胞株SW480/SW620和胃*细胞株AZ-521的外泌体中的let-7miRNA家族的表达水平。结果是,他们发现let-7miRNA家族在胃*细胞株AZ-P7a分泌的外泌体中较丰富,但是不如其他细胞株中含量多。 四川电镜外泌体多少钱