羟甲基化DNA免疫沉淀测序(HydroxymethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing,hMeDIP-Seq)是通过5hmC特异性抗体富集羟甲基化的DN**段,然后结合高通量测序技术在全基因组水平上以较小的数据量,快速、高效地寻找羟甲基化区域。可广泛应用于羟甲基化与疾病关系研究以及羟甲基化在胚胎发育过程中的研究。技术优势:从项目背景了解、协助方案设计、实验材料选取、建库测序,到数据分析每个项目有特定的科学问题;需要专业、有价值的建议;科学、缜密的设计及时高效的沟通;以保障高质量研究成果云生物提供甲基化服务。江苏850K芯片DNA甲基化经验丰富
第三代测序技术的出现,更是让甲基化的直接测定成为可能。一年前,美国PacificBiosciences公司利用独有的单分子实时(SMRT)测序技术,直接测定了DNA的甲基化。这项成果发表在《NatureMethods》杂志上。甲基化特异性PCR(MS-PCR):DNA在亚硫酸氢盐作用后,DNACpG若无甲基化,则序列中的C改变为U,若有甲基化则保持不变,因此从理论上讲,用不同的引物做PCR,即可检测出这种差异,从而确定基因有无CpG岛甲基化。因此根据目的基因修饰前后的改变,就可以相应设计M和U引物,有时我们需要设计两轮引物。这种方法灵敏度高,无需特殊仪器,因此经济实用,是目前应用**为***的检测方法。不过也存在一定的局限性,预先需要知道待测片段的DNA序列,引物的设计非常重要。另外,亚硫酸氢盐处理也十分关键,若处理不完全则可能导致假阳性的出现。浙江WGBSDNA甲基化活动焦磷酸测序技术是甲基化检测新的金标准。
甲基化是表观修饰的重要部分,DNA甲基化可以引起DNA构象、稳定性及DNA与蛋白质相互作用方式的改变,从而影响基因表达。DNA链中含有很多CpG结构,双链DNACpG中的胞嘧啶五位碳原子通常容易被甲基化,基因组中60~90%的CpG都被甲基化,未甲基化的CpG成簇出现在基因启动子**序列或者转录起始位点。DNA甲基化转移酶可以催化CpG的甲基化反应。DNA甲基化转移酶有两种,Dnmt1是一种持续性甲基化转移酶,作用于只有一条链甲基化的DNA双链,使其完全甲基化,参与DNA复制过程中新合成链的甲基化修饰;Dnmt3a/Dnmt3b是一种从头甲基化转移酶,可以在CpG上产生新的甲基化修饰,首先半甲基化,继而全甲基化,该甲基化转移酶可能参与细胞生长分化的调控,在**基因甲基化中起到重要作用。近年来CRISPR/Cas9技术得到快速发展,在基因切割活性失活的dCas9的5’端融合一个Dnmt3a,能够通过dCas9介导特定位点的甲基化修饰,调控相关基因的表达。
全基因组甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)是将重亚硫酸盐Bisulfite处理和高通量测序技术相结合,对有参考基因组进行全基因组范围的单碱基分辨率的甲基化测序,是DNA甲基化检测的“金标准”。WGBS满足全基因组DNA甲基化图谱及疾病关联分析、基因调控分析、疾病的甲基化标志物筛选等探索性课题的研究。技术优势:DNA甲基化检测**有力的工具,单碱基分辨率,检测每个C碱基的甲基化状态,全基因组范围,**限度地获得甲基化信息,适合所有有参考基因组的物种适合各种类型的样本。通过甲基化数据,筛选疾病耐药的差异甲基化。
DNA甲基化(DNA methylation)是指在DNA甲基化转移酶(DNMT)催化下,以S-腺苷甲硫氨酸为甲基供体,将活性甲基转移至DNA链中特定碱基上的化学修饰过程。哺乳动物基因组中,DNA甲基化多发生在CpG二核苷酸中的胞嘧啶的5位碳原子。DNA甲基化是一种表观(epigenetic)修饰,它在不改变DNA序列的情况下,对个体的生长、发育、基因表达模式以及基因组的稳定性起到重要的调控作用,这种修饰是可逆的,并且这种修饰在发育和细胞增殖的过程中是可以稳定传递的。近年来的大量研究表明,DNA异常甲基化与**的发生、发展、细胞*变有着密切的联系。在正常组织里, 70%到90%散在的CpG是被甲基修饰的。浙江WGBSDNA甲基化活动
DNA异常甲基化与疾病的发生、发展有着密切的联系。江苏850K芯片DNA甲基化经验丰富
恶性**细胞从**原发部位,经过淋巴道、血管或体腔等途径,到达身体其他部位继续生长,称为**转移。**转移是*****中的**障碍,也是目前**患者死亡的主要原因。近年来,临床上为了成功进行*****,对**的侵袭和转移进行了大量的研究,发现其中有很多方面和DNA甲基化相关。上皮-间质转化(epithelial mesenchymal transition, EMT)指上皮细胞向间质细胞转化的现象,研究表明EMT在**形成和转移过程中也发挥了非常重要的作用。EMT时上皮组织基本结构消失,如失去细胞间粘附和细胞极性、细胞内骨架重排等,获得间质细胞特性(如细胞迁移能力、侵袭能力、抗凋亡能力等)。EMT**初是在细胞体外培养过程中发现的,随着人们对人体**和实验动物模型的观察越来越深入,发现EMT过程与**发生过程密切相关。尤其是EMT过程对于**浸润(invasion)、转移(metastatic dissemination)以及药物耐受等都有关系,而与EMT过程相对的间质-上皮转化(mesenchymal epithelial transition, MET)过程则似乎是在**细胞播散之后形成转移灶过程中起到重要作用。江苏850K芯片DNA甲基化经验丰富