自从引入了细菌的基因组学分析以来,针对微生物的研究已经产生**性变化。16SrDNA测序和宏基因组测序两种测序方法,常用于评估微生物组成机器相对丰度。16S测序可以以可变区域周围的稳定区域为八项来检测细菌基因组中高变异度区域的差异。这一技术的主要缺陷在于无法分辨种群之间的差异,因为这种差异通常很小。相反地,宏基因组测序能够实时检测所有生物的全基因组,这也造成针对意志和位置的微生物检测的精度增加。本章阐述了与心血管疾病相关的肠道微生物组成的变化。肠道菌群检测的流程。上海粪便菌群检测科研助力
苯丙氨酸、色氨酸和酪氨酸是芳香族氨基酸,可影响免疫、代谢和神经反应。苯丙氨酸是一种必需氨基酸,是酪氨酸的前体,可以进一步转化合成神经递质、去甲肾上腺素和肾上腺素。色氨酸也是一种必需氨基酸,是神经递质血清素的前体。晚期CVD患者的血浆中,微生物的色氨酸代谢物降低。近期一项研究表明,苯丙氨酸及酪氨酸的肠道菌群代谢物可能与大鼠心梗的严重程度有关。今后,对于这些芳香族氨基酸代谢物与心血管疾病之间的联系仍需要进一步深入研究。安徽粪便菌群检测临床应用肠道菌群检测有重大意义。
NatureReviewsRheumatology近日发表了一篇关于“肠-关节”轴的综述文章,总结了目前对于“菌群-关节炎”的大量研究。文章指出,肠道菌群组成的改变在许多类风湿关节炎(RA)患者以及处于潜伏期的患者中都存在;“菌群-关节炎”致病假说指出,关节炎由肠道黏膜免疫和异常的局部菌群相互作用,进而过渡到滑膜及关节部位所引起,同时,RA患者以及关节炎小鼠模型都伴随着肠道通透性增加、炎症细胞增加、有益菌丰度降低、肠-肌腱细胞的迁移等表型,抗风湿药能明显改善RA患者肠道菌群的失衡。因此,靶向肠道、菌群及代谢物,改善肠黏膜通透性和调控炎症细胞的迁移都可能成为有潜力的治疗方案。
约50%的类风湿关节炎(RA)患者对甲氨蝶呤改善不产生充分的应答,但缺乏可预测患者应答的预后标志物。Arthritis and Rheumatology上发表的一项研究,对比分析了对甲氨蝶呤改善应答及不应答的RA患者在改善前的肠道菌群差异,发现基于菌群建立的模型可较准确地预测患者对甲氨蝶呤改善的应答。另外,体外共培养肠道菌群与甲氨蝶呤的结果表明,肠道菌群对甲氨蝶呤的代谢或消失可能抑制甲氨蝶呤的改善效果。①纳入26名新发RA患者,16名对甲氨蝶呤改善不应答;②应答患者与不应答患者的粪便菌群多样性、组成及功能存在差异;③不应答患者的菌群多样性更高,厚壁菌门/拟杆菌门比值增加,广古菌门丰度升高,MAPK信号、DNA复制、脂肪酸降解、嘌呤代谢等相关通路明显富集;④在另外21名新发RA患者中,基于菌群的模型可较准确地预测对甲氨蝶呤改善的应答(AUC=0.84);⑤体外共培养患者的粪便菌群与甲氨蝶呤,培养后的甲氨蝶呤水平与患者应答明显相关。肠道菌群检测:对抗消化道疾病新武器。
强直性脊柱炎患者的肠道菌群组成及细菌表位变化:①纳入127名强直性脊柱炎(AS)患者与123名健康人,对粪便菌群进行宏基因组测序;②鉴定出7个菌种在AS患者与健康人中有明显差异,在菌株水平未发现AS患者与健康人的明显差异;③抗TNF改善与AS患者的菌群变化(患者失调的菌群更趋近于健康人,包括一些与AS相关的菌种)相关;④AS患者粪便中可检测到特定细菌表位(与HLA-B27呈递的表位相似)的富集,抗TNF改善与这些潜在交叉反应性细菌表位的减少相关。肠道菌群检测的临床指导意义。上海粪便菌群检测科研助力
如何检测肠道菌群的差异性?上海粪便菌群检测科研助力
菌群在风湿病及其它自身免疫疾病的发展中发挥重要作用。AnnalsoftheRheumaticDiseases上发表的一篇综述文章,介绍了一些在风湿病及自身免疫疾病领域中的标志性菌群研究,并讨论了风湿病相关菌群研究中存在的机会与挑战,展望了将菌群研究应用于风湿病诊疗中的未来可能。①肠道菌群是触发和驱动自身免疫疾病必需的,自身免疫疾病患者的肠道菌群多样性降低,拟杆菌属等减少,共生致病菌(梭杆菌属等)升高;②药物微生物组学可改善风湿病药物的选择;③通过饮食、益生菌/元等间接调节菌群或可改善风湿病,例如地中海饮食可能对类风湿关节炎有益,益生元可能缓解脊柱关节炎;④通过粪菌移植直接调节菌群也可能改善风湿病,但目前还缺乏决定性证据;⑤菌群研究有助于风湿病和自身免疫性疾病的精细改善。上海粪便菌群检测科研助力
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