荧光定量法(Methylight)
这种技术是在MSP技术上发展起来的,在MSP扩增过程中利用荧光染料进行定量。TaqMan? 探针法的应用使得该技术具有更高的精确性。其原理与SNP检测类似,针对亚硫酸氢盐处理之后的DN**段,在甲基化位点上会存在单碱基的差异,根据这种差异进行探针设计,随后进行实时定量PCR,就能够检测甲基化的差异。这种方法**的优势在于其高敏感性和较高通量,且无需在PCR后电泳、杂交等操作,减少了污染和操作误差。但是TaqMan? 探针订购费用较高,适用于少数位点大量样本筛选。 筛选耐药的相关biomaker及表观调控机制。重庆TBS技术服务经验丰富
DNA甲基化是在DNA甲基化转移酶(Dnmt)的作用下将甲基选择性地添加到胞嘧啶上形成5-胞嘧啶的过程,刚被发现时被定义为第五种碱基,实际上它是一种重要的表观遗传学标记,在调控基因表达、维持染色质结构、基因印记、X染色体失活以及胚胎发育等生物学过程中发挥着重大的作用,它就像魔术师手中一顶**神奇的“帽子”,带给世人层出不穷的惊喜。DNA甲基化的发生、保持和去除都处在生物体精细的调控中,一旦发生紊乱,对于动物而言将导致胚胎死亡或者**等重大疾病,对于植物而言将会出现各种的表型缺陷,那么这顶神奇的“帽子”是如何发挥它神奇功用的呢?这个问题成为整个生物界**热的研究焦点之一。研究者们从DNA甲基化的发生机制,保持机制到去甲基化机制,从基因组甲基化状况研究到特异位点甲基化状况研究,从**初CpG位点的研究到non-CpG位点的研究,从高甲基化研究到低甲基化、未甲基化研究,以及与其密切相关的羟甲基化也慢慢进入人们的视野,***多角度解析DNA甲基化。在Nature、Science、Cell等**杂志上经常能看到它熟悉的身影,说它是生物学研究的“宠儿”一点都不为过。正所谓“工欲善其事,必先利其器”。 北京WGBS技术服务方案850K芯片为半金标准,价格低,分析简单,较为适合EWAS类型的课题。
GOS2基因靶向甲基化测序确定了一种快速复发、常规致死的肾上腺皮质*亚型
Targeted Assessment of G0S2
Methylation Identifies a Rapidly Recurrent, Routinely Fatal Molecular Subtype
of Adrenocortical Carcinoma. Clin Cancer Res. 2019; 25(11):3276-3288.
(IF= 10.199)
研究者分析了ACC-TCGA数据,在114例肾上腺皮质**的**队列中鉴定了一个在CIMP高ACC中***被高甲基化并沉默的基因G0S2,并通过高通量BSP得到验证。G0S2基因CpG岛高甲基化**预测不良临床后果,是ACC快速复发或致死的标志。评估G0S2甲基化对临床决策是直接可行的,并有助于对侵袭性ACC进行有效辅助***。
industryTemplate在正常组织里, 70%到90%散在的CpG是被甲基修饰的。
发育基因的表观突变是养殖欧洲鲈鱼开始驯化的基础
Epimutations in developmental
genes underlie the onset of domestication in farmed European sea bass. Mol Biol Evol. 2019 May 30 (IF= 14.797)
本研究通过RRBS测序,比较了早期驯化的
(n=12)与野生的(n=12)
欧洲鲈鱼在驯化过程中DNA甲基化变化,发现早期驯化的鲈鱼与野生的没有遗传差异,但在不同胚胎起源的组织中发生DNA甲基化变化。这些甲基化突变与经过25年选择性育种后的胞嘧啶至胸腺嘧啶多态性***重叠,表观突变基因与正选择基因一致。结果表明驯化初始阶的表观变异是一个重要事件。 焦磷酸测序技术是甲基化检测新的金标准。北京焦磷酸测序技术服务
ChIP-Seq 能实现真正的全基因组分析。重庆TBS技术服务经验丰富
焦磷酸测序(Pyrosequencing)随着技术的不断改进,现在认为焦磷酸测序技术(Pyrosequencing)是甲基化检测新的金标准。焦磷酸测序作为一种新的序列分析技术,能够快速地检测甲基化的频率,对样品中的甲基化位点进行定性及定量检测,为甲基化研究提供了新的途径。在序列延伸过程中,根据C和T的掺入量来定量确定单个位点的C-T比例。因此,不同位点的甲基化变异就能被准确检测,并给出精确的甲基化程度的数据。QIAGEN公司在焦磷酸测序的应用上具有明显的优势,目前提供三种焦磷酸测序仪器,通量由低到高,适合不同的应用。PyroMarkQ24的强项在于可对多达24个样品进行焦磷酸测序。需要大样品量的应用更适合在PyroMarkQ96ID上进行。在考虑到处理成百上千个样品所需的大量试剂时,运行通量**化可能会使实验成本变得很高。而PyroMarkQ96MD装有一台高度灵敏的光检测摄像头,可以在减少试剂量的情况下对少量的DNA模板进行准确测序。这些不同平台的推出,对于我们实际研究提供了更有效的检测手段。 重庆TBS技术服务经验丰富