重庆RIP-seq技术服务经验丰富

    Agilent甲基化芯片通过SurePrint芯片合成**技术，结合优化的探针设计及实验方法，可灵活进行甲基化研究，得到高灵敏度、高特异性、高重复性的结果。技术流程：1.将基因组DNA超声打断成400-500bpDN**段；2.加热变性并将变性后的单链DNA样品分成两份；3.其中一份单链DNA样品加入抗5'-甲基化胞嘧啶核苷抗体。使用免疫磁珠法分离样品中甲基化DN**段的抗体复合物，样品中其余的非甲基化DN**段被洗脱；4.纯化免疫共沉淀的DN**段；对MeDIP(Cy5)与Input(Cy3)样品分别进行标记；5.标记后的MeDIP与Input样品混合、变性，与芯片杂交；6.检测杂交信号并进行数据分析。芯片种类：Agilent**甲基化芯片，8x60K●和合作伙伴在Agilent公司定制的Promoter芯片。●绝大多数基因是针对基因启动子区域的CpG岛设计探针。●芯片上一共有4160个功能注释比较明确的基因，其中2128个和**发生有关系。●从功能上分，有256基因和细胞凋亡有关，1273个基因和信号传导有关，487个基因和压力和衰老有关。●特别适用于**甲基化研究。 芯片平台作为目前比较成熟的筛选工具。重庆RIP-seq技术服务经验丰富

发育基因的表观突变是养殖欧洲鲈鱼开始驯化的基础

Epimutations in developmental

genes underlie the onset of domestication in farmed European sea bass. Mol Biol Evol. 2019 May 30 (IF= 14.797)

本研究通过RRBS测序，比较了早期驯化的

(n=12)与野生的(n=12)

欧洲鲈鱼在驯化过程中DNA甲基化变化，发现早期驯化的鲈鱼与野生的没有遗传差异，但在不同胚胎起源的组织中发生DNA甲基化变化。这些甲基化突变与经过25年选择性育种后的胞嘧啶至胸腺嘧啶多态性***重叠，表观突变基因与正选择基因一致。结果表明驯化初始阶的表观变异是一个重要事件。 陕西RIP-seq技术服务口碑推荐5hmc是发现的一种修饰碱基，成为哺乳动物的“第六碱基”。

    大豆驯化和改良过程中的DNA甲基化足迹(1):128.(IF=)本课题通过WGBS技术比较了野生大豆、地方品种和改良品种(n=45)在大豆驯化与改良过程中DNA甲基化的变化，鉴定了5412个甲基化差异区域(DMR),而这些DMR基因富集在碳水化合物代谢途径。这为大豆不同品种间DNA甲基化提供了有价值的图谱，拓展了大豆驯化与改良的认识。血浆DNA甲基化分析提示EBV病毒相关疾病的病因(1):3256(IF=)本研究通过对鼻咽*(NPC,n=15)、EBV相关性淋巴瘤(n=9)和传染性单核细胞增多症患者(n=5)的血浆游离DNA进行WGBS测序分析，发现EBVDNA甲基化图谱呈现疾病相关模式。这表明在鼻咽*诊断中进行血浆EBVDNA甲基化分析具有重要的潜力。

    cfDNABS-Seq送样要求一、送样类型分离好的血浆二、保存方式分离后的血浆，用ml离心管分装，例如：1ml/管；放-20℃冰箱中保存（短暂保存，1-2周）；放-80℃冰箱中长期保存(1年以内)；保存期间不能冻融。三、运输条件干冰运输：顺丰陆运（3-4天时间），夏季10-15公斤干冰；秋冬季10公斤干冰四、抽血要求1、使用Streck**管（不建议使用普通的EDTA-钠抗凝管），采集10ml外周静脉血（客户没有Streck**管，公司配送）；2、室温或者放置4℃冰箱中半小时以上，不超过8小时，进行血浆分离步骤五、血浆分离步骤1、4℃条件下以1600g离心10min，离心后将上清（血浆）分装到2、4℃条件下以16000g离心10min去除残余细胞，将上清移入新的离心管中，每管分装1ml;3、血浆样本存放于-80℃冰箱中保存;使用干冰运输,提取之前不能冻融。备注1：血浆分离在4℃条件进行，如果客户没有冷冻离心机，也可以在室温条件下进行；备注2：离心后取血浆上清，避免吸取白细胞；通常10ml全血可以获得4-5ml血浆。 ChIP-Seq 能实现真正的全基因组分析。

GOS2基因靶向甲基化测序确定了一种快速复发、常规致死的肾上腺皮质*亚型

Targeted Assessment of G0S2

Methylation Identifies a Rapidly Recurrent, Routinely Fatal Molecular Subtype

of Adrenocortical Carcinoma. Clin Cancer Res. 2019; 25(11):3276-3288.

(IF= 10.199)

研究者分析了ACC-TCGA数据，在114例肾上腺皮质**的**队列中鉴定了一个在CIMP高ACC中***被高甲基化并沉默的基因G0S2，并通过高通量BSP得到验证。G0S2基因CpG岛高甲基化**预测不良临床后果，是ACC快速复发或致死的标志。评估G0S2甲基化对临床决策是直接可行的，并有助于对侵袭性ACC进行有效辅助***。 N6-甲基脱氧腺苷是原核生物和真核生物的DNA修饰类型之一。陕西RIP-seq技术服务口碑推荐

焦磷酸测序能提供杂合子缺失及细菌和病毒分型等技术服务。重庆RIP-seq技术服务经验丰富

安捷伦公司芯片平台因其强大的eArray探针设计平台，可以进行芯片的定制。在甲基化领域同样适用。合作伙伴利用Agilent芯片平台设计了一款专门针对**启动子区域CpG岛的甲基化芯片。绝大多数基因是针对基因的启动子区域的CpG岛设计探针。这款芯片上一共有4160个功能注释比较明确的基因，其中2128个和**发生有关系。从功能上分，有256基因和细胞凋亡有关，1273个基因和信号传导有关，487个基因和压力和衰老有关。采用的是8*60K的芯片格式。利用MeDIP原理进行甲基化检测的方法探针的分辨率可以精确到100 bp。重庆RIP-seq技术服务经验丰富