数字PCR (Digital PCR) 技术作为新一代核酸检测和***定量技术,目前在痕量核酸样本检测、复杂样本稀有突变检测和微小表达差异鉴定等方面表现出的优势已被普遍认可。NGS和CRISPR等分子生物学技术的发展,为数字PCR技术在microRNA研究、基因组拷贝数精细鉴定、致病微生物鉴定、转基因成分鉴定及基因细胞***等诸多领域带来了新的契机。良好的引物探针设计是数字PCR实验获得成功的关键因素之一。这正是众多研究人员选择LNA(锁核酸技术)的原因——LNA修饰的引物和探针采用了成熟可靠的算法设计,获得了全世界科学家的信赖。原始数据中往往发现阳性信号与阴性背景之间存在许多弱阳性信号。数字PCR经验丰富
QuantaLife 利用油包水微滴生成技术 开发了微滴式数字PCR技术,这也是**早出现的相对成熟的数字PCR平台,在运行成本和实验结果稳定性方面都基本达到了商品化的标准。2011年,QuantaLife 公司被Bio-Rad公司收购,其微滴式数字PCR仪产品更名为QX100型号仪继续在市场上销售,这个早期型号为dPCR概念的普及和应用领域的拓展发挥了重要作用。2013年该公司又推出了升级型号QX200。2012年,RainDance公司推出Raindrop型号数字PCR设备,这个设备将其原有的二代测序文库制备平台技术平移到数字PCR技术平台,在高压气体驱动下,将每个标准反应体系分割成包含100万至1000万个皮升级别微滴的反应乳液, 该公司的创始人之一Darren Link表示这种超高的微滴数目可以为用户“提供更高的检测动态范围,适用于处理更大浓度差异的不同样品”。准确数字PCR口碑推荐定量方法不依赖于扩增曲线的循环阈值。
外周血MicroRNA的***定量:人体体液中稳定可检测的miRNA的发现为其作为疾病生物标志物提供了新的可能性,但是它们的含量可能极低,在体液中也缺乏已知的内源性参考基因,这为每一项可靠的转化应用都提出了真正的挑战。利用数字PCR的***定量优势,可以解决缺乏内源性参考基因的问题。有研究者证实,基于EvaGreen的ddPCR技术可以给出溶液之中miRNA分子的精确数量,并且在低丰度的miRNA定量中有更好的准确度,在四个数量级的浓度范围内都有很好的重复性,能够在低至1拷贝/μl的水平上检测到一个拷贝的miRNA,这种性能完全超过了传统定量PCR的表现。由于ddPCR能够提供更好的重复性,实验室内部和实验室之间的结果具有直接可比性,这使得ddPCR成为microRNA研究中非常有潜力的一个技术。
数字PCR是一种新的核酸检测和定量方法,借助微液滴或微坑,通过单个模板分子的PCR扩增,可实现不依赖于标准曲线和参照样本的准确、***定量。数字PCR使得反应更灵敏、结果更可靠、展示更直观,尤其适用于微量或痕量DNA检测与定量。基因表达差异研究:数字PCR可以提供比实时荧光定量PCR更精确的基因差异表达研究,尤其对于那些靶基因表达差异微小的情况,如:mRNA、microRNA、lncRNAs等的表达分析;等位基因的不平衡表达;单细胞基因表达分析;外泌体核酸分子定量分析等。可以用于白血病融合基因检测。
单细胞的基因表达分析:基因表达分析有助于了解细胞和组织的特征及其如何应对发育和环境信号的改变。检测已知和未知基因转录水平的方法在过去的四十多年来发生了翻天覆地的变化,变得更加有效,更加敏感,定量更加精细,能够一次性对大量的基因转录本进行分析。但是,在组成复杂的细胞混合物中,尽管***表达的基因可以被识别出来,但来自于少数细胞群体(例如干细胞)的转录本却很可能会被掩盖掉,尤其是在每个细胞中以低丰度形式出现的转录本。为了解决这个问题,单细胞检测技术应用而生,而且逐渐受到了越来越多的重视。ddPCR在单细胞分析中的优势在于它不需要标准曲线就能进行***定量。而且,由于能够以非常高的敏感性区分至少五种不同的基因转录本,因此无需进行其他方法所要求的单细胞cDNA预扩增,这可以消除预扩增和NGS文库准备中潜在的转录本定量失真,能够能加真实的反映单细胞群体中关键基因的特征。对干扰分子(背景信号、PCR抑制剂等)耐受度高,通过信号的“有”“无”定量而不是Ct值。天津核酸拷贝数定量数字PCR欢迎咨询
目前有超过130万条经锁核酸修饰的引物,提供至少3种设计方案以满足不同跨外显子区域的检测需求。数字PCR经验丰富
值得注意的是,在gDNA长度≥20kb或进行拷贝数变异检测实验时,必须对样品进行酶切处理,确保大片段DNA序列或串联序列在酶切处理后,模板随机且均匀的进入**反应体系,以实现准确和精确的定量。数字PCR实验离不开包含有Mg2+、dNTP、Buffer和DNA聚合酶等PCR反应所需要的MasterMix。随着实验的不断深入,对于实验条件的要求也不断提高,其中DNA聚合酶对实验的准确性起着至关重要的作用。由于非热启动的DNA聚合酶在反应体系易使引物在室温条件下发生非特异性扩增,直接影响实验结果。数字PCR经验丰富