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数字PCR基本参数
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数字PCR企业商机

数字PCR可以直接计算目标序列的拷贝数,因此无需依赖于对照样品和标准曲线就可以进行精确的***定量检测;此外,由于数字PCR在进行结果判读时*判断有/无两种扩增状态,因此也不需要检测荧光信号与设定阈值线的交点,完全不依赖于Ct值的鉴定,因此数字PCR的反应受扩增效率的影响**降低,对PCR反应抑制物的耐受能力**提高;数字PCR实验中标准反应体系分配的过程可以极大程度上降低与目标序列有竞争性作用的背景序列浓度,因此数字PCR技术也特别适合在复杂背景中检测稀有突变。DNA聚合酶对实验的准确性起着至关重要的作用。北京数字PCR

*****的实时监控:已有数篇文章报道了使用数字PCR技术对患者***过程中的循环**DNA(ctDNA)进行检测,实时监控疾病进展。在非小细胞肺*、乳腺*和肠*等多种**患者中都取得了令人鼓舞的结果。与影像学及其他常规指标相比,ctDNA突变及丰度改变通常会提前数月出现,这样就可以提醒医生及时调整***方案,使患者得到更有效的***。无创产前筛查:唐氏综合征、地中海贫血或胎儿遗传性耳聋基因检测等,目前无创检测标本来源主要为孕妇血液,检测胎儿DNA会受到母体DNA的干扰,依靠数字PCR可提高检测准确性。对比NGS,数字PCR技术可以提高工作效率、降低检测成本。北京准确数字PCR口碑推荐基因丰度非常低的,或者样本浓度低的,可以选择数字化PCR。

微小残留病变(minimalresidualdisease,MRD):随着化疗、靶向***、造血干细胞移植等***方式的改进,血液**的***效果日益改善。微小残留病(MRD)导致的复发是目前血液*****的一大难题。动态监测MRD对于评价***疗效、预测疾病复发、实施个体化***具有重要的指导意义。MRD检测方法需满足可定量、标准化、便捷性的要求。目前**常见的是流式细胞学(flowcytometry,FCM)和PCR两大类,但只有灵敏度高于10-4才能被纳入标准化评估。数字PCR技术,其有限稀释的特点可降低复杂的背景干扰,浓缩低丰度目的基因信号,从而提高MRD检测的灵敏度。在慢性髓系白血病中,Wang等同时用dPCR和qPCR检测了61名CML患者的外周血,这些患者在每3个月一次连续3次的qPCR检测中,已经检测不到BCR-ABL,dPCR检测到18%的患者是阳性的。在随后的随访中,dPCR能比qPCR提前几个月检测到BCR-ABL的升高。在淋系白血病的BCL2-IGHMBR检测中,Drandi等在222例样本中验证了dPCR和qPCR方法的一致性,还成功地将dPCR应用于3例qPCR无法检测的病例。数字PCR作为目前灵敏度和准确性比较高的分子检测方法,非常适用于微小残留病变评估。

数字PCR技术的原理非常简单,然而在样品分散(divide)的环节上却遇到了无法突破的瓶颈。早期的dPCR尝试使用96孔板到384孔板甚至1536孔板作为分散反应的载体,或者采用类似流式技术的磁珠乳液扩增方法(BEAMing-Beads, Emulsion, Amplification, Magnetics),2006年 Fluidigm公司推出了***台商品化的基于芯片的商品化数字PCR系统。2008年德国 Inostics 推出基于磁珠法乳浊液扩增和流式检测方式的BEAMing dPCR 检测服务,但这些方法无论在分散程度和数据群体的体量上都无法达到更加精细的要求,时间和耗材成本严重限制了dPCR技术的发展。对引物的特异性要求高。

可以使用几种不同的方法来分配样品,包括微孔板,毛细管,油乳剂和带有核酸结合表面的小型化腔室阵列。样品的分配使人们可以通过假设分子种群遵循泊松分布来估计不同分子的数量,根据泊松分布的原理,反应体系中目标分子的拷贝数可以通过公式A=-ln[(N-X)/N]*N计算,从而解决了多个目标分子存在于单个液滴中的可能性。同时,从公式也可以看出,随着反应阳性体系数(X)的增加,体系中目标分子的拷贝数相对于X会有较大的差距,随着X的持续增加,数字PCR结果的不确定度也随着提高,总体来说,数字PCR阳性体系的数量不得超过总体系数量的80%。另一个方面,N的增加会使整个数字PCR体系具有较大的线性范围,并可以提高反应的灵敏度、稳定性以及可重复性。因此,目前dPCR都需要在成本可控的情况下,增加分配的腔室数和液滴数。对干扰分子(背景信号、PCR抑制剂等)耐受度高,通过信号的“有”“无”定量而不是Ct值。北京准确数字PCR口碑推荐

原始数据中往往发现阳性信号与阴性背景之间存在许多弱阳性信号。北京数字PCR

数字PCR的技术优势在SARS-CoV-2的核酸检测中得到了完整的体现,在低拷贝病毒样本检测、不同临床样本类型病毒载量定量、样本制备方法评估、病情进展动态监测、参考品制备、环境中病毒浓度监测、病毒突变检测和抗病毒药物评价多个方面均有重要作用:(1)在低拷贝病毒样本检测中,数字PCR相比COVID-19诊断金标准逆转录荧光定量PCR(RT-qPCR)具有更低的检测限和更高的灵敏度。(2)针对不同类型的COVID-19临床样本(如鼻咽拭子、痰液、血液、尿液、粪便、支气管肺泡灌洗液等),使用数字PCR能够有效评估各个类型样本的病毒载量,尽可能选择病毒载量**多的样本以提高检出率。(3)在样本制备方法评估中,利用数字PCR定量不同灭活方法处理前后样本中的病毒量,能够明确处理方法对样本的影响,从而为临床实验室提示比较好样本制备方法。(4)研究人员利用数字PCR定量患者不同时期的样本中的病毒载量,发现在早期和进展期的病毒载量明显高于恢复期的病毒载量,提示动态监测样本中的病毒载量有助于评估疾病的进展。北京数字PCR

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