常用的病毒检测方法：常用的病毒检测方法有3种，植物直接测定法、指示植物测定法、血清学方法。前2种方法直观，周期长，准确性较差，且无法快速检测。后者灵敏度髙，获得检测结果快速，是目前检测病毒的较好方法。如采用双抗体夹心酶联免疫吸附测定法（DAS^ELISA)，进行CMV，LSV病毒检测。每种病毒都有相应的病毒试剂和测定方法。经检测，若是无病毒的材料，该组培苗就可以大量扩繁，并大量生产出百合脱毒种球，以满足百合生产的需要。未知病原微生物样本要经历：核酸纯化-文库构建-生物信息学分析这三大基本流程才能完成鉴定。山东微生物检测诊断
人们对病毒认识不断深入，以及生物技术的发展，人类积累了多种病毒性疾病的鉴别诊断能力，掌握了部分病毒的致病机制及流行规律，研制出一些病毒的特异性疫苗，并设计生产了各种抗病毒化学制品，极大地降低了病毒性疾病的危害性。病原微生物检测方法-高通量测序技术之检验检疫中的应用作为近些年出现的新技术，高通量测序技术经过不断地发展，已经在生物技术、食品安全和医药卫生等各个领域得到应用。在检验检疫领域中，高通量测序技术也正在得到越来越多的应用。高通量测序在降低单碱基成本的同时，测序的准确率更高，这无疑会提高基于DNA序列的分子鉴定的准确率。同时，深度测序让复杂样品中非常低丰度成员的检测成为可能，这种检测低丰度种群的能力会深刻影响复合样品中病原微生物的检出率。RNA未知病毒检测常用的病毒检测方法：植物直接测定法、指示植物测定法、血清学方法。
未知病原微生物鉴定相关知识：在实验室中，为了分离某些厌氧菌，可以利用装有原培养基的试管作为培养容器，把这支试管放在沸水0浴中加热数分钟，以便逐出培养基中的溶解氧。然后快速冷却，并进行接种。接种后，加入无菌的石蜡于培养基表面，使培养基与空气隔绝。另一种方法是，在接种后，利用n2或co2取代培养基中的气体，然后在火焰上把试管口密封。有时为了更有效地分离某些厌氧菌，可以把所分离的样品接种于培养基上，然后再把培养皿放在完全密封的厌氧培养装置中。
对于无菌药品生产来说生产区域的微生物种类非常有限，更具无菌药品的具体生产内容和过程，洁净区内会有芽孢杆菌占绝大多数酵母菌、霉菌和葡萄球菌少量存在，放射根瘤菌、苛养颗粒链菌等少数微生物种类。在无菌药品生产过程中，应初步建立微生物数据库，建立洁净区微生物数据库是追溯洁净区微生物污染来源的有效方法，有效指导并控制无菌药品生产中的污染问题。同时，为防止微生物污染，通过微生物数据库并结合一些常规方管理法，比如对污染源及其途径进行了解，并进行微生物限度检查，控制药品质量。注意在洁净区的人员数量应控制好，并要求人员具有自我约束的意识等，从而有效控制洁净区微生物。在生产中应用微生物鉴定技术和检测设备向微型化以及多功能化方向发展，更具有较快的检测速度以及更为准的鉴定结果。病毒研究的发展与病毒培养和检测方法的进步有密切的关系。
微生物检测中含有一种以上的微生物培养物称为混和培养物，如果在一个菌落中所有细胞均来自于一个亲代细胞，那么这个菌落称为纯培养(pureculture)。在进行菌种鉴定时，所用的微生物一般均要求为纯的培养物。得到纯培养的过程称为分离纯化，方法有许多种。先把微生物悬液通过一系列稀释，取一定量的稀释液与熔化好的保持在40-50℃左右的营养琼脂培养基充分混合，然后把这混合液倾注到无菌的培养皿中，待凝固之后，把这平板倒置在恒箱中培养。单一细胞经过多次增殖后形成一个菌落，取单个菌落制成悬液，重复上述步骤数次，便可得到纯培养物。病原微生物检测的不可知性，使高通量测序成为研究这类病原微生物的有用工具。RNA未知病毒检测
微生物检测方法中常用的有平板菌落计数法。山东微生物检测诊断
病原微生物检测方法中的多种PCR结合使用，基因芯片技术与多重PCR结合可以通过PCR对目的基因进行放大，通过基因芯片的荧光探针增加检测的灵敏性和特异性，使得两种检测技术的优势互补，已应用于病原微生物的检测。将病原体特异性基因作为靶基因设计出引物与探针，进行多重PCR扩增，制备出寡核苷酸芯片，再对待测样本靶基因进行多重PCR扩增，将扩增产物与病原菌多重PCR基因芯片检测体系杂交，可根据杂交信号直观地判读样品中所含病原体的种类、型别、毒力、侵袭力，从而对病原体进行检测和鉴定。山东微生物检测诊断
